SKELETONIZATION OF CRYO-EM DENSITY MAPS
冷冻电镜密度图的骨架化
基本信息
- 批准号:7357808
- 负责人:
- 金额:$ 1.51万
- 依托单位:
- 依托单位国家:美国
- 项目类别:
- 财政年份:2005
- 资助国家:美国
- 起止时间:2005-12-01 至 2006-11-30
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. The subproject and investigator (PI) may have received primary funding from another NIH source, and thus could be represented in other CRISP entries. The institution listed is for the Center, which is not necessarily the institution for the investigator. We aim to develop a novel framework for the simultaneous identification of both alpha-helices and beta-sheets in intermediate resolution (10-5 ¿) density maps. In addition to the detection of secondary structure elements, both confidence measures and topology are addressed, resulting in a simple yet comprehensive tool for analyzing, visualizing and annotating density maps.
本子项目是利用由NIH/NCRR资助的中心赠款提供的资源的众多研究子项目之一。子项目和研究者(PI)可能已经从另一个NIH来源获得了主要资金,因此可以在其他CRISP条目中表示。列出的机构是中心的,不一定是研究者的机构。我们的目标是开发一种新的框架,用于在中等分辨率(10-5¿)密度图中同时识别α -螺旋和β -片。除了二级结构元素的检测外,还解决了置信度措施和拓扑结构,从而形成了一个简单而全面的工具,用于分析,可视化和注释密度图。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
MARC L BAKER其他文献
MARC L BAKER的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('MARC L BAKER', 18)}}的其他基金
相似国自然基金
棉花纤维素合酶CesA的Cryo-EM结构和功能解析
- 批准号:
- 批准年份:2021
- 资助金额:59 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Cryo-EM studies of a metazoan replisome captured ex vivo during elongation and termination
在延伸和终止过程中离体捕获的后生动物复制体的冷冻电镜研究
- 批准号:
BB/Y006232/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Research Grant
Cryo-EM studies of a metazoan replisome captured ex vivo during elongation and termination
在延伸和终止过程中离体捕获的后生动物复制体的冷冻电镜研究
- 批准号:
BB/Y006151/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Research Grant
MFB: Evaluating and Advancing Cryo-EM for RNA Conformational Ensembles
MFB:评估和推进 RNA 构象整体的冷冻电镜
- 批准号:
2330652 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Standard Grant
Deep Learning for 3-D reconstruction of heterogeneous molecular structures from Cryo-EM data
利用冷冻电镜数据进行异质分子结构 3D 重建的深度学习
- 批准号:
BB/Y513878/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Research Grant
Cryo-EMによるABCB1トランスポーターの非特異的な多剤排出のメカニズムの解明
通过冷冻电镜阐明 ABCB1 转运蛋白非特异性多药流出机制
- 批准号:
23K19426 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
Structural analysis of V-ATPase by cryo-EM
通过冷冻电镜对 V-ATP 酶进行结构分析
- 批准号:
22KJ2042 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Understanding the rules of sample preparation for single particle cryo-EM
了解单颗粒冷冻电镜的样品制备规则
- 批准号:
BB/X007227/1 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Research Grant
Structural study of biological membranes by Cryo-EM
利用冷冻电镜研究生物膜的结构
- 批准号:
23H02439 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Study of dynamic three-dimensional structure of pathogenic bacterial pili and its host cell adhesion mechanism by X-ray structure and cryo-EM
X射线结构和冷冻电镜研究病原菌菌毛动态三维结构及其宿主细胞粘附机制
- 批准号:
23K04944 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
How does the Scar/WAVE complex control actin protrusions and cell migration? A combined cell biology and cryo-EM approach.
Scar/WAVE 复合物如何控制肌动蛋白突出和细胞迁移?
- 批准号:
MR/X000702/1 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 1.51万 - 项目类别:
Research Grant