Biostatistics/Bioinformatics Core

生物统计学/生物信息学核心

基本信息

  • 批准号:
    7976120
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 9.38万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2010
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2010-07-01 至 2015-06-30
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

The Biostatistics & Bioinformatics Core will support investigators of the SPORE in Soft Tissue Sarcoma in the computational and statistical aspects of their research efforts, including the design and analysis of clinical trials, laboratory experiments, molecular profiling, and sequencing, as well as integrated genomic analyses. In the clinical trial design phase, a core member will conduct a protocol review with the principal investigator. Based on this review, a statistical section for the protocol will be provided, outlining major scientific objecfives, population to be studied, primary and secondary endpoints, experimental design, analysis plans, and a targeted sample size justified in probabilisfic terms. At the conclusion of the trial, data analyses will be performed to assess outcomes of the primary and secondary endpoints stated in the protocol. In preclinical studies, core members will assist in the formulation of the experimental design and in the analysis and interpretafion of the data at the conclusion of the study. The core will also assist in the large-scale molecular characterizafion of human sarcoma samples, which involves analyzing RNA expression, microRNA expression, mutafions, and DNA copy number changes to identify predictors of tumor characterisfics, drug repsonse, and survival. Core members will use two-sample t-tests and Cox proportional hazards models to identify informafive features. The different types of molecular data will be integrated and pathway analysis performed to elucidate the pathways that contribute to tumorigenesis and tumor phenotype. Risk predicfion tools will be developed using Cox proportional hazards models based on these features
生物统计学和生物信息学核心将支持软组织肉瘤中孢子的研究者 其研究工作的计算和统计方面,包括临床的设计和分析 试验,实验室实验,分子分析和测序以及综合基因组分析。 在临床试验设计阶段,核心成员将与首席研究员进行协议审查。 基于此评论,将提供该协议的统计部分,概述了主要的科学 Objecfives,要研究的人群,主要和次要终点,实验设计,分析计划, 和有针对性的样本量以概率为合理的术语。在试验结束时,数据分析将是 进行的以评估协议中所述的主要和次要终点的结果。在临床前 研究,核心成员将协助制定实验设计和分析和 研究结束时数据解释。核心还将有助于大规模分子 人类肉瘤样品的特征,涉及分析RNA表达,microRNA 表达,变异和DNA拷贝数变化以识别肿瘤特征的预测指标,药物 回顾和生存。核心成员将使用两样本t检验和COX比例危害模型 确定信息功能。不同类型的分子数据将集成和途径分析 进行阐明有助于肿瘤发生和肿瘤表型的途径。风险预测 工具将使用基于这些功能的COX比例危害模型开发

项目成果

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