Shared Resource Core

共享资源核心

基本信息

  • 批准号:
    10007612
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 14.88万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
  • 财政年份:
    2010
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2010-09-28 至 2021-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Summary: Proper study design, data generation, and analysis of complex datasets drawn from population- and molecular-level studies are crucial for the advancement of population and basic science research. To facilitate this, the Partnership proposes to provide the necessary infrastructure for these activities through the Research Design and Analysis Core (RDAC) and the Genomics Core (GC), collectively described as the Shared Resource Core (SRC). The RDAC aims to 1) support quantitative activities involving collection of original data at different levels – from individuals/patients to organizations and communities; 2) provide training in the design, implementation and analysis of population science research to U54 participants and members of the UMass Boston and DF/HCC communities at all academic levels; 3) assist with appropriate experimental design and statistical analysis of data acquired from laboratory- or clinically-based studies; and 4) serve as a catalyst for new collaborations between investigators at UMass Boston and DF/HCC partner sites. The RDAC builds upon and synergizes existing Centers/Cores at UMass Boston and DF/HCC. Similarly, the Partnership has created the Genomics Core by leveraging genomics services offered by the newly created Center for Personalized Cancer Therapy (CPCT) at UMass Boston. The GC uses state-of-the-art instrumentation and data analysis methodologies and aims to provide U54 partners and investigators with accessible research support platforms to facilitate high-impact genomics-based translational cancer research and basic science research. Together, the RDAC and GC Shared Resource Core constitutes the framework to provide population and genomics-based basic science studies with proper study design, data acquisition, and data analysis across a broad spectrum of 'Cells to Society' research. The SRC will be utilized by all proposed research projects in this application (see Pilot and Full Project sections). Specifically, the Schrag/Lindsay population science project will utilize the RDAC to provide consultation in survey development and oversight of necessary pretesting of English and Spanish-language survey measures, database development, data entry and data analysis. Dr. Lindsay and the RDAC will work together to provide U54 trainees with intensive training in focus group procedures, e.g., creation of an interview guide, focus group moderation and qualitative analysis, and qualitative data coding. The RDAC will also be utilized by the Kulkarni/Zarringhalam/Pandolfi basic science project to provide assistance with quantitation and statistical analysis of the isogenic WT and DICER mutant HCT116 carcinoma cell studies and siRNA-mediated ceRNA knock-down studies. The GC will be utilized by the Siegfried/Sweeney/Van Allen basic science project to generate sequencing data and provide bioinformatics analysis of sequencing data to call somatic point mutations, short insertion/deletions, and copy number changes from the exomes. Going forward, the SRC will be heavily used by Partnership incubator projects to complete preliminary studies towards consideration of support as future U54 Pilot or Full Projects.
摘要:对从人口中提取的复杂数据集进行适当的研究设计、数据生成和分析 分子水平的研究对推进人口和基础科学研究至关重要。至 为了促进这一点,伙伴关系建议通过以下方式为这些活动提供必要的基础设施 研究设计和分析核心(RDAC)和基因组学核心(GC),统称为 共享资源核心(SRC)。RDAC的目标是1)支持量化活动,包括收集 不同级别的原始数据-从个人/患者到组织和社区;2)提供培训 在为U54参与者和U54成员设计、实施和分析人口科学研究时 马萨诸塞州大学波士顿分校和DF/HCC社区的所有学术级别;3)协助适当的实验 设计和统计分析从实验室或临床研究中获得的数据;以及4)作为 促进波士顿大学和明尼苏达大学/肝细胞癌合作伙伴网站的研究人员之间的新合作。RDAC 在马萨诸塞州大学波士顿分校和DF/HCC现有中心/核心的基础上进行构建和协同。同样,伙伴关系 通过利用新成立的中心提供的基因组学服务,创建了基因组核心 波士顿大学的个性化癌症治疗(CPCT)。GC使用最先进的仪器和 数据分析方法,旨在为U54合作伙伴和调查人员提供可访问的研究 支持平台,促进基于基因组学的高影响力转化型癌症研究和基础科学 研究。RDAC和GC共享资源核心共同构成了提供人口的框架 以及以基因组学为基础的基础科学研究,具有适当的研究设计、数据获取和数据分析 通过广泛的“细胞到社会”研究。所有拟议的研究都将利用SRC 此应用程序中的项目(请参阅试验和完整项目部分)。具体地说,施拉格/林赛人口 科学项目将利用RDAC在调查开发和必要的监督方面提供咨询 英语和西班牙语调查措施、数据库开发、数据录入和数据的预试 分析。Lindsay博士和RDAC将共同为U54学员提供重点强化培训 小组程序,例如,创建访谈指南、焦点小组协调和定性分析;以及 定性数据编码。库尔卡尔尼/扎林哈拉姆/潘多尔菲基础科学也将利用RDAC 协助量化和统计分析WT和DICER等基因突变的项目 HCT116癌细胞研究和siRNA介导的Cerna敲除研究。GC将由以下人员使用 齐格弗里德/斯威尼/范·艾伦的基础科学项目,以生成测序数据并提供生物信息学 对调用体细胞点突变、短插入/缺失和拷贝数的测序数据进行分析 与外星人的变化。展望未来,合作伙伴孵化器项目将大量使用SRC来 完成初步研究,以考虑将支助作为未来的U54试点项目或全面项目。

项目成果

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专利数量(0)

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  • 发表时间:
    2001
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Jill A. Macoska
  • 通讯作者:
    Jill A. Macoska

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    2014
  • 资助金额:
    $ 14.88万
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  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 14.88万
  • 项目类别:
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  • 批准号:
    10264807
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  • 资助金额:
    $ 14.88万
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  • 批准号:
    8738645
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 14.88万
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  • 批准号:
    8486921
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 14.88万
  • 项目类别:
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  • 批准号:
    8453755
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    2012
  • 资助金额:
    $ 14.88万
  • 项目类别:
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  • 批准号:
    8150959
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 14.88万
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Role of Prostatic Fibrosis in BPH/LUTS Development & Symptomology
前列腺纤维化在 BPH/LUTS 发展中的作用
  • 批准号:
    8049846
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
Genomics Core
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    10490401
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    2010
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Genomics Core
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    2010
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    FL210100071
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    22K02974
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 14.88万
  • 项目类别:
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  • 批准号:
    10674711
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 14.88万
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    2022
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  • 批准号:
    10431468
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 14.88万
  • 项目类别:
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