An Automated Platform for the CE-MS Analysis of Glycosaminoglycans

项目摘要/摘要： -- 该项目还将为该项目开发一个自动化的毛细管电泳质谱联用分析平台。 对糖胺多聚糖低聚物混合物的结构分析表明，它们在蛋白质和结合分析中是分离出来的。 碳水化合物的种类在所有动物体内细胞的表面都能找到，它们在许多重要的生物中起着关键的作用。 生物合成过程。糖胺多聚糖是一种线形的、多硫化的共聚物，通常伴随着一种重复的过程。 双糖单元由N-乙酰-己糖胺和葡糖醛酸组成，其含量不能超过200个重复。 装置很长。这些修改不能发生在产业链上的任何地方，包括O-硫化、N-硫化 糖醛酸的脱乙酰基/N-硫化、去乙酰化、去异构化和异构化，这些都是一种特别具有挑战性的方法。 由于它们的非均质结构不同，化合物需要更好地表征它们，而不是它们的非模板的最终结果。 生物合成。然而，在较长的葡聚糖链范围内，缺乏针对其靶点的定义或修饰的区域。 特定的蛋白质具有显著的生物特异性，这些糖蛋白和蛋白质之间的相互作用是研究生物多样性的重要基础。 糖胺多聚糖的活性。目前迫切需要一些工具来帮助找到这些有组织的、具有长远意义的区域。 葡聚糖链、链、链和链，以确定其基因修饰的模式。*少数几个专门的基因实验室已经开发出来。 质谱学和方法是研究糖胺多聚糖的结构分析方法，但这些方法在他们的研究中还没有被发现。 进入这些生物实验室的方法目前还很普遍。这个项目的主要目标是建立一个高度自动化的技术平台。 自动化是如此之快，以至于它也可以被部署在生物和研究人员的实验室中。这些实验室的无障碍环境。 先进的质谱学方法将是我们在硬件、软件、技术和方法方面的创新的结果。 发展。

Project Summary/Abstract    This project will develop an automated capillary electrophoresis-­tandem mass spectrometry platform for the  structural analysis of mixtures of glycosaminoglycan oligomers that are isolated in protein binding assays. This  class of carbohydrates can be found on the surface of all animal cells, and play a key role in many important  biological processes. Glycosaminoglycans are linear, polysulfated copolymers, typically with a repeating  disaccharide unit composed of an N-­acetyl-­hexosamine and glucuronic acid, and can be more than 200 repeat  units long. Modifications can occur anywhere along the chain, and these include O-­sulfation, N-­ deacetylation/N-­sulfation, and epimerization of the uronic acid. These are a particularly challenging class of  compounds to characterize due to their heterogeneous structures, an outcome of their non-­template  biosynthesis. Nevertheless, within the long glycan chains are short regions of defined modification that target  specific proteins with remarkable specificity. These glycan-­protein interactions are the basis for the biological  activity of the glycosaminoglycan. There is a critical need for tools to find these organized regions with the long  glycan chain, and to determine their pattern of modification. A few specialized laboratories have developed  mass spectrometry methods for the structural analysis of glycosaminoglycans, but these have not found their  way into biological laboratories at large. The goal of this project is to produce a platform with a high degree of  automation so that it can be deployed in the laboratories of biology researchers. The accessibility of these  advanced mass spectrometry methods will result from innovations in hardware, software, and methods  development.