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Accurate and efficient software tools for de novo assembly of long, error-rich DNA sequence reads using spaced seeds and local de Bruijn graphs

Accurate and efficient software tools for de novo assembly of long, error-rich DNA sequence reads using spaced seeds and local de Bruijn graphs
准确高效的软件工具，可使用间隔种子和局部 de Bruijn 图从头组装长且富含错误的 DNA 序列读数
批准号：
490417-2016
负责人：
Chu, Justin
金额：
$2.55万
依托单位：
University of British Columbia
依托单位国家：
加拿大
项目类别：
Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Doctoral
财政年份：
2016
资助国家：
加拿大
项目状态：
已结题
起止时间：
2016-01-01 至 2017-12-31
来源：
https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=601416
关键词：
Accurateefficientsoftwaretoolsde

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Improving the representation of microbial reference genomes using pangenome reference sequence graphs - Methods for efficient construction and representation of pangenome graphs for microbial data
  • 批准号：
    557997-2021
  • 项目类别：
    Postdoctoral Fellowships
  • 资助金额：
    $1.64万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    Chu, Justin
  • 依托单位：
    Dana-Farber Cancer Institute
Improving the representation of microbial reference genomes using pangenome reference sequence graphs - Methods for efficient construction and representation of pangenome graphs for microbial data
  • 批准号：
    557997-2021
  • 项目类别：
    Postdoctoral Fellowships
  • 资助金额：
    $1.64万
  • 财政年份：
    2020
  • 负责人：
    Chu, Justin
  • 依托单位：
    Dana-Farber Cancer Institute
Accurate and efficient software tools for de novo assembly of long, error-rich DNA sequence reads using spaced seeds and local de Bruijn graphs
  • 批准号：
    490417-2016
  • 项目类别：
    Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Doctoral
  • 资助金额：
    $2.55万
  • 财政年份：
    2018
  • 负责人：
    Chu, Justin
  • 依托单位：
    University of British Columbia
Accurate and efficient software tools for de novo assembly of long, error-rich DNA sequence reads using spaced seeds and local de Bruijn graphs
  • 批准号：
    490417-2016
  • 项目类别：
    Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Doctoral
  • 资助金额：
    $2.55万
  • 财政年份：
    2017
  • 负责人：
    Chu, Justin
  • 依托单位：
    University of British Columbia
国内基金
海外基金
固定参数可解算法在平面图问题的应用以及和整数线性规划的关系
  • 批准号：
    60973026
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    32.0万元
  • 批准年份：
    2009
  • 负责人：
    鲁道夫
  • 依托单位：
    复旦大学