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Improving the representation of microbial reference genomes using pangenome reference sequence graphs - Methods for efficient construction and representation of pangenome graphs for microbial data

Improving the representation of microbial reference genomes using pangenome reference sequence graphs - Methods for efficient construction and representation of pangenome graphs for microbial data
使用泛基因组参考序列图改善微生物参考基因组的表示 - 微生物数据的泛基因组图的有效构建和表示方法
批准号：
557997-2021
负责人：
Chu, Justin
金额：
$1.64万
依托单位：
Dana-Farber Cancer Institute
依托单位国家：
加拿大
项目类别：
Postdoctoral Fellowships
财政年份：
2020
资助国家：
加拿大
项目状态：
已结题
起止时间：
2020-01-01 至 2021-12-31
来源：
https://www.nserc-crsng.gc.ca/ase-oro/Details-Detailles_eng.asp?id=706642
关键词：
Improvingrepresentationmicrobialreferencegenomes

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Bioinformatics, Sequence analysis, Data structures, Algorithms, Pangenome sequence graphs, Coloured de Bruijn graphs, Genome assembly, Microbial genomics, Metagenomics, Microbial Genome Evolution
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Improving the representation of microbial reference genomes using pangenome reference sequence graphs - Methods for efficient construction and representation of pangenome graphs for microbial data
  • 批准号：
    557997-2021
  • 项目类别：
    Postdoctoral Fellowships
  • 资助金额：
    $1.64万
  • 财政年份：
    2021
  • 负责人：
    Chu, Justin
  • 依托单位：
    Dana-Farber Cancer Institute
Accurate and efficient software tools for de novo assembly of long, error-rich DNA sequence reads using spaced seeds and local de Bruijn graphs
  • 批准号：
    490417-2016
  • 项目类别：
    Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Doctoral
  • 资助金额：
    $2.55万
  • 财政年份：
    2018
  • 负责人：
    Chu, Justin
  • 依托单位：
    University of British Columbia
Accurate and efficient software tools for de novo assembly of long, error-rich DNA sequence reads using spaced seeds and local de Bruijn graphs
  • 批准号：
    490417-2016
  • 项目类别：
    Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Doctoral
  • 资助金额：
    $2.55万
  • 财政年份：
    2017
  • 负责人：
    Chu, Justin
  • 依托单位：
    University of British Columbia
Accurate and efficient software tools for de novo assembly of long, error-rich DNA sequence reads using spaced seeds and local de Bruijn graphs
  • 批准号：
    490417-2016
  • 项目类别：
    Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Doctoral
  • 资助金额：
    $2.55万
  • 财政年份：
    2016
  • 负责人：
    Chu, Justin
  • 依托单位：
    University of British Columbia
国内基金
海外基金
稀疏表示及其在盲源分离中的应用研究
  • 批准号：
    61104053
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    23.0万元
  • 批准年份：
    2011
  • 负责人：
    杨祖元
  • 依托单位：
    广东工业大学
约化群GL(n, F)的表示－－F是非阿基米德局部域
  • 批准号：
    10701034
  • 项目类别：
    青年科学基金项目
  • 资助金额：
    18.0万元
  • 批准年份：
    2007
  • 负责人：
    覃瑜君
  • 依托单位：
    华东师范大学
信号盲处理的稀疏表示方法
  • 批准号：
    60475004
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    23.0万元
  • 批准年份：
    2004
  • 负责人：
    李远清
  • 依托单位：
    华南理工大学