Un séquenceur de table de nouvelle génération pour la génomique fonctionnelle, la génomique comparative et la biologie des systèmes

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La recherche en génomique et en biologie des systèmes se développe grâce à l'avancement de nouvelles technologies, par exemple les technologies de séquençage. Cette demande de fonds vise à donner accès à ces nouvelles technologies à cinq laboratoires de l'Institut de Biologie Intégrative et des Systèmes de l'Université Laval qui sont financés par le CRSNG. Ces laboratoires font des travaux dans des domaines clé de la génomique, incluant l'étude de l'évolution moléculaire, la conservation et l'exploitation des ressources aquatiques et forestières et l'étude des changements climatiques sur les microorganismes dans l'Arctique. L'appareil demandé est un séquenceur de table MiSeq de Illumina qui permet le séquençage de petits génomes, le séquençage d'exome et d'amplicons, le génotypage par séquençage, la quantification d'ARN et de miARN par RNAseq et le contrôle de qualité de grandes librairies pour le séquençage de gros génomes. L'appareil aura un impact important sur ces programmes de recherche en permettant le développement de nouvelles méthodes pour l'étude d'interactomes protéiques et le séquençage de génomes complexes, en accélérant les travaux qui demandent un accès rapide à une plateforme de séquençage, en diminuant le cout de certaines applications et en permettant la formation de personnel hautement qualifié en nouvelles technologies. Plus de 80 étudiants et stagiaires seront formés à utiliser cette technologie dans les 5 prochaines années. L'impact sur la productivité et l'avancement de programmes de recherche financés par le CRSNG sera donc majeur.