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甘蓝型油菜角果长度主效QTL的精细定位和候选基因分析
结题报告
批准号:
31471529
项目类别:
面上项目
资助金额:
85.0 万元
负责人:
钱伟
依托单位:
学科分类:
C1307.作物基因组及遗传学
结题年份:
2018
批准年份:
2014
项目状态:
已结题
项目参与者:
李晓荣、李勤菲、傅鹰、许汪洁、董红利
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中文摘要
油菜角果是重要的"源"和"库"器官,对油菜籽粒生长起到重要作用。前期研究发现油菜A9连锁群上存在一个角果长度和千粒重主效QTL重叠的区间。本项目申请拟通过基因组重测序,利用QTL-seq的方法,精细定位该QTL并克隆角果长度基因,分析该基因是否同时也控制千粒重性状。该研究的开展不仅将在分子水平上阐明角果长度和千粒重的相互关系,而且为分子育种增加油菜产量提供基因资源。
英文摘要
Silique plays important roles in seed development in rapeseed as photosynthesis source and sink organ. A major QTL cluster for silique length and seed weight was detected in A9 chromosome of rapeseed in previous studies. In this proposal, the method of QTL-seq will be employed to fine map QTL for silique length in combination with genome resquencing, and the function of candidate gene will be identified. This study will be of interest for illuminating the relationship between silique length and seed weight, and for providing gene source for molecular breeding in rapeseed.
甘蓝型油菜是我国乃至世界上重要的油料作物,角果长度是影响甘蓝型油菜产量的重要因素之一。在之前的研究中,我们在A09染色体上定位到了一个控制角果长度的主效QTL。为了精细定位这个QTL,我们首先在BC4F2群体中选择了极端角果长度的材料利用QTL-seq的方法将这个QTL划分成了2个相邻的QTL;然后利用157份甘蓝型油菜的基因组重测序数据对角果长度进行了全基因组关联分析,在A09染色体上锁定了一个控制角果长度的区间;结合QTL-seq和关联分析的结果,我们将A09染色体上的qSLA09-1缩小在了27.78-28.26 Mb的范围内。利用关联分析群体中极端表型材料的转录组分析的结果发现,昼夜节律、光合作用、细胞分裂和信号转导转录调控途径是显著富集的,这表明在长短角果之间,这些途径的基因是有显著区别的,这些途径上的基因对角果长度有一定的影响。我们在A09染色体的27.78-28.26 Mb挖掘到一个控制角果长度的候选基因-BnaA.CYP78A9a。我们发现这个基因在长短角果间的表达量存在显著差异,通过基因序列分析,我们发现该基因的启动子区域存在4个SNP的差异,但是其基因编码区却不存在任何差异。该基因在拟南芥中过量表达导致角果长度变短,粒重增加。综上所述,我们的研究结合分子生物学和基因组学的方法,找到一个新的控制角果长度和粒重的基因。
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A genome-wide survey with different rapeseed ecotypes uncovers footprints of domestication and breeding.
对不同油菜籽生态型的全基因组调查揭示了驯化和育种的足迹
DOI:10.1093/jxb/erx311
发表时间:2017-10-13
期刊:Journal of experimental botany
影响因子:6.9
作者:Wei D;Cui Y;He Y;Xiong Q;Qian L;Tong C;Lu G;Ding Y;Li J;Jung C;Qian W
通讯作者:Qian W
Development of genic cleavage markers in association with seed glucosinolate content in canola
开发与双低油菜籽芥子油苷含量相关的基因切割标记
DOI:10.1007/s00122-015-2487-z
发表时间:2015-06-01
期刊:THEORETICAL AND APPLIED GENETICS
影响因子:5.4
作者:Fu, Ying;Lu, Kun;Qian, Wei
通讯作者:Qian, Wei
GWAS, QTL mapping and gene expression analyses in Brassica napus reveal genetic control of branching morphogenesis.
甘蓝型油菜的 GWAS、QTL 作图和基因表达分析揭示了分枝形态发生的遗传控制
DOI:10.1038/s41598-017-15976-4
发表时间:2017-11-21
期刊:Scientific reports
影响因子:4.6
作者:He Y;Wu D;Wei D;Fu Y;Cui Y;Dong H;Tan C;Qian W
通讯作者:Qian W
Genome-Wide Association Study Reveals Both Overlapping and Independent Genetic Loci to Control Seed Weight and Silique Length in Brassica napus.
全基因组关联研究揭示了控制甘蓝型油菜种子重量和长角果长度的重叠和独立遗传位点
DOI:10.3389/fpls.2018.00921
发表时间:2018
期刊:Frontiers in plant science
影响因子:5.6
作者:Dong H;Tan C;Li Y;He Y;Wei S;Cui Y;Chen Y;Wei D;Fu Y;He Y;Wan H;Liu Z;Xiong Q;Lu K;Li J;Qian W
通讯作者:Qian W
QTL Mapping of Seed Glucosinolate Content Responsible for Environment in Brassica napus.
甘蓝型油菜种子芥子油苷含量对环境负责的QTL定位
DOI:10.3389/fpls.2018.00891
发表时间:2018
期刊:Frontiers in plant science
影响因子:5.6
作者:He Y;Fu Y;Hu D;Wei D;Qian W
通讯作者:Qian W
miR6225y靶向沉默核盘菌SsV263参与非寄主抗性的分子机制
  • 批准号:
    32372077
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50万元
  • 批准年份:
    2023
  • 负责人:
    钱伟
  • 依托单位:
分子设计ROS清除系统增强油菜菌核病抗性
  • 批准号:
    31971978
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万元
  • 批准年份:
    2019
  • 负责人:
    钱伟
  • 依托单位:
油菜铜离子分子伴侣基因BnCCH在菌核病抗性中的功能分析
  • 批准号:
    31671726
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62.0万元
  • 批准年份:
    2016
  • 负责人:
    钱伟
  • 依托单位:
利用转录组测序挖掘甘蓝菌核病抗病相关基因
  • 批准号:
    31171585
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    61.0万元
  • 批准年份:
    2011
  • 负责人:
    钱伟
  • 依托单位:
国内基金
海外基金