利用ESI-MSn方法系统地对11种生物碱类，22种黄酮类和9种人参皂苷类中药化学成分单体与双链DNA的相互作用进行了研究，计算并比较了不同中药化学成分与双链DNA靶分子的相对结合强度，阐明了其构效关系，并根据质谱数据进一步推断了这些化学成分与DNA靶分子的作用方式。首次将强度衰减基质辅助激光解吸电离质谱法（Intensity-fading MALDI-MS）引入配体分子与蛋白质相互作用的研究中。利用该方法考察了钙调蛋白与中药生物碱成分之间的相互作用，并通过滴定实验和竞争反应，比较不同配体与钙调蛋白的相对结合强度。成功地建立了适合于复杂体系下双链DNA和CaM结合剂筛选的应用方法并系统地对中草药提取物中潜在的双链DNA结合剂和CaM结合剂进行了筛选，得到了30余种潜在的结合剂。基于前期筛选survivin启动子序列和CaM钙调素结合剂实验，我们研究观察了这些中药提取物对癌细胞的影响。该癌症细胞和存活素以及钙调蛋白含量相关。MTT数据显示，这些该提取物可诱导细胞周期阻滞和抑制HeLa细胞的增殖。统计分析表明，药物提取物对细胞增殖具有明显抑制作用。研究结果表明，一些活性成分可能是强有力的CaM拮抗剂或survivin抑制剂。