Proteomische Charakterisierung von krankheitsrelevanten PDZ Domänen und dessen gezielte intrazelluläre Interferenz mittels zell-penetrierender Peptide (CPPs).
Proteomische Charakterisierung von krankheitsrelevanten PDZ Domänen und dessen gezielte intrazelluläre Interferenz mittels zell-penetrierender Peptide (CPPs).
批准号:
15377009
负责人:
Dr. Rudolf Volkmer
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2005
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2004-12-31 至 2011-12-31
中文摘要
本文介绍了三种PDZ分子的蛋白质组学特征,并详细介绍了用SPOT法合成具有Ziel结构的磷酸化反相肽的方法。由于蛋白质组学研究的重要性,PDZ区域的蛋白质组学调控机制是通过对蛋白质组学的研究来实现的,因此,本文通过对两个种植项目的蛋白质组学研究,对PDZ区域的蛋白质组学进行了分析。Hierzu sollen weitere human PDZ Domänen,die uns von anderen Arbeitgruppen überlassen韦尔登,bezüglich ihrer Liganden-Spezifität analysiert韦尔登.该数据将被存入我们的自由数据库(http://www.fmp-berlin.de/nmr/pdz),可以韦尔登查询。因此,我们需要一个用于PDZ区域的一般分类的研究Weg。通过一个化学生物学分析,我们将获得一个高通量的体内阵列。Zellbiologie和SPOT技术的组合有助于提高体外抗菌肽的生物学相关性。Die Peptid/PDZ Domänen Interaktion soll hierbei als Modell für die Etablierung dieser Methode dienen.细胞穿透肽(CPP)或类似物的原位合成是细胞穿透肽(CPP)的基本组成部分。这些工人必须与K. Mölling(Zürich,Schweiz)durchgeführt韦尔登.
英文摘要
Das hier beantragte Projekt zur proteomischen Charakterisierung der Spezifität von PDZ Domänen gliedert sich in drei Teile.Ein Teil beinhaltet die Weiterentwicklung der Methode der invertierten Peptide mit dem Ziel, phosphorylierte Peptide in invertierter Form mittels SPOT Synthese auf Zellulosemembranen zu generieren. Damit eröffnet sich die Möglichkeit, den vermuteten Regulationsmechanismus bei einigen PDZ Domänen, der durch Cterminale Phosphorylierung gesteuert ist, mittels Vergleich phosphorylierter und nicht-phosporylierter Peptidbibliotheken zu untersuchen.Der zweite Teil des geplanten Projektes hat die Fortsetzung der proteomischen Analyse von PDZ Domänen zum Inhalt. Hierzu sollen weitere humane PDZ Domänen, die uns von anderen Arbeitgruppen überlassen werden, bezüglich ihrer Liganden-Spezifität analysiert werden. Die Daten sollen anschließend in unserer frei zugänglichen Datenbank (http://www.fmp-berlin.de/nmr/pdz) abgelegt werden. Darüber hinaus können diese Untersuchungen einen Weg für eine genauere Klassifizierung von PDZ Domänen ebnen.Im letzten Abschnitt wollen wir den Versuch unternehmen, durch einen chemischbiologischen Ansatz ein einfaches ¿high throughput in vivo¿ array zu etablieren. Ziel ist es, mittels einer Kombination aus Zellbiologie und SPOT Technologie schneller Antworten zur biologischen Relevanz von in vitro wirksamen Peptiden zu erhalten. Die Peptid/PDZ Domänen Interaktion soll hierbei als Modell für die Etablierung dieser Methode dienen. Grundgedanke bei diesem Verfahren ist SPOT-synthetisch hergestellte Peptide mittels cell penetrating peptides (CPP) oder anderer Transfektionsreagenzien in einem (hoch)parallelen Ansatz in Zellen einzuschleusen und funktional auszulesen. Diese Arbeiten sollen in enger Kooperation mit der zellbiologisch orientierten Arbeitsgruppe von K. Mölling (Zürich, Schweiz) durchgeführt werden.
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
The agony of choice: how to find a suitable CPP for cargo delivery
选择之苦:如何找到合适的CPP进行货物运输
DOI:
10.1002/psc.2396
发表时间:
2012
期刊:
Journal of Peptide Science
影响因子:
2.1
作者:
[Müller J, Triebus J, Kretzschmar I, Volkmer R, Boisguerin P]
通讯作者:
Boisguerin P
The WW-domain as a model system for the analysis of essential interactions in beta-sheets by incorporation of synthetic building blocks.
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批准号:5367972
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项目类别:Research Units
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2002
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负责人:Dr. Rudolf Volkmer
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依托单位:
海外基金