Strukturvorhersage von Proteinkomplexen unter Verwendung weniger experimenteller Daten.

该项目通过核磁共振（NMR）实验，利用剩余偶极耦合（RDC）和饱和转移（SAT），对蛋白质复合物的结构进行了研究。RDC Daten geben Aufschluss über die relative Orientierung von Bindungsvektoren und liefern somit sowohl intra- als auch intermolekulare Informationen. SAT Daten hingegen ergeben，welche Aminosäuren sich in der Bindungsregion zwischen zwei Proteinen befinden und bedingen somit eine wertvolle Einschränkung möglicher Topologien der Proteinstrukturen. Im Gegenetrizu dem pelligeschlagenen Projekt besteht der herkömmliche Weg zur Strukturvorhersage von Proteinkomplexen aus zwei unabhängigen Schritten.首先，韦尔登设计了一个单体的结构，并在一个两重的Schritt中通过一个对接过程对复合体中的单体进行相对定位和翻译。这位经济学家认为，在一个复杂的结构中，孤立的单体结构可以被构造成信息结构，而在另一个复杂的结构中，单体结构的结合是不可能被韦尔登所接受的。在该工程中，解决了这一韦尔登问题，并将蛋白质复合物的结构置于一个Schritt中。通过实验得出最佳的奥氏体韦尔登。我们要把韦尔登插进三根管子里。首先要制定和实施这个方法。我们用Chen et.等. Im dritten Schritt soll die Struktur des Synaptotagmin/ SNARE Komplexes bestimmt韦尔登，für den die verfügbaren Daten mit den bisherigen Methoden nicht zur Strukturbestimmung ausreichen.在突触膜上的一个作用，即SNARE复合体的Wechselectin kung zwischen，mit Synaptotagmin is vermutlich entscheidend für die Steuerung der Kalziumabhängigkeit der synaptischen Signalübertragung。

Das beantragte Projekt zielt auf eine schnelle Strukturvorhersage von Proteinkomplexen unter Verwendung weniger, leicht zugänglicher experimenteller Daten aus NMR Experimenten wie residual dipolar couplings (RDC) und saturation-transfer (SAT). RDC Daten geben Aufschluss über die relative Orientierung von Bindungsvektoren und liefern somit sowohl intra- als auch intermolekulare Informationen. SAT Daten hingegen ergeben, welche Aminosäuren sich in der Bindungsregion zwischen zwei Proteinen befinden und bedingen somit eine wertvolle Einschränkung möglicher Topologien der Proteinstrukturen. Im Gegensatz zu dem hier vorgeschlagenen Projekt besteht der herkömmliche Weg zur Strukturvorhersage von Proteinkomplexen aus zwei unabhängigen Schritten. Zuerst werden die Strukturen der einzelnen Monomere bestimmt und in einem zweiten Schritt wird die relative Orientierung und Translation der Monomere im Komplex durch eine Docking- Prozedur vorhergesagt. Dieser heuristische Ansatz hat allerdings Nachteile, denn zum einen kann die Struktur der isolierten Monomere erheblich von der im Komplex abweichen und zum anderen liefert die Bindungsfläche zwischen den Monomeren für die Strukturvorhersage wichtige strukturelle Informationen, die in der herkömmlichen Methode nicht berücksichtigt werden. In dem beantragten Projekt sollen diese Nachteile überwunden werden, indem die Struktur des Proteinkomplexes in einem Schritt bestimmt wird. Auf diese Weise können die verfügbaren experimentellen Daten optimal ausgenutzt werden. Wir werden dabei in drei Schritten vorgehen. Zuerst wird die Methode entwickelt und implementiert. Dann testen wir die Güte der Methode an dem etablierten Proteinkomplex-Benchmark von Chen et. al. Im dritten Schritt soll die Struktur des Synaptotagmin/ SNARE Komplexes bestimmt werden, für den die verfügbaren Daten mit den bisherigen Methoden nicht zur Strukturbestimmung ausreichen. Die Wechselwirkung zwischen dem SNARE Komplex, der eine entscheidende Rolle bei der synaptischen Membranfusion spielt, mit Synaptotagmin ist vermutlich entscheidend für die Steuerung der Kalziumabhängigkeit der synaptischen Signalübertragung.