Strukturelle Aufklärung von Aptamer/Proteinkomplexen durch membrangebundene Peptid-Repertoires

我们在体外实验中发现，这些蛋白质在体外具有一定的功能，但不同的是，它们的功能也不同。Anhandder Aus der inzellulären适配子表达(“Intramer”-Expression)Resultierden zellulären Phänotyen konnten wir zum teil Rück schlüSSE auf die Funktion der Jeweiligen Proteine Erlangen.这是一种与蛋白质区域相关的珠光蛋白目标。Dazu Sollen在Zusammenarbeit MIT der AG Schneider-Mergener 13-14-mertid-arrades des gesamten Jeweiligen TargetProteins auf Memmenen Syntisiert and MIT Dm Jeweiligen Cogten，Radiakaktiv-oder荧光zenzmarkierten Apamer in Kontakt gebrht den。Zunächst Müssen De OPTIMALEN INTERIONAL DES JEWEILLIGN APTAMER/ZIELPREL-SYSTEM OPTIMIERT WORDEN。Anhanddes erhaltenen Interruptionsmuers Sollen RückschlüSSEüber die für die Bindung an das ApTamer Relationanten Aminosäure-Seitenketten des Proteins möglich wenden.ZielProteine sind zunächst das细胞质调节蛋白细胞粘附素-1，das神经肽Y和das小鼠原蛋白。SPäter Sollen auch natürliche RNA/Proteinkplexe Untersuthht.

Wir haben in früheren Arbeiten eine Reihe von Aptameren gegen verschiedene intrazelluläre Proteintargets selektiert und ihre Funktion in vitro, sowie in lebenden, hochdifferenzierten Zellen untersucht. Anhand der aus der intrazellulären Aptamer-Expression ("Intramer"-Expression) resultierenden zellulären Phänotypen konnten wir zum Teil Rückschlüsse auf die Funktion der jeweiligen Proteine erlangen. Ziel dieses Antrags ist es, eine genaue Vorstellung über die für die Bindung der Aptamere an ihr jeweiliges Proteintarget relevanten Regionen des Proteins zu erlangen. Dazu sollen in Zusammenarbeit mit der AG Schneider-Mergener 13-14-mer Peptid-Arrays des gesamten jeweiligen Targetproteins auf Membranen synthetisiert und mit dem jeweiligen cognaten, radioaktiv- oder fluoreszenzmarkierten Aptamer in Kontakt gebracht werden. Zunächst müssen die optimalen Interaktionsbedingungen des jeweiligen Aptamer/Zielprotein-Systems optimiert werden. Anhand des erhaltenen Interaktionsmusters sollen Rückschlüsse über die für die Bindung an das Aptamer relevanten Aminosäure-Seitenketten des Proteins möglich werden. Zielproteine sind zunächst das cytoplasmatische Regulatorproteine Cytohesin-1, das Neuropeptid Y und das murine Prionprotein. Später sollen auch natürliche RNA/Proteinkomplexe untersucht werden.