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Diversity and evolution of gene expression in reptilian mitochondria

Diversity and evolution of gene expression in reptilian mitochondria
爬行动物线粒体基因表达的多样性和进化
批准号:
24657163
负责人:
KUMAZAWA Yoshinori
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012-04-01 至 2014-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
我们使用代表爬行动物的动物物种进行了RNA-Seq实验。我们发现mRNA的polyA添加位点的分布存在一定的变异,其中一些与mtDNA基因排列的变异相一致。对于物种中的特定mRNA,polyA添加的准确性在一定程度上降低,尽管其原因目前尚不清楚。物种中每种mRNA丰度的相对比例以与多顺反子mRNA从一个控制区到另一个控制区产生的想法一致的方式变化。线粒体中的基因表达系统在爬行动物中具有变化并正在进化。
英文摘要
We conducted RNA-Seq experiments using animal species representing Reptilia. We found some variations in the distribution of polyA-addition sites to mRNAs and some of them are consistent with variations of gene arrangements of mtDNAs. Accuracy of polyA addition was lowered to some extent for particular mRNAs in a species though reasons for this are currently unknown. Relative ratio of each mRNA abundance in a species is changed in a way that is consistent with an idea that polycistronic mRNAs are created from one control region to another. The gene expression system in mitochondria has variations and is evolving in Reptilia.
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科研奖励(0)
会议论文
ヤモリ類のミトコンドリアゲノミクス:遺伝子配置変動と系統関係
壁虎线粒体基因组学:基因排列变异和系统发育关系
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [熊澤慶伯, 三浦沙綾, 孫ぎょう, ピエールジョニオ, 山田知江美, 橋口康之]
通讯作者: 橋口康之
ヤモリ類のミトコンドリアゲノミクス : 遺伝子配置変動と系統関係
壁虎线粒体基因组学:基因排列变异和系统发育关系
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [熊澤慶伯, 三浦沙綾, 孫ぎょう, ピエールジョニオ, 山田知江美, 橋口康之]
通讯作者: 橋口康之
脊椎動物嗅覚受容体遺伝子ファミリーの進化研究における次世代シーケンサーの活用
下一代测序在脊椎动物嗅觉受体基因家族进化研究中的应用
DOI: --
发表时间: 2013
期刊: 生物科学
影响因子: --
作者: [橋口康之, 熊澤慶伯]
通讯作者: 熊澤慶伯
爬虫類ミトコンドリアにおける転写物の網羅的解析
爬行动物线粒体转录本的综合分析
DOI: --
发表时间: 2013
期刊:
影响因子: --
作者: [孫ぎょう, 栗崎政希, 熊澤慶伯]
通讯作者: 熊澤慶伯
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    Molecular phylogeny using multiple nuclear gene sequences
    • 批准号:
      22657060
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额:
      $2.17万
    • 财政年份:
      2010
    • 负责人:
      KUMAZAWA Yoshinori
    • 依托单位:
    Molecular phylogeny of geckos using new mitogenomic approaches
    • 批准号:
      20370033
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.4万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      KUMAZAWA Yoshinori
    • 依托单位:
    Evolution and biogeography of freshwater fishes in relation to the collision of Indian subcontinent and climatic changes
    • 批准号:
      20405012
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $10.48万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      KUMAZAWA Yoshinori
    • 依托单位:
    Mesozoic continental fragmentations and lizard radiations
    • 批准号:
      17570076
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.24万
    • 财政年份:
      2005
    • 负责人:
      KUMAZAWA Yoshinori
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    基于RNA-seq技术探究抗菌肽HX-12C对SA皮肤感染的抑制机理
    • 批准号:
      2025JJ70518
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
      汪美凤
    • 依托单位:
    利用ATAC-seq联合RNA-seq分析TOP2A介导的HCC肿瘤细胞迁移侵 袭的机制研究
    • 批准号:
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      柳静
    • 依托单位:
    基于RNA-seq技术对Tau过表达小鼠角膜神经病变的机制研究
    基于比较基因组学和RNA-Seq探讨ClpP抑制剂bohemamines的生物合成机制研究