Virtuelle molekulare Bibliotheken zum geometriebasierten Auffinden potentieller neuer Proteinliganden
Virtuelle molekulare Bibliotheken zum geometriebasierten Auffinden potentieller neuer Proteinliganden
批准号:
5321594
负责人:
Professor Dr. Cornelius Frömmel
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Units
财政年份:
2001
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2000-12-31 至 2005-12-31
中文摘要
本文通过理论分析和实验研究了基于几何配体设计的韦尔登概念的悲剧性,并在虚拟分子图书馆的基础上,提出了一种基于几何配体设计的新的力学模型,该模型也可用于韦尔登的几何配体设计。Das in-silico-screening soll in virtualellen Librarys,die von der Datenbank“Dictionary of Interfaces in Proteins”(DIP,Preißner et al.,1998年)durch verdedene geometrische Verfahren(wie ganze oder teilweise Spiegelung der Molekülstrukturen,virtuelle mechanität ds Liganden als auch des Targetmoleküls)abgeleitet wurden,geschehen.这种虚拟数据库的做法是在药物设计领域的一种尝试,并解决了一个焦点问题(一种合成技术)。这是一个非常重要的基础理论,它可以解释为“分子Mimikry”的概念,也可以解释为韦尔登的概念,因为分子Nachahmung是一种新的概念,而不是在蛋白质与配体的结合上的基础。
英文摘要
Nachdem in einer Reihe von theoretischen Analysen und experimentellen Untersuchungen die Tragfähigkeit des Konzeptes des geometriebasierten Ligandendesign gezeigt werden konnte, soll im vorgelegten Folgeprojekt der Suchraum einerseits auf virtuelle molekulare Bibliotheken erweitert und neben neuen Möglichkeiten der Ligandenvorhersage auch die Grenzen des Verfahrens abgeschätzt werden. Das in-silico-screening soll in virtuellen Librarys, die von der Datenbank "Dictionary of Interfaces in Proteins" (DIP, Preißner et al., 1998) durch verschiedene geometrische Verfahren (wie ganze oder teilweise Spiegelung der Molekülstrukturen, virtuelle Flexibilität ds Liganden als auch des Targetmoleküls) abgeleitet wurden, geschehen. Diese Suche nach virtuellen Datenbanken erscheint als ein erfolgversprechender Ansatz im Rahmen des Drug Design und soll eine fokussierte' (eingegrenzte) Synthesechemie ermöglichen. Da eine wesentliche Grundlage der hier vorgestellten Untersuchungen weiterhin das Konzept 'Molekularer Mimikry' ist, soll geprüft werden, inwieweit diese molekulare Nachahmung eine hinreichende und notwendige Bedingung bei der Bindung von Liganden an Proteinen ist.
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