Mechanistic Studies on the Photooxidation of Methylated Cytosine in DNA and Its Application to Novel DNA Methylation Analysis
Mechanistic Studies on the Photooxidation of Methylated Cytosine in DNA and Its Application to Novel DNA Methylation Analysis
批准号:
21710228
负责人:
YAMADA Hisatsugu
金额:
$2.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2009
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2009 至 2010
中文摘要
我们的兴趣集中在5-甲基胞嘧啶(^MC)显著的光氧化活性在甲基化映射系统中的潜在应用,以及进一步了解DNA中^MC的光氧化机制。在该项目中,我们揭示了(1)在DNA链中掺入一个AQ(AQ)增敏剂增强了单电子光氧化,导致了在MC位点的有效的链断裂,(2)中间体MC自由基的C5-甲基上的去质子化可能是在MC处的AQ-光氧化断裂的关键基元反应,以及(3)在多个MC残基上的DNA链断裂是由AQ光注入的正电荷(空穴)通过DNA双链转移而引起的。所得结果可为高灵敏、高选择性光化学方法的分子设计提供指导,用于DNA中MC的鉴定和分析。
英文摘要
Our interest focuses on the potential application of remarkable photooxidative reactivity of 5-methylcytosine (^mC) to methylation-mapping system and on further understanding the mechanism of photooxidation at ^mC in DNA. In the project, we revealed that (1) incorporation of an anthraquinone (AQ) sensitizer into a DNA strand enhanced one-electron photooxidation, leading to efficient strand cleavage at the ^mC site, (2) deprotonation at the C5-methyl group of an intermediate ^mC radical cation may occur as a key elementary reaction in the AQ-photooxidative strand cleavage at the ^mC, and (3) DNA strand cleavage at multiple ^mC residues was induced by AQ-photoinjected positive charge (hole) transfer through DNA duplex. The results obtained may provide a guide for the molecular design of highly sensitive and selective photochemical methods for the identification and analysis of ^mC in DNA.
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Efficient one-electron photooxidation and site-selective strand cleavage at 5-methylcytosine in DNA by oligonucleotide bearing 9,10-anthraquinone sensitizer
通过带有 9,10-蒽醌敏化剂的寡核苷酸对 DNA 中的 5-甲基胞嘧啶进行有效的单电子光氧化和位点选择性链切割
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kitauchi, Y., Yamada, H., Tanabe, K., Ito, T., Nishimoto, S.]
通讯作者:
S.
C(5)位に置換基を導入した修飾シトシン含有DNAオリゴマーの合成と四重鎖形成特性
在 C(5) 位引入取代基的修饰含胞嘧啶 DNA 寡聚物的合成和四链体形成特性
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[藏田真之, 山田久嗣, 田邉一仁, 伊藤健雄, 山田久嗣, 西本清一]
通讯作者:
西本清一
Photoelectrochemical identification of 5-methylcytosine modificationin DNA : combination of photosensitization and enzymatic-cleavage
DNA 5-甲基胞嘧啶修饰的光电化学鉴定:光敏化和酶裂解的结合
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Nucleic Acids Symposium Series VOL.53
影响因子:
--
作者:
[Kazuhito Tanabe, et al.]
通讯作者:
et al.
Efficient photooxidative strand cleavage at 5-methylcytosine in DNA by sensitization with 9.10-anthraquinone-tethered oligonucleotides
通过 9.10-蒽醌系寡核苷酸的敏化,对 DNA 中的 5-甲基胞嘧啶进行有效的光氧化链切割
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[松本剛昭, 本間健二, Kazuhito Tanabe]
通讯作者:
Kazuhito Tanabe
光化学反応を利用したDNAメチル化検出法の開発
利用光化学反应检测DNA甲基化方法的开发
DOI:
--
发表时间:
2010
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山田久嗣, 北内佑哉, 田邉一仁, 伊藤健雄, 西本清一, 山田久嗣]
通讯作者:
山田久嗣
共 19 条
Development of a New DDS Imaging Method for Visualizing Biocompatible Polymer Probes
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批准号:16K01935
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2016
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负责人:YAMADA Hisatsugu
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依托单位:
Analysis of In Situ Chemical Reaction Dynamics by a Multiple Resonance NMR Technique
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批准号:23710268
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.83万
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财政年份:2011
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负责人:YAMADA Hisatsugu
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依托单位:
海外基金