Analysis of genome inactivation mechanism using chromosomal site-specific gene integration
Analysis of genome inactivation mechanism using chromosomal site-specific gene integration
批准号:
23651189
负责人:
ABE KUNIYA
金额:
$2.58万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份:
2011
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 2012
中文摘要
在本研究中,我们首先设计了一种位点特异性的基因整合方法,并建立了两个雌性小鼠品系,它们的两条X染色体携带不同的荧光蛋白基因。X染色体失活现象可以用这些小鼠系来可视化。首次在这些小鼠品系的活细胞中分析了X失活和再激活的过程。利用从Xist基因敲除小鼠和亚洲小鼠亚种杂交个体中分离的雌性体细胞,进行了组蛋白修饰的CHIP-SEQ分析。非活性X和活性X在表观遗传状态上的差异已被揭示。
英文摘要
In this study, we first devised a site-specific gene integration method, and established two female mouse lines, whose two X chromosomes carry different fluorescent protein genes. X chromosome inactivation phenomenon can be visualized using these mouse lines. Processes of X inactivation and reactivation can be analyzed in living cells of these mouse lines for the first time.Using female somatic cells isolated from hybrid individuals between Xist knockout mice and asian mouse subspecies, ChIP-Seq analysis of histone modifications has been conducted. Differences in epigenetic states between inactive X and active X has been revealed.
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DOI:
10.1093/nar/gkq1201
发表时间:
2011-04
期刊:
Nucleic acids research
影响因子:
14.9
作者:
[Numata K, Kohama C, Abe K, Kiyosawa H]
通讯作者:
Kiyosawa H
Dynamics of epigenomic changes during development of early embryos and primordial germ cells in mice.
小鼠早期胚胎和原始生殖细胞发育过程中表观基因组变化的动态。
DOI:
--
发表时间:
2011
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kuniya Abe, Koji Numata, Rieko Ikeda, Hirosuke Shiura and Michihiko Sugimoto]
通讯作者:
Hirosuke Shiura and Michihiko Sugimoto
マウス着床期における Xist/Tsix ダイナミクス
小鼠植入过程中的 Xist/Tsix 动力学
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[志浦寛相, 阿部訓也]
通讯作者:
阿部訓也
Generation of a novel germline stem cell line expressing a germline-specific reporter in the mouse.
在小鼠中产生表达种系特异性报告基因的新型种系干细胞系。
DOI:
10.1002/dvg.22391
发表时间:
2013
期刊:
Genesis
影响因子:
1.5
作者:
[Shiura H, Ikeda R, Lee J, Sato T, Ogonuki N, Hirose M, Ogura A, Ogawa T, Abe K.]
通讯作者:
Abe K.
tw5変異マウスの解析で明らかになったVps52遺伝子の多能性幹細胞分化制御因子としての役割
通过对 tw5 突变小鼠的分析揭示 Vps52 基因作为多能干细胞分化调节因子的作用
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[杉本道彦, 近藤昌代, 阿部訓也]
通讯作者:
阿部訓也
共 17 条
Analyses on developmental transition process of mammalian pluripotent cells and its epigenomic regulations using single cell technologies
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批准号:18H02424
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.23万
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财政年份:2018
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负责人:ABE KUNIYA
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依托单位:
Development of quantitative cell-phenotyping technology by integrating image-analysis, machine learning and single-cell omics
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批准号:18K19312
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$3.99万
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财政年份:2018
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负责人:ABE KUNIYA
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依托单位:
海外基金