Support for the Protein Circular Dichroism Data Bank and the Dichroweb Analysis Server
Support for the Protein Circular Dichroism Data Bank and the Dichroweb Analysis Server
批准号:
BB/F010362/1
负责人:
Robert Janes
金额:
$31.45万
依托单位国家:
英国
项目类别:
Research Grant
财政年份:
2008
资助国家:
英国
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 --
中文摘要
圆二色谱(CD)是研究蛋白质结构、动力学和折叠的一种成熟而有价值的技术,并经常作为一种标准方法在英国的许多生物和化学实验室使用。这是一项为CD光谱学创建一个全面的电子存档和分析资源的建议,可供结构生物学和生物信息学社区使用。它将包括蛋白质圆二色谱数据库(PCDDB)的运行、管理和开发,这是一个存储和搜索生物大分子圆二色谱的数据库。PCDDB将成为结构分子生物学和生物信息学的资源,以及与蛋白质数据库(PDB)并行的光谱数据共享的公共档案,蛋白质数据库是一个长期存在的、有价值的蛋白质晶体和核磁共振数据的参考数据库。该项目还包括DICHROWEB的运行、升级和维护,DICHROWEB是一种广泛使用的用户友好的圆二色性数据分析在线服务器。这两个生物信息学设施将共同为结构生物学和生物信息学社区提供CD光谱学方面的一揽子支持和支持资源。
英文摘要
Circular Dichroism (CD) spectroscopy is an established and valuable technique for examining protein structure, dynamics, and folding, and is regularly used as a standard method in a large number of UK biological and chemical laboratories. This is a proposal to create a comprehensive electronic archiving and analysis resource for CD spectroscopy that can be used by the structural biology and bioinformatics communities. It will include the running, curation and development of the Protein Circular Dichroism Data Bank (PCDDB), a deposition and searchable data bank for circular dichroism spectra of biomacromolecules. The PCDDB will be a resource for structural molecular biology and bioinformatics, and a public archive for data sharing of spectroscopic data to parallel the Protein Data Bank (PDB), a long-existing and valuable reference data bank for protein crystal and NMR data. This project also includes the operation, upgrading and maintenance of DICHROWEB, a widely-used user-friendly online server for the analysis of circular dichroism data. Together these two bioinformatics facilities will provide a comprehensive package of enabling and supportive resources in CD spectroscopy for the Structural Biology and Bioinformatics communities.
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DOI:
10.1002/pro.3207
发表时间:
2018-01
期刊:
Protein science : a publication of the Protein Society
影响因子:
--
作者:
[Whitmore L, Mavridis L, Wallace BA, Janes RW]
通讯作者:
Janes RW
The Protein Circular Dichroism Data Bank: A Resource for Data Sharing
蛋白质圆二色性数据库:数据共享资源
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
BIOPHYSICAL JOURNAL
影响因子:
3.4
作者:
[Whitmore Lee]
通讯作者:
Whitmore Lee
DOI:
10.1093/nar/gkq1026
发表时间:
2011-01
期刊:
Nucleic acids research
影响因子:
14.9
作者:
[Whitmore L, Woollett B, Miles AJ, Klose DP, Janes RW, Wallace BA]
通讯作者:
Wallace BA
DOI:
10.1042/bst0380861
发表时间:
2010-08
期刊:
Biochemical Society transactions
影响因子:
3.9
作者:
[B. Wallace;R. W. Janes]
通讯作者:
B. Wallace;R. W. Janes
DOI:
10.1002/chir.22050
发表时间:
2012-09-01
期刊:
CHIRALITY
影响因子:
2
作者:
[Janes, Robert W., Miles, A. J., Wallace, B. A.]
通讯作者:
Wallace, B. A.
共 8 条
Bioinformatics Resources for Circular Dichroism Spectroscopy and Structural Biology: Operation, Enhancement, Curation, and New Developments
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批准号:BB/P024106/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$54.23万
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财政年份:2018
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负责人:Robert Janes
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依托单位:
The Protein Circular Dichroism Data Bank, the DichroWeb Server, and ValiDichro: Data Sharing, Analysis and Standards Resources for CD Spectroscopy
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批准号:BB/J019194/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$57.41万
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财政年份:2013
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负责人:Robert Janes
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依托单位:
JCAMP-DX-CD: A Universal Format for CD and SRCD Spectroscopy Enabling Data Standardisation and Data Sharing
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批准号:BB/I023887/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$15.04万
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财政年份:2011
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负责人:Robert Janes
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依托单位:
国内基金
海外基金
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子宫内膜间质与巨噬细胞之间通过Protein S-MerTK-Apelin信号对
话促进子宫腺肌病蜕膜化缺陷的机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:吕海宁
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依托单位:
有翅与无翅蚜虫差异分泌唾液蛋白Cuticular protein在调控植物细胞壁免疫中的功能
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批准号:32372636
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2023
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负责人:郭慧娟
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依托单位:
抑制Protein Kinase D促进胚胎干细胞自我更新的分子机制研究
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:54万元
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批准年份:2022
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负责人:叶守东
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依托单位:
C2 DOMAIN PROTEIN 1 (C2DP1)基因家族在植物开花调控中的功能研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2022
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负责人:
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依托单位:
凡纳滨对虾Laccase-like protein非酶活依赖参与抗WSSV免疫的分子机制
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2022
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负责人:史黎黎
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依托单位:
帽结合蛋白(cap binding protein)调控乙烯信号转导的分子机制
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批准号:32170319
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.00万元
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批准年份:2021
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负责人:董春海
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依托单位:
玉米基因Dirigent protein 4的克隆和功能鉴定
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批准号:32101754
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项目类别:青年科学基金项目(C类)
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2021
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负责人:秦涛
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依托单位:
帽结合蛋白(cap binding protein)调控乙烯信号转导的分子机制
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批准号:--
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项目类别:--
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资助金额:58万元
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批准年份:2021
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负责人:董春海
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依托单位:
锌指蛋白33B(Zinc finger protein 33B, ZNF33B)抑制乙型脑炎病毒复制的功能与分子机制研究
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批准号:32072901
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2020
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负责人:李祥敏
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依托单位:
锌指蛋白33B(Zinc finger protein 33B, ZNF33B)抑制乙型脑炎病毒复制的功能与分子机制研究
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批准号:--
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项目类别:--
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资助金额:58万元
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批准年份:2020
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负责人:李祥敏
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依托单位: