ITR/NGS: A Framework for Discovery, Exploration and Analysis of Evolutionary Simulation Data (DEAS)

ITR/NGS:进化模拟数据发现、探索和分析的框架 (DEAS)

基本信息

项目摘要

In science the challenge is always finding a signal in the noise. Examples include hurricane forecasting and monitoring both intelligence and seismic activity. Our proposal addresses these issues through a broad framework we call generalized feature mining. The framework has two major components: feature mining, and shape-based data mining and analysis. At its core, feature mining detects features for a specific application domain. Each instance involves a specific extended shape description tailored to it. For evolutionary simulations, feature mining also tracks features across multiple temporal scales. Shape-based data mining and analysis learn from the process. The aim is to correlate information from the extended shape descriptors with transient detection to find or refine spatio-temporal rules for the evolution of features. Environmental influences, such as walls, must be built into the rules so they are predictive.To close the loop, the detected features can be displayed as they are found or refined. The evolutionary rules predicted by our framework can lead to new science { not only understanding the underlying phenomena but also leading to computationally simpler models that encapsulate the essentials.
在科学中,挑战总是在噪音中找到信号。例如,飓风预报和监测情报和地震活动。 我们的建议通过一个广泛的框架来解决这些问题,我们称之为广义特征挖掘。该框架有两个主要组成部分:特征挖掘和基于形状的数据挖掘和分析。特征挖掘的核心是检测特定应用程序域的特征。 每个实例都包含一个为其定制的特定扩展形状描述。对于进化模拟,特征挖掘还跟踪多个时间尺度上的特征。基于形状的数据挖掘和分析从这个过程中学习。我们的目标是从扩展的形状描述符与瞬态检测相关的信息,以找到或完善时空规则的演变功能。环境影响(如墙壁)必须内置到规则中,以便它们具有预测性。要关闭循环,可以在发现或细化时显示检测到的特征。我们的框架预测的进化规则可以导致新的科学,不仅可以理解潜在的现象,还可以导致计算上更简单的模型,这些模型包含了基本要素。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Raghu Machiraju其他文献

Raghu Machiraju的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Raghu Machiraju', 18)}}的其他基金

Collaborative Research: Autonomous Computing Materials
合作研究:自主计算材料
  • 批准号:
    1940168
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Spokes: MEDIUM: MIDWEST: Collaborative: Community-Driven Data Engineering for Substance Abuse Prevention in the Rural Midwest
辐条:媒介:中西部:协作:社区驱动的数据工程,用于中西部农村地区的药物滥用预防
  • 批准号:
    1761969
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Standard Grant
SCC-Planning: Using Innovations in Big Data and Technology to Address the High Rate of Infant Mortality in Greater Columbus Ohio
SCC-Planning:利用大数据和技术创新解决俄亥俄州大哥伦布市婴儿死亡率高的问题
  • 批准号:
    1737560
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Standard Grant
BCSP: ABI Innovation: Collaborative Research: Predicting changes in protein activity from changes in sequence by identifying the underlying Biophysical Conditional Random Field
BCSP:ABI 创新:协作研究:通过识别潜在的生物物理条件随机场,根据序列变化预测蛋白质活性的变化
  • 批准号:
    1262469
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Standard Grant
G&V: Medium: Collaborative Research: Large Data Visualization Using An Interactive Machine Learning Framework
G
  • 批准号:
    1065025
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Standard Grant
SOFTWARE: Framework for Mining Large and Complex Scientific Datasets
软件:挖掘大型复杂科学数据集的框架
  • 批准号:
    0234273
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
CAREER: On the Assessment of Volume Rendering Algorithms in Visual Computing
职业:视觉计算中体积渲染算法的评估
  • 批准号:
    0196242
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Continuing grant
CAREER: On the Assessment of Volume Rendering Algorithms in Visual Computing
职业:视觉计算中体积渲染算法的评估
  • 批准号:
    9734483
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Continuing Grant

相似国自然基金

NGS结合免疫微环境预测肝癌经动脉灌注化疗栓塞(TACE)联合靶免治疗疗效的研究
  • 批准号:
    2023JJ60305
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
基于NGS的HIV分型及耐药基因检测的多中心临床验证
  • 批准号:
    2023JJ60396
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
NGS-MHs 分型体系在肿瘤组织个体识别鉴定中的应用探索
  • 批准号:
    2022JJ30343
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
Alport 综合征新致病基因突变和表观组学的研究及建立以靶向NGS 技术为基础的基因诊断体系
  • 批准号:
    2021JJ70111
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
结合NGS技术小分子污染物纳米抗体研制方法的建立及应用
  • 批准号:
    32001066
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    24.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
基于NGS和AAV基因技术的艾灸对APOE-/-小鼠血小板活化的特异性作用及P2Y嘌呤能受体机制研究
  • 批准号:
    81904286
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    20.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
基于肿瘤干细胞与NGS的小细胞肺癌化疗耐药相关分子机制研究
  • 批准号:
    81972199
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    55.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于NGS发现滇重楼中新的负链RNA病毒及致病性鉴定
  • 批准号:
    81860774
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    34.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
基于NGS的大规模挖掘早期卵巢癌预后的环状RNA分子标志物
  • 批准号:
    81772766
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    55.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

液状化検体細胞診(LBC)検体を用いたNGS解析による口腔がん診断法の確立
使用液化样本细胞学(LBC)样本进行NGS分析建立口腔癌诊断方法
  • 批准号:
    24K13117
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
NGSでは検出困難なUBTF遺伝子縦列重複変異を高感度に検出するPCR検査法確立
建立高灵敏度检测NGS难以检测的UBTF基因串联重复突变的PCR检测方法
  • 批准号:
    24K18639
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Identification of candidate genes for quantitative traits and evaluation of genetic resource diversity of a novel model plant, Setaria, using NGS
利用NGS鉴定新型模式植物狗尾草数量性状候选基因及遗传资源多样性评价
  • 批准号:
    23K05279
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Using new Next Generation Sequencing (NGS) approaches to analyze the fidelity of HIV reverse transcription in Endogenous Reverse Transcription reactions (ERT)
使用新的下一代测序 (NGS) 方法来分析内源性逆转录反应 (ERT) 中 HIV 逆转录的保真度
  • 批准号:
    10759845
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
Novel Urine Sample Collection and Transportation Medical Device Suitable for Measuring the Vaginal Microbiome using Next Generation Sequencing (NGS)
适合使用下一代测序 (NGS) 测量阴道微生物组的新型尿液样本采集和运输医疗设备
  • 批准号:
    10076109
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Collaborative R&D
NGSを利用した染色体異常検出手法の開発と臨床への応用
NGS染色体异常检测方法的开发及临床应用
  • 批准号:
    23K06709
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
光操作技術とNGS解析を用いた神経幹細胞の制御メカニズムの解析
利用光学操纵技术和NGS分析分析神经干细胞的控制机制
  • 批准号:
    23K05792
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
NGS genomic analysis and AI image analysis to elucidate refractory factors in eosinophilic rhinosinusitis.
NGS 基因组分析和 AI 图像分析阐明嗜酸性鼻窦炎的难治因素。
  • 批准号:
    23K08975
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Comprehensive NGS analysis of bacterial flora and drug resistance genes in peri-implant infections and osteomyelitis
种植体周围感染和骨髓炎细菌菌群和耐药基因的综合 NGS 分析
  • 批准号:
    23K08641
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
サンゴは抗菌ペプチドにより共生細菌を選択するのか?NGS解析を駆使した網羅的検証
珊瑚是通过抗菌肽选择共生细菌吗?
  • 批准号:
    23KJ0602
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 80.06万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了