CoCoNUT: Ein Software-System zum multiplen Genomvergleich
CoCoNUT: Ein Software-System zum multiplen Genomvergleich
批准号:
16627878
负责人:
Professor Dr. Enno Ohlebusch
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2005
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2004-12-31 至 2007-12-31
中文摘要
比较基因组学(比较基因组学)是一种比较基因组学(比较基因组学),是一种比较基因组学。在病原菌Sind和Hingegen Net之间,白僵菌对抗菌素的抗性较强。世界上所有的人都是这样的人。Alle derzeit zur Verfügung Stehenden Software-Werkzeuge zum Genomvergleich haben den Nachteil,dass sie auf den paarweisen vergleich bechränkt sind/oder Nur einzelne Aufgaben unterstützen.Daher soll das Software-system Coconut(计算比较基因组学实用工具工具包)包含了一个重要的工具,即das mehrere aufgaben eines plexient Genomvergleichs Effizient unterstützt。Dazu是DNA BZW。amosäuresequenzen,die in Laufe der进化in Allen Genomen konserviert Wurden,MIT neu entwickelten Methoden Effient Ifiziert。他说:“这是一件非常重要的事情,因为这件事发生了。”这是一项非常重要的工作,因为这是一项非常重要的工作。
英文摘要
Die Kernmethode der vergleichenden Genomanalyse (comparative genomics) besteht aus dem Vergleich des Genoms eines Organismus mit dem eines oder mehrerer anderer Organismen (paarweiser bzw. multipler Vergleich). Durch Genomvergleiche versucht man u.a. herauszufinden, warum bestimmte Stämme eines Bakteriums resistent gegen Antibiotika oder pathogen sind, andere hingegen nicht. Diese Vergleiche werden durch die Größe der Datenmengen erheblich erschwert. Alle derzeit zur Verfügung stehenden Software-Werkzeuge zum Genomvergleich haben den Nachteil, dass sie auf den paarweisen Vergleich beschränkt sind und/oder nur einzelne Aufgaben unterstützen. Daher soll das Software-System CoCoNUT (Computational Comparative Genomics Utility Toolkit) entwickelt werden, das mehrere Aufgaben eines multiplen Genomvergleichs effizient unterstützt. Dazu werden DNA bzw. Aminosäuresequenzen, die im Laufe der Evolution in allen Genomen konserviert wurden, mit neu entwickelten Methoden effizient identifiziert. Die gefundenen konservierten Regionen sollen die Grundlage zur Vorhersage von Genomumstrukturierungen und Genen bilden. Die u. U. sehr komplexe Ausgabe des Systems soll durch eine Visualisierungskomponente für den Anwender nutzbar gemacht werden.
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会议论文
Compressed Suffix Trees: Design, Construction, and Applications
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批准号:206825075
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2012
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负责人:Professor Dr. Enno Ohlebusch
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依托单位:
Entwicklung eines Software-Systems zum multiplen Genomvergleich
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批准号:5400557
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项目类别:Priority Programmes
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2003
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负责人:Professor Dr. Enno Ohlebusch
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依托单位:
Pan-Genome Structures: Design, Construction, and Applications
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批准号:403845331
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:--
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负责人:Professor Dr. Enno Ohlebusch
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依托单位:
国内基金
海外基金
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三叶青EIN3/EILs家族基因的成员鉴定及对冷胁迫的调控功能研究
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批准号:HZQN25C130003
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:尹舒雅
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依托单位:
转录调节因子ADA2b调控EIN3转录活性的分子机制研究
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批准号:32300275
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2023
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负责人:郝冬冬
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依托单位:
水稻中葡萄糖-TOR-EIN2信号转导的生物学功能研究
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批准号:--
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2022
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负责人:闫大琦
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依托单位:
CBL1/9-CIPK5-EIN3模块协同钙和乙烯信号调控下胚轴伸长和出土生长的分子机制研究
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:54万元
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批准年份:2022
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负责人:李红
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依托单位:
长春花EIN3/EIL和bHLH转录因子互作介导乙烯和茉莉酸信号调控萜类吲哚生物碱合成的分子机理
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批准号:22ZR1431800
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2022
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负责人:潘琪芳
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依托单位:
乙烯信号转导路径中正调节因子EIN2和EILs基因联合编辑促进大豆早花和改善结荚习性的机制
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:58万元
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批准年份:2021
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负责人:程云清
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依托单位:
NPR1与EIN3拮抗介导高温诱导叶片衰老褪绿的分子机理研究
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批准号:32070323
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2020
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负责人:蒯本科
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依托单位:
拟南芥EIN3/EIL1与FLD互作介导乙烯推迟开花的分子机制
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批准号:31970534
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2019
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负责人:陶增
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依托单位:
EIN3互作蛋白EII6调控拟南芥叶片衰老启动的分子机理
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批准号:31970303
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2019
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负责人:周欣
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依托单位:
拟南芥EIN2核內激活乙烯信号的分子机制研究
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批准号:31970308
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2019
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负责人:温兴
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依托单位: