Systematische Analyse der Rekrutierung von signal-abhängig regulierten Transkriptionsfaktoren an entzündungsrelevante Gene mittels ChIP-Chip Technologie

使用 ChIP 芯片技术系统分析信号依赖性调节转录因子向炎症相关基因的募集

• 批准号: 17607797
• 负责人: Professor Dr. Michael Kracht
• 金额: --
• 依托单位: Rudolf-Buchheim-Institut für Pharmakologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2004-12-31 至 2009-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/17607797?language=en
• 关键词: Systematische; Analyse; der; Rekrutierung; von

Proinflammatorische Stimuli wie Interleukin-1 verändern die Expression von hunderten von Genen während einer Entzündungsreaktion. Obwohl sehr viele dieser Gene zeitlich und mengenmässig koreguliert werden, ergibt sich aus ihrer genomischen DNA Sequenz keine unmittelbare Information über die kombinatorische Verwendung von Transkriptionsfaktoren, durch welche die zytosolische Signaltransduktion in Gentranskription übersetzt wird. Eine wichtige Voraussetzung zur Lösung solcher Fragen ist, für geeignete Gruppen von Entzündungsgenen das Muster der Rekrutierung von Transkriptionsfaktoren an diese Gene zu bestimmen. Aufgrund der Größe des menschlichen Genoms müssen hierfür neue Technologien etabliert und an geeigneten Modellgenen validiert werden.Wir haben in Vorarbeiten zu diesem Antrag zeigen können, dass Interleukin-1 über den ERK Signalweg die mRNA und Proteinmenge von FRA-1, einer bisher nicht in Entzündungsgenregulation implizierten Untereinheit des dimeren Transkriptionsfaktors AP(activating protein)-1, transient hochreguliert. Chromatin Immunpräzipitations (ChIP) Experimente zeigten, dass FRA-1 nachfolgend IL-1-abhängig an den endogenen Interleukin-8 Promoter rekrutiert wird. In diesem Antrag soll die Chromatin IP mit DNA Mikroarrays (Chip) kombiniert werden, um mit Hilfe dieser neuen, sogenannten ChlP-Chip Technik eine möglichst akkurate Erfassung der Bindungsstellen von FRA-1 und seiner heterodimerischen AP-1 Partner in allen weiteren Entzündungsgenen zu ermöglichen, deren mRNA Expression von IL-1 und dem ERK Signalweg abhängt. Die funktionelle Signifikanz der neuen FRA-1 Bindungsstellen wird sodann auf cis Ebene durch Mutagenese in geeigneten genomischen Reportergenkoristrukten, und auf trans Ebene durch Modulation der FRA-1 Menge sowie der Expression von Fusionsproteinen aus FRA-1 und einem zweiten AP-1 Partner überprüft. Ziel ist es, auf diese Art und Weise am Beispiel der FRA-1 Untereinheit ein möglichst genaues Netzwerk der AP-1- abhängigen Entzündungsgenregulation experimentell zu bestimmen.Die beispielhafte Entschlüsselung derjenigen Mechanismen, die die Signaltransduktion in die Aktivierung von einzelnen oder von Gruppen von entzündlichen Genen übersetzen, stellt nicht nur eine wichtige sehr aktuelle Fragestellung für die Grundlagenforschung im Rahmen funktioneller Genomforschung dar, sondern eröffnet auch neue interessante Perspektiven für die selektive Modulation von Entzündungsgenen.

前炎性刺激和白介素1的表达von hunderten von Genen während einer Entzündungsreaktion。我们的基因是这样的，它们的DNA序列是正确的，它们的信息量也是一样的。这是L的一项重要工作，也是一项重要的工作。[参考译文]Aufgrund der Gröçe des menschlichen Genom müssen hierfür Neue Technologien etabliert and a geeigneten modellgenen valideert Wir haben in vorarbeiten zu diesem Antrag zeigen könnnen，dass IL-1über den ERK Signalweg die mRNA and Proteinmenge von FRA-1，einer Bisher Nicht in EntzündungsEntz？ndungsEntz Untereinheit des dimeren Transkrigtionsfaktors AP(激活蛋白)-1，TASS IL-1 den ERK Signalweg die mRNA and Proteinmenge von FRA-1，einer Bisher Nicht in EntzündungsEntz？ndungsEntz？nunggsEntz？ndungsEntz.染色质免疫印迹(CHIP)实验用斑马素、FRA-1、IL-1-ABHängig和内源性IL-8启动子。在Diesem Antrag soll die染色质IP MIT DNA Mikroarns(Chip)kombiniert，um MIT Hilfe dieser neuen，sgenannten ChlP-Chip Technik eine möglichst akkurate Erfassung der Bindungsstellen von FRA-1 and seiner Heterodimerischen AP-1 Partner in Allen weiteren Entzündungsgenen zu ermöglichen，Deren mRNA表达von IL-1 and Dem ERK Signalweg ABHängt。Funktionelle Signifikanz der neuen Fra-1 Bindungsstellen wird sodann auf cis ebene duch Mutagenese in geeigneten genomischen Reportergenkoristrukten，and auf trans ebene duch调制der neuen FRA-1 Menger Sowie der Expression von FusionsProteen Aus Fra-1 and einem Zweiten AP-1 Partnerüberprüft.在此基础上，提出了一种新的技术和方法，并在此基础上提出了一种新的技术方案