Genomweites long-range phasing und parent-of-origin Effekte für Adipositas in Deutschen Sorben

德国索布人肥胖的全基因组长程定相和亲本效应

• 批准号: 213793074
• 负责人: Professorin Dr. Yvonne Böttcher
• 金额: --
• 依托单位: Avdeling for klinisk molekylærbiologi
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2011-12-31 至 2014-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/213793074?language=en
• 关键词: Genomweites; long; range; phasing; und

Genomweite Assoziationsstudien (GWAS) haben in hervorragender Weise zur Identifizierung neuer Kandidatengene für die polygene Adipositas beigetragen. Eine Einschränkung Fall- Kontroll-basierter GWAS ist jedoch die Unsicherheit über die Phase von Allelen/Haplotypen, was heißt, welcher DNA-Strang mütterlicher bzw. väterlicherseits vererbt wurde. Daher werden Allele üblicherweise als austauschbar betrachtet, was grundsätzlich falsch sein könnte. Die homogene Populationsstruktur der Sorben, die sowohl Familien (nahe Verwandte) als auch eine hohe Anzahl entfernt Verwandter birgt, ermöglicht es uns, auf unsere schon vorhandenen genomweiten SNP Daten neue Methoden (long-range phasing und parent of origin Determination) anzuwenden 1,2. Diese beruhen auf einem Konzept der „Surrogat-Elternschaft“ zwischen einem Probanden und zu ihm verwandten Individuen. Das präsentierte Projekt wird umfassen: (i) die korrekte Festlegung der genomweiten Phasen sowie (ii) Untersuchungen zu parent of origin Effekten im FTO Gen in ca. 1000 genotypisierten Sorbischen Individuen. Je nach Vererbung von Mutter oder Vater (parent-oforigin) könnten Allele unterschiedliche Einflüsse auf die Ätiologie der polygenen Genetik der Adipositas haben.

基因组学联合研究（GWAS）是一项对肥胖多基因进行新的鉴别诊断的研究。一个基于控制的GWAS系统可以避免等位基因/单倍型相的不确定性。我们会尽力的。当韦尔登等位基因被激活时，它是错误的。索尔本的同源群体结构，即sowohl Familien（nahe Verwandte）也是一个很好的分析工具，因此我们可以使用新的SNP数据处理方法（长距离定相和起源亲本测定）和1，2。这是一个“代理人的社会”的概念，它是一个被信任的人，也是一个受欢迎的人。Das präsentierte Projekt wird umfassen：（i）die correkte Festlegung der genomweiten Phasen sowie（ii）Untersuchungen zu parent of origin Effekten im FTO Gen in ca. 1000个基因分型个体。我通过Mutter或Vater（父母）的验证，发现等位基因对肥胖症多基因遗传学的影响是非常显著的。