Strukturbildung und -veränderung durch Bindung von Peptiden und Proteinen an Ribonukleinsäuren

通过肽和蛋白质与核糖核酸的结合形成和改变结构

• 批准号: 22566624
• 负责人: Professor Dr. Martin Zacharias
• 金额: --
• 依托单位: Lehrstuhl für Theoretische Biophysik - Molekulardynamik
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2005-12-31 至 2008-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/22566624?language=en
• 关键词: Strukturbildung; und; ver; nderung; durch

Ribonukleinsäuren spielen nicht nur als Träger des genetischen Codes und bei der Synthese der Genprodukte eine wichtige Rolle. In den letzten Jahren trat auch deren Bedeutung und Potenzial bei der Regulierung der Genexpression hervor. Das Binden eines Proteins oder Liganden an RNA ist dabei ein Schlüsselschritt bei einer Vielzahl biologischer Prozesse und ist oftmals mit strukturellen Veränderungen der RNA, aber auch des Proteins selbst verbunden. Ziel dieses Projekts ist es, die Wechselwirkungen zwischen RNA und Proteinen sowie deren gegenseitige strukturelle Beeinflussung besser zu verstehen. Dazu sollen Moleküldynamiksimulationen an experimentell gut charakterisierten RNA-Peptid-Komplexen durchgeführt und die intermolekularen Wechselwirkungen im atomaren Detail untersucht werden. Ein Schwerpunkt ist das Studium der strukturellen und dynamischen Eigenschaften der RNA-Moleküle sowie deren Abhängigkeit von der RNA- bzw. Peptidsequenz, wobei der erweiterte Konformationsraum der vorhandenen nichtkanonischen Motive von besonderem Interesse ist. Des Weiteren sollen Simulationen der Komplexbildung bzw. -dissoziation die Mechanismen der damit einhergehenden Konformationsübergänge in den nichtkanonischen Motiven und den Faltungsprozess der Peptide detailliert beschreiben und somit experimentelle Befunde ergänzen und erklären. Das Projekt soll zum besseren Verständnis der spezifischen RNA-Sequenzerkennung durch Proteine und Liganden beitragen. So ist es beispielsweise mit Computersimulationen möglich, den Mechanismus der bei der Komplexbildung bzw. -dissoziation auftretenden Konformationsänderungen an nichtkanonischen RNA-Motiven bei atomarer Auflösung und hoher zeitlicher Auflösung zu untersuchen. Dies ist bisher durch keine verfügbare experimentelle Methode möglich.

Ribonukleinsäuren spelen nur als Träger des Genetischen Codes BebeSynthes der GenProducdukte eine wichtige Rolle.在我的书房里，你不是在说什么，也不是在说什么。Das Binden eines蛋白质在Schlüsselschritt bebeein Schlüsselschritt be einer Vielzahl Biologisischer Prozesse and ist of tmals MIT Strukturellen Veränderungen der RNA，而不是蛋白质Selbst verbunden。他说：“这是一项伟大的工程，我们不会放弃，我们不会放弃。”[中英文摘要][中英文摘要][晓雨-0920交稿]我们对实验动物的肠道特性进行了动态模拟，并对其进行了详细的分子间相互作用。这是一种新的研究方法，其动力来自于RNA-Moleküle Sowie deren abhänGigkeit von der RNA-BZW。Des weteren Sollen Simulationen der Komplexbildung BZW.-Dimit e Inhergehenden Konformationsübergänge in den Nichtkanonischen Motiven and den Faltungsprozess der肽Detailliert Beschreiben and Somit Examentelle Befunde ergänzen and Erklären.Das Projekt soll zum beseren Verständns der Spezifischen RNA-Sequenzerkennung Dh ch Proteine and Liganden beitragen.因此，这是一个更好的麻省理工学院计算机模拟的Möglich，DEN ECHINISMUS der bebeder der Komplexbildung BZW.-dissoliation auftretenden Konformationdenänderungen an Nichtkanonischen RNA-Motiven Beamer AuflöSong and Hoher zeitlicher AuflöSong zu unterushen.-dissoliation auftretenden konformationdenänderungen an Nichtkanonischen RNA-Motiven beer auflöung and Hoher zeitlicher AuflöSong zu unteruchenher.这是一种新的实验方法。