Genomics and cell biology of highly polyploidic, giant sulfur bacteria

Nach aktuellem wissenstand, die Evolution nur zwei Gruppen von Prokaryoten hervorgebracht, die zu einer extremen Zellgröße von mehreen hundert Mikrometern heranwachsen können - Doktorfischen （epulopisum fishelsonii）和große Schwefelbakterien （z.B. Thiomargarita namibiensis）的共生体。科学家信德seither fasziniert冯估计值riesigen Bakterien, jedoch wurden bisher wenige Untersuchungen祖spezifischen intrazellularen Anpassungsmechanismen gemacht,死得死Ausbildung·冯·所以großen Zellen请您能。Der bisher bekannteste Unterschied zwischen großen und " regulären " Bakterienzellen ist, dass sich das aktive Zytoplasma ausschließlich in iner d<s:1> nnen Schicht am äußeren Rand Der großen Zellen befindet。Außerdem wurde krzlich festgestellt, dass beide Organismengruppen eine große Anzahl von Nukleoiden, d.h. stark confinhtete Partikel aus Nukleinsäuren, besitzen，是darauf hinindeteet， dass große Zellen noch weitere intrazelluläre Abweichungen im Vergleich zu " normal- groen ßen " Bakterien ausgebildet haben。在Epulopiscium-Zellen wurde festgestellt中，我们发现，在Anzahl和Nukleoiden中，我们发现，在基因组方面，我们发现了更多的线索。[j] [j] .疾病与遗传基因的关系。Es wurde vermutet, dass die extreme Polyploidie eine gleichmäßige Versorgung von gentischer Information and eine lokale funktionelle Unabhängigkeit innnerhalb der großen Zelle erlaute。non postliere ich, dass disese extreme Polyploidie auch in den großen Schwefelbakterien existtiert, was ich in diesem project untersuchen möchte。因此，当Kopienzahl在两家公司的基因组服务项目中获得了每一项研究成果时，他的研究结果就变得更加清晰了。1 .当一个人的基因被发现时，他就会发现他的基因被发现了；当一个人的基因被发现时，他的基因被发现了；这技术它一张tiefgreifende分析der intergenomischen Sequenz-Heterogenitat。Ein Seitenprojekt wind ßerdem mit den krzlich entdeckten Introns in den 16S rRNA-Genen der großen Schwefelbakterien befassen - das Gen, das als fundamentales Merkmal fr phylogenetische und Diversitäts-Studien verwendet wind。

Nach aktuellem Wissensstand hat die Evolution nur zwei Gruppen von Prokaryoten hervorgebracht, die zu einer extremen Zellgröße von mehreren hundert Mikrometern heranwachsen können – Symbionten in Doktorfischen (Epulopiscium fishelsonii) und große Schwefelbakterien (z.B. Thiomargarita namibiensis). Wissenschaftler sind seither fasziniert von diesen riesigen Bakterien, jedoch wurden bisher wenige Untersuchungen zu spezifischen, intrazellulären Anpassungsmechanismen gemacht, die die Ausbildung von so großen Zellen erklären können. Der bisher bekannteste Unterschied zwischen großen und „regulären“ Bakterienzellen ist, dass sich das aktive Zytoplasma ausschließlich in einer dünnen Schicht am äußeren Rand der großen Zellen befindet. Außerdem wurde kürzlich festgestellt, dass beide Organismengruppen eine große Anzahl von Nukleoiden, d.h. stark verdichtete Partikel aus Nukleinsäuren, besitzen, was darauf hindeutet, dass große Zellen noch weitere intrazelluläre Abweichungen im Vergleich zu „normal-großen“ Bakterien ausgebildet haben. In Epulopiscium-Zellen wurde festgestellt, dass sich hinter der großen Anzahl an Nukleoiden auch eine Genomkopienzahl von mehreren hundert tausend verbirgt. Diese enorme Anzahl von Genomkopien in einer einzelnen Bakterienzelle ist bisher beispiellos. Es wurde vermutet, dass die extreme Polyploidie eine gleichmäßige Versorgung von genetischer Information und eine lokale funktionelle Unabhängigkeit innnerhalb der großen Zelle erlaubt. Nun postuliere ich, dass diese extreme Polyploidie auch in den großen Schwefelbakterien existiert, was ich in diesem Projekt untersuchen möchte. Mit einer so hohen Kopienzahl geht auch die Frage nach der Genomkonservierung einher, und wird deshalb das Hauptaugenmerk dieses Projekts darstellen. Es werden detaillierte Sequenzvergleiche von ausgewählten Genen sowie ganzen Genomen durchgeführt, wobei nicht nur Einzelzellen sondern auch von Einzelzellen abgeschnittene Zellfragmente für die Sequenzierungen verwendet werden. Diese Technik erlaubt eine tiefgreifende Analyse der intergenomischen Sequenz-Heterogenität. Ein Seitenprojekt wird sich außerdem mit den kürzlich entdeckten Introns in den 16S rRNA-Genen der großen Schwefelbakterien befassen – das Gen, das als fundamentales Merkmal für phylogenetische und Diversitäts-Studien verwendet wird.