The Barcoding project: development of mass sequencing workflows.
The Barcoding project: development of mass sequencing workflows.
批准号:
252243360
负责人:
Professor Dr. Wolfgang W. Weisser
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Infrastructure Priority Programmes
财政年份:
2014
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-12-31 至 2016-12-31
中文摘要
目前,当生态学家想要在物种水平上研究生物多样性时,环境样品中物种的确定是主要障碍之一。从专家分类学家那里获得数据非常困难、耗时,而且往往很昂贵。因此,DNA条形码是一种可以在生态研究和保护生物学方面实现巨大飞跃的方法。然而,在过去的几年里,我们经历了专家分类学家在条形码项目中的合作犹豫不决,主要是因为他们害怕被机器取代(尽管没有机器拥有专家的生物学知识)。这就是条形码数据库增长缓慢的原因之一。对于德国,新的GBOL项目将致力于为德国动物群汇编一个数据库。为了绕过这些障碍,我们建议开发使用探索实验室的Diptera进行大规模测序和反向分类的工作流程,以变得更加独立于不完整的数据库,并提高样本分析的成本效益。从我们的观点来看,这是获得复杂群落物种水平有效数据的最佳方式。
英文摘要
The determination of species in environmental samples is currently one of the major impediments whenever ecologists want to study biodiversity at species level. It is very difficult, time-consuming, and often expensive to get data from expert taxonomists. DNA-barcoding is therefore a method that will allow a quantum leap in ecological research and conservation biology. However, during the past years we experienced that expert taxonomists hesitate to cooperate in barcoding projects, mainly because they fear to be replaced by machines (though no machine has the biological knowledge of an expert). This is one of the reasons why barcode databases only grow slowly. For Germany, the new GBOL project will pursue the compilation of a database for the German fauna. To circumvent the impediments, we propose to develop workflows for mass sequencing and reverse taxonomy using Diptera from the Exploratories to become more independent of incomplete databases and to improve the cost-efficiency of sample analyses. From our point of view this is the best way to get efficiently data at species level for complex communities.
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会议论文
Rapid Biodiversity Assessment using DNA Barcodes in Exploratories: A case study on Diptera
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批准号:193468294
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项目类别:Infrastructure Priority Programmes
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2011
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负责人:Professor Dr. Wolfgang W. Weisser
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依托单位:
Database and Synthesis
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批准号:172191897
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项目类别:Research Units
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2010
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负责人:Professor Dr. Wolfgang W. Weisser
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依托单位:
Aboveground herbivores (EuroDIVERSITY 260)
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批准号:19739029
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2006
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负责人:Professor Dr. Wolfgang W. Weisser
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依托单位:
Consumer - interaction webs and the effect of aboveground vertebrates and invertebrates on ecosystem processes
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批准号:5347940
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项目类别:Research Units
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2002
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负责人:Professor Dr. Wolfgang W. Weisser
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依托单位:
Costs of alarm signalling in aphids
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批准号:5332147
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项目类别:Research Grants
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2001
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负责人:Professor Dr. Wolfgang W. Weisser
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依托单位:
国内基金
海外基金
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CBP/p300-HADH轴在基础胰岛素分泌调节中的作用和机制研究
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批准号:82370798
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:王晓
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依托单位:
CD8+T细胞亚群在抗MDA5抗体阳性皮肌炎中的致病机制研究
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批准号:82371805
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项目类别:面上项目
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资助金额:45.00万元
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批准年份:2023
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负责人:扶琼
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依托单位:
基于MFSD2A调控血迷路屏障跨细胞囊泡转运机制的噪声性听力损失防治研究
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批准号:82371144
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项目类别:面上项目
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批准年份:2023
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负责人:汪雪玲
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OBSL1功能缺失导致多指(趾)畸形的分子机制及其临床诊断价值
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批准号:82372328
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:项盈
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批准号:82371760
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项目类别:面上项目
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批准年份:2023
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负责人:王静
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依托单位:
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批准号:31171213
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2011
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负责人:邓亮生
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依托单位: