Dissecting a transcriptional domain

剖析转录域

• 批准号: 21H04765
• 负责人: 宮成 悠介
• 金额: $ 26.62万
• 依托单位: Kanazawa University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-05 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H04765/
• 关键词: エピジェネティクス; クロマチン; 転写

CTCFによる転写ドメインの機能解析を目的として、まずCTCFノックイン細胞を樹立した。この細胞では、CTCFのN末端とC末端にそれぞれ異なるタグ配 列(FLAG or ALFA)を融合したものであり、自作したタグ配列に対するリコンビナント抗体を用いてmulti-CUT&TAGの解析をおこなった。その結果、CTCFのクロマチンへの結合方向を同定することに成功した。この結果は、我々の作成したコンパクトなリコンビナント抗体を用いることで、より解像度高く標的の結合様式を解析できることを示唆しており、当初予定していた細胞内における転写複合体の解析のための大きな基盤技術となる。また昨年度にクロマチン制御因子として同定したTFDP1の機能解析をすすめたところ、TFDP1が直接クロマチンアクセシビリティを制御しているのではなく、その下流の遺伝子群ヒストンの転写制御を担っていることが明らかとなった。TFDP1をノックアウトすることによって、ヒストンの転写量が一定量下がり、ゲノム全体のクロマチンアクセシビリティが上昇するのだろうと結論づけた。本研究成果を国際誌に発表すべく、現在データを取りまとめている。また、クロマチンアクセシビリティを人為的に操作することによって、DNAに関連する様々な細胞機能改変への応用をこころみた。具体的には、Cas9がDNAへと結合することが必要なゲノム編集、山中4因子がクロマチンへと結合することが必要なiPSリプログラミングについて、アクセシビリティの人為操作が与える影響をしらべたところ、いずれの場合もその効率を改善させることに成功した。

The purpose of analyzing the function of CTCF is to set up CTCF cells. The N-terminal and C-terminal regions of CTCF are fused and self-aligned (FLAG or ALFA). The result is that CTCF's combination direction is the same. The result is that we have to create a complex for antibody analysis with high resolution. We have to show that we have to create a complex for intracellular analysis with high resolution. The function analysis of TFDP1 in the previous year was carried out in the following way: TFDP1 is the most important part of the project. The results of this study are presented in the international journal. The human condition is not stable. Specific Cas9 DNA binding is necessary for compilation, 4 factors in the mountain, and human manipulation is necessary for improvement of the efficiency of the application.

项目成果

Imaging Chromatin Accessibility by Assay of Transposase-Accessible Chromatin with Visualization

通过可视化检测转座酶可及染色质来成像染色质可及性

• DOI: 10.1007/978-1-0716-2724-2_7
• 发表时间: 2022
• 期刊: Methods in Molecular Biology
• 作者: 森下和浩;渡邊謙吾;名黒功;一條秀憲;Miyanari Yusuke
• 通讯作者: Miyanari Yusuke

Borealin-Derived Peptides as Survivin-Targeting Cancer Imaging and Therapeutic Agents

• DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.2c00398
• 发表时间: 2022-11-01
• 期刊: BIOCONJUGATE CHEMISTRY
• 影响因子: 4.7
• 作者: Nozaki, Iori;Ishikawa, Natsumi;Fuchigami, Takeshi
• 通讯作者: Fuchigami, Takeshi