Virus-driven clockwork in lower tropic level marine ecosystem and its impact on the ocean
低热带海洋生态系统中病毒驱动的发条装置及其对海洋的影响
基本信息
- 批准号:21H05057
- 负责人:
- 金额:$ 122.05万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-07-05 至 2026-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
海洋において光合成微生物へのウイルス感染に日周性を見出した。そこで、娘ウイルス放出に伴って漏出される光合成産物(=有機物)を起点として、海洋低次生態系全体へ及ぶ日周性をはじめとする周期性をオミックス解析により検出し、その分子機構を解明する。本年度の研究成果は、以下の通りである。(1)大阪湾口部・採水地点における原核生物優占種・ウイルスの調査から、原核生物優占種のほぼすべての系統において細胞密度が増すと頻度依存的にウイルス被感染度が上昇することを見出した。また、赤潮藻類に感染するウイルスに特異的なプライマーの作成にも成功し、頻度依存的なウイルスの影響を淡水生態系でも確認した。(2)同海域においてシアノバクテリアSynechococcus属と従属栄養性古細菌MGIIにおいて、優占系統はそれぞれ1系統と4系統に限定され、前者には2属 150個余のウイルスを、後者1系統に2属 8個のウイルスペアを同定した。これらにおいてそれぞれ宿主の光合成遺伝子と増殖関連遺伝子とウイルス遺伝子の転写動態は相関し、日周性があることが示された。(3)同海域より、セルソーターを用いて、本海域の主要一次生産者と考えられる原核生物画分に回収されるピコ真核緑藻を濃縮し、その培養に成功した。本種のオルガネラゲノム・ウイルスゲノム断片を解読し、上記の原核生物画分メタトランスクリプトームを用いることで本種の日周期的転写活動をとらえることに成功しつつある。(4)メソコズム実験により、赤潮形成藻類種の違いにより、系統的に異なる原核生物の増殖を促し、それらの原核生物感染性ウイルスの動態にまでその差異が影響することを明らかにした。さらにウイルス感染した赤潮形成藻H. akashiwo細胞に分岐鎖アミノ酸が蓄積し、本アミノ酸を特異的に利用可能な魚介類病原性原核生物の増殖を促進するという分子機構の一端を捉えることに成功した。
In the ocean, photosynthetic microorganisms are infected on a daily basis. The starting point of photosynthate (= organic matter), the total number of marine low-grade plants, and the periodic cycle of the whole system of marine low-grade plants were released by the partner and the mother. The analysis of the periodicity was carried out, and the molecular mechanism was used to understand it. The research results of this year are listed below. The main results are as follows: (1) at the water site at the Osaka Bay Estuary, prokaryotes occupy species in the Osaka Bay estuary, and prokaryotes occupy the system in which the cell density is dependent on the degree of contagion. The infection of red tide algae and red tide algae has been successful and highly dependent on the production of freshwater products. (2) it is the same as that of Synechococcus in the sea area, which belongs to the genus MGII, occupies the limited system of system 1, system 4, the former belongs to 2, and the latter 1 belongs to 8, respectively. The host plant photosynthates, colonizes, colonizes, writes the dynamic phase, and the daily cycle is displayed. (3) in the same sea area, in the same sea area. This instrument is used to analyze the fragments and the prokaryotes in the last part of the book. The activity of this daily cycle has been successfully read. (4) the formation of red tide, the formation of red tide, the colonization of prokaryotes in the system, the infection of prokaryotes in prokaryotes and the infection of prokaryotes. Red tide-forming algae H. akashiwo cells differentiate, acid accumulates, and pathogenic prokaryotic colonization is used to promote the proliferation of pathogenic prokaryotes at one end of the molecular mechanism.
项目成果
期刊论文数量(21)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Prevalence of Viral Frequency-Dependent Infection in Coastal Marine Prokaryotes Revealed Using Monthly Time Series Virome Analysis.
- DOI:10.1128/msystems.00931-22
- 发表时间:2023-02-23
- 期刊:
- 影响因子:6.4
- 作者:
- 通讯作者:
大阪湾における優占シアノバクテリア感染性ウイルスの日周感染動態の解明
阐明大阪湾优势蓝藻病毒的昼夜感染动态
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:芦谷朋香;西門航平;富永賢人;武部紘明;藤原健太郎;福山宥斗;礒崎達大;山本圭吾;神川龍馬;吉田天士
- 通讯作者:吉田天士
Identification of key virus?prokaryote infection pairs that contribute to viral shunt in a freshwater lake
鉴定导致淡水湖中病毒分流的关键病毒?原核生物感染对
- DOI:10.1101/2023.02.05.527221
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Shen Shang;Tominaga Kento;Tsuchiya Kenji;Matsuda Tomonari;Yoshida Takashi;Shimizu Yoshihisa
- 通讯作者:Shimizu Yoshihisa
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吉田 天士其他文献
Parageobacillus属細菌における一酸化炭素利用能の多様性
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- DOI:
- 发表时间:
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- 作者:
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- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
- 作者:
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- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
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左子 芳彦
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产氢一氧化碳氧化细菌Parageobacillus sp. G301菌株的生理特性和基因组分析。
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
日野 太貴;井上 真男;谷村 あゆみ;岡元 俊輔;吉田 天士;左子 芳彦 - 通讯作者:
左子 芳彦
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$ 122.05万 - 项目类别:
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- 资助金额:
$ 122.05万 - 项目类别:
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- 批准号:
12J01138 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 122.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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$ 122.05万 - 项目类别:
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16580150 - 财政年份:2004
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$ 122.05万 - 项目类别:
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- 批准号:
16651111 - 财政年份:2004
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$ 122.05万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research














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