SATIC法による細胞内マイクロRNAイメージング技術の開発
利用 SATIC 方法开发细胞内 microRNA 成像技术
基本信息
- 批准号:21K05317
- 负责人:
- 金额:$ 2.66万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本法ではこれまでにmRNAの特異的検出系の開発を行ってきたがmRNAとは異なり、miRNAは20mer程度の短鎖であるため、増幅反応における開始複合体の形態を最近接塩基対パラメータ(nearest neighbor parameters)を用いた核酸の安定性予測に基づき種々検討した。miRNA標的の検出系では、標的のヌクレオチド鎖と検出試薬のひとつである捕捉ヌクレオチド鎖との解離・結合によるターンオーバーがないため、検出感度は概して長鎖のmRNA標的よりも劣ることが当初より分かっていた。しかし、本研究において、シグナル増幅をもたらすポリメラーゼ反応による増幅配列の最適化を行ったり、φ29DNAポリメラーゼやBst DNAポリメラーゼ、KOD DNAポリメラーゼなど用いる酵素やその組み合わせ等を変更したりすることにより反応効率を高めることができ、当該問題について解決の目途が付けられた。さらに、配列が異なる複数の標的を同時に検出するための蛍光プローブであるチオフラビンT誘導体やマラカイトグリーン等の誘導体を新たに得ることができた。マラカイトグリーンは発光波長がチオフラビンTよりも長波長にあり(λem = 630nm)、従来、核酸プローブとして使用されてきたが、疎水性が高く非特異的な吸着等の問題があった。本研究では、エチレングリコール鎖等の導入により親水性を高めた誘導体を設計・合成することができた。
In this law, the export system of the mRNA program is responsible for the short-term distribution of the mRNA, the 20mer of the miRNA, and the number of customers. At the beginning of the reaction, the complex is recently connected to the base station (nearest neighbor parameters), which is stable to all kinds of basic materials with nucleic acid. The system of the miRNA system, the system of the mRNA, the system of the device, the system of the device, the In this study, the results of this study show that there is a significant increase in the rate of response, such as the most accurate response, φ 29DNA response, Bst DNA response, KOD DNA response, and so on. in this study, we compared the results in this study. When the problem is solved, you will pay for it on the way. At the same time, you need to change the number of copies of the system, and at the same time, you need to change the number of copies. At the same time, you need to change the number of copies of the system. The optical wavelengths are sensitive to the optical wavelengths (λ em = 630nm), and the nucleic acids are sensitive to the use of photoluminescence, water-borne and non-specific absorption, and so on. The purpose of this study is to design and synthesize the design of the water-based high-temperature equipment in this study, such as the design and synthesis of the water-based high-temperature equipment.
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
等温遺伝子増幅法におけるマルチプレックス検出に向けたグアニン四重鎖結合性蛍光色素の検討
研究用于等温基因扩增方法中多重检测的鸟嘌呤四链体结合荧光染料
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:青野 晴美;二村 友史;堀 康宏;室井 誠;平野 弘之;西浦 正芳;侯 召民;木野 邦器;長田 裕之;藤田博仁,田村美雪,桑原正靖
- 通讯作者:藤田博仁,田村美雪,桑原正靖
新規バイオマーカー検出法(SATIC 法)の開発と今後
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- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:善明直輝;松本侑也;安田斉弘;内之宮祥平;進藤直哉;田畑香織;王子田彰夫;桑原正靖
- 通讯作者:桑原正靖
マラカイトグリーン結合性DNAアプタマーのセレクションおよび蛍光特性評価
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- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:松尾祐冶;永浦智樹;内之宮祥平;王子田彰夫;田村美雪,藤田博仁,桑原正靖
- 通讯作者:田村美雪,藤田博仁,桑原正靖
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