神経幹細胞特異的なエンハンサーによる遺伝子発現制御機構の解明

神经干细胞特异性增强子阐明基因表达控制机制

• 批准号: 21K06396
• 负责人: 佐野坂 司
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06396/
• 关键词: エンハンサーRNA; エピジェネティクス; 神経幹細胞

本研究課題では、神経幹細胞特異的エンハンサーの同定に加え、その中でもエンハンサー活性を持っている真のエンハンサーの同定を試みている。近年、エンハンサー領域からはenhancer RNA(eRNA)と呼ばれるnon-coding RNAが発現しているという報告がなされていることから、そのeRNAの発現を条件として候補領域を探索し、初年度に705箇所同定している。また、eRNAとmRNAの発現を1細胞レベルで解析可能なRamDA-Seqを行い、エンハンサーの標的遺伝子の同定を試み、既知遺伝子に加え、新規の標的候補遺伝子を複数同定している。本年度は、これらの同定した候補領域におけるエンハンサー活性制御機構を解析する為に、このeRNA発現領域に結合しうる因子をChIP-Seqデータベースを用いて網羅的に探索し、数種類の候補転写因子を同定した。

This research topic is to test the activity of neural stem cell-specific cells. In recent years, 705 candidate areas were explored in the first year of 2011, and the conditions for the occurrence of non-coding RNA(eRNA) were reported. The expression of eRNA and mRNA in a cell can be analyzed by RamDA-Seq, identification of target genes, addition of known genes, and multiple identification of candidate genes for new targets. This year, the number of candidate factors in the same candidate area was determined by analyzing the number of candidate factors in the same candidate area.

项目成果

Chromatin remodeler CHD7 targets active enhancer region to regulate cell type-specific gene expression in human neural crest cells.

染色质重塑剂 CHD7 靶向活性增强子区域，调节人神经嵴细胞中细胞类型特异性基因表达。

• DOI: 10.1038/s41598-022-27293-6
• 发表时间: 2022-12-31
• 期刊: Scientific reports
• 影响因子: 4.6