Single-Cell RNA sequenceによるARDS病態の網羅的探索

使用单细胞 RNA 测序全面搜索 ARDS 病理学

• 批准号: 21K09026
• 负责人: 本澤 大志
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Yokohama City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K09026/
• 关键词: ARDS; 肺胞洗浄液; RNA sequence; RNA; 気管支肺胞洗浄液

現時点で16例のARDS症例から末梢血と肺胞洗浄液を収集することに成功した。肺胞洗浄液に含まれる細胞からRNAの抽出を試み、解析に耐えうる抽出を行うことができた13例についてトランスクリプトーム解析を行い、得られた遺伝子データを深層学習にて解析し、ARDSの病態解析を行った結果、いくつかの異なる病態機序を見出した。これらの情報をもとに細胞個別の評価が可能となるsingle cell RNA sequenceを計画している。ARDSの病態において重要な細胞遺伝子情報が何であるか、ARDSを分子生物学的に新たに分類できないか探っていく。また、追加検体の収集についても引き続き尽力していく。

At present, で16 cases of severe ARDS have ら peripheral blood と lung cell lavage fluid を collection する とに とに successful <s:1> た. Lung cell liquid at に containing ま れ る cells か ら RNA の spare を try み, analytical に え う る spare line を う こ と が で き た 13 cases に つ い て ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム parsing を い, have ら れ た heritage 伝 son デ ー タ を deep learning に て し, ARDS の pathological parse を line っ た results, い く つ か の different な る pathological machine sequence を shows し た. こ れ ら の intelligence を も と に cells individual の review 価 が may と な る single cell RNA sequence を project し て い る. ARDS の pathological に お い て important な cells survived 伝 what child intelligence が で あ る か, ARDS を molecular biology に new た に classification で き な い か agent っ て い く. Youdaoplaceholder0, add 検 text to the <s:1> collection に また て て て cite 続 続 続 try every possible effort to <s:1> て く く.