Genomic and epigenomic analysis of high-risk neuroblastoma and its application for the cancer genome medicine

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本研究では、難治性神経芽腫について、分子的背景の解明と、がんゲノム医療における精度の高いリスク分類システムの構築を目的に以下を進めた。日本小児がん研究グループ神経芽腫委員会が実施した高リスク神経芽腫臨床試験の登録例95例について、臨床情報の収集と、小児がん用がん遺伝子パネルを用いた遺伝子変異検索、ゲノムコピー数異常解析によるデータ取得を完了した。欧州のグループから報告されたultra-high-riskマーカー（age>5y、高LDH、転移部位２箇所以上）について検証した結果、年齢因子については有意差が認められず、日本人症例に合ったマーカーの見直しが必要であることが示された。がんゲノム医療では再発腫瘍の解析がその後の治療戦略を構築する上で非常に重要となっているが、神経芽腫の再発時には必ずしも再発腫瘍の外科的切除や生検は行われておらず、組織バンク保存数は多くない。そこで、2021年度にとりまとめた605例の日本人過去症例のデータについて、再発検体の有無と、品質、ゲノムデータについて比較し、再発時に追加されたゲノム異常やbreakpoint数 (BP)について検討を行った。初発ー再発（または増悪）のペアは30例あり、採取間隔は3-75ヶ月（中央値 24 ヶ月）、24例（80%）のペアがCGHの評価が可能であった。BPは13例が増加（+1から+17, 中央値+5）、5例が減少（-2から-4）であり、1p、11q のloss、MYCN増幅、1q、7q、17q のgain等のゲノム異常が追加された。今後さらに遺伝子変異やテロメア異常などのプロファイルを追加する予定である。再発時の約半数にBPの増加が見られたことから、その後の治療選択に重要な情報をもたらす再発時検体の経時的な収集は非常に重要であると考えられた。