小児癌由来遺伝子材料を基盤とした疾病関連遺伝子の探索と病態解明への応用
小児癌由来遺伝子材料を基盤とした疾病関連遺伝子の探索と病態解明への応用
批准号:
20018028
负责人:
大平 美紀
金额:
$5.38万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2009
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神経・肝の発生分化における遺伝子発現ネットワークの解明と、神経芽腫・肝芽腫の発生および疾患メカニズムの解明を目指し、本年度は以下を進めた。1) 神経芽腫腫瘍サブセット間における発現量の異なる遺伝子の解析神経芽腫の予後の異なるサブセット間で発現に差のある700個の遺伝子群から、LMO3、HEN2などの癌遺伝子、神経芽腫の分化・増殖に関与するがん抑制遺伝子TSLC1や新規遺伝子BMCC1など18種類以上の遺伝子を同定・解析してきた。今回遺伝子発現プロファイルとゲノム異常を組み合わせた解析により、進行神経芽腫で高頻度に増加する17q25領域の非コードRNA、ncRANを同定し、解析を進めた。ncRANはmRNA発現レベルが予後不良タイプの神経芽腫で有意に高く、過剰発現時に神経芽腫細胞のコロニー形成能を亢進し、ノックダウン時に細胞増殖が抑制されることから、ncRANの高発現は、神経芽腫の細胞増殖亢進に関与していることが示唆された。2) 神経発生分化関連転写因子群の神経芽腫細胞における遺伝子発現解析癌遺伝子LMO3やMYCNが関わるMASH1などの神経発生・分化関連転写因子群の転写制御機構について解析を進めた。発生初期の神経組織におけるこれらの遺伝子の発現の追跡を目的に、遺伝子導入マウス胚の作製を進め表現型の詳細な解析を行った。3) 診断用チップの臨床応用全国の小児がん臨床施設の協力を得て、千葉県がんセンター研究所にて独自に開発した神経芽腫の診断チップ(過去の症例に対する予後予測効率:約90%)の検証を進めた。新規登録症例を含め約170症例のデータを蓄積し、患者予後のフォローアップを行った。一方、昨年度までの188例の神経芽腫のアレイCGH法によるゲノムコピー数異常の解析から、リンパ腫や肺がんなどで融合遺伝子を形成し細胞増殖の亢進に関与することが報告されているチロシンキナーゼ遺伝子ALKの増幅と変異が見つかった。ALK変異を持つ神経芽腫症例については,今後阻害剤を導入した新規治療法の開発が期待される。本研究の腫瘍リスク分類アルゴリズム構築においてALK遺伝子変異のファクターを取り入れるため、300例についてALK遺伝子異常の有無を検索し、予後への寄与について評価を行った。
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遺伝子発現プロファイルに基づく神経芽腫の予後予測ミニチップシステム
基于基因表达谱预测神经母细胞瘤预后的微型芯片系统
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大平美紀, 他8名]
通讯作者:
他8名
DOI:
10.1038/sj.onc.1211032
发表时间:
2008-06-01
期刊:
ONCOGENE
影响因子:
8
作者:
[Li, Y., Ozaki, T., Nakagawara, A.]
通讯作者:
Nakagawara, A.
Practical Application and Validation of a Customized Expression Microarray-based Diagnostic System toward the New Risk Classification of Neuroblastoma
基于定制表达微阵列的诊断系统对神经母细胞瘤新风险分类的实际应用和验证
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大平美紀, 他16名]
通讯作者:
他16名
DOI:
10.1038/nature07399
发表时间:
2008-10-16
期刊:
NATURE
影响因子:
64.8
作者:
[Chen, Yuyan, Takita, Junko, Ogawa, Seishi]
通讯作者:
Ogawa, Seishi
High expression of ncRAN, along non-coding RNA mapped to 17q25, is associated with aggressiveness and poor pronosis of neuroblastoma.
ncRAN 沿着映射到 17q25 的非编码 RNA 的高表达与神经母细胞瘤的侵袭性和不良预后相关。
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大平美紀, 他10名]
通讯作者:
他10名
共 19 条
Genomic and epigenomic analysis of high-risk neuroblastoma and its application for the cancer genome medicine
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批准号:20K08269
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.83万
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财政年份:2020
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负责人:大平 美紀
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依托单位:
小児癌由来遺伝子材料を基盤とした疾病関連遺伝子の探索と病態解明への応用
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批准号:18018042
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.54万
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财政年份:2006
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负责人:大平 美紀
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依托单位:
小児癌由来遺伝子材料を基盤とした疾病関連遺伝子の探索と病態解明への応用
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批准号:17019066
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2005
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负责人:大平 美紀
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依托单位:
小児癌由来cDNAチップを用いた正常個体発生の遺伝子発現ネットワークの網羅的解析
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批准号:16012264
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2004
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负责人:大平 美紀
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依托单位:
神経芽腫におけるゲノム変化の網羅的検索とそこからの癌関連遺伝子及び予後因子の同定
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批准号:15790549
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2003
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负责人:大平 美紀
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依托单位:
小児癌由来cDNAチップを用いた正常個体発生の遺伝子発現ネットワークの網羅的解析
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批准号:15012254
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.48万
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财政年份:2003
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负责人:大平 美紀
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依托单位:
神経特異的DNAチップの作製と神経発生の遺伝子発現ネットワークの網羅的解析
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批准号:13204092
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$4.48万
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财政年份:2001
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负责人:大平 美紀
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依托单位:
海外基金