Clinical characteristic and molecular epidemiology of high-risk clone Bacillus cereus ST1420
高危克隆蜡样芽胞杆菌ST1420的临床特征及分子流行病学
基本信息
- 批准号:20K08853
- 负责人:
- 金额:$ 2.75万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2020
- 资助国家:日本
- 起止时间:2020-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
今年度、異なる医療機関の血流感染症患者由来10株および病院給食由来株2株を入手しゲノム解析を実施した。MLST解析から血流感染症患者由来株10株のうち4株はST365-complexに属していた。当初日本国内でのハイリスククローンと考えられたST1420 はallele番号では62-1-93-109-55-102-210となりST365の34-1-32-1-18-33-24とは1alleleのみの一致であるため、allele番号の一致数による分類であるST365-complexには属しない。しかし、昨年度同様、7つのalleleをすべて連結したconcatenate配列の系統解析とPriestらの分類名に基づくと、ST1420とST365 complexはいずれもB. anthracisに近縁とされるclade1のCereusIIIに属していた。ST365 complexに属する株は国内の異なる地域の医療機関より散発的に分離されており、血流感染症の割合が高かった。今年度解析を行った、ST365 complexに属する株のうち2株は新規alleleを含む新規STであった。B. cereus血流感染症や院内感染事例の報告は海外に比べ日本からが多いこと、ハイリスククローンとして報告されたST1420も新規STであったことから、我が国特有のB. cereus系統株が国内に広く存在し、感染症、特に血流感染を引き起こしている可能性が示唆された。さらに、今年度の臨床情報の収集からB. cereusの血流感染症は採血時の汚染との鑑別が困難な症例から、数日で死に至る転帰となる劇症型の症例に分かれ、この劇症型血流感染症とST365-complexとの関与が示唆された。今後はこれら劇症型血流感染症由来の菌株のゲノム配列上の特徴を明らかにし、病原因子および検出に有用な遺伝子配列の検証を行う。
This year, 10 strains were obtained from なる medical institutions with infectious diseases due to infectious diseases. 2 strains were provided to the hospital by を. <s:1> ゲノム analysis を implementation た. MLST analysis: 10 strains of <s:1> うち4 strains of <s:1> ST365-complexに from patients with ら bloodstream infection, <s:1> て た た た. At that time, in Japan, で, ハ, リス, リス, ロ, ロ, と, と took the えられたST1420 exam は allele mash で は 3-109-55-102-210 62-1-9 と な り ST365 の 34-1-3-33-2-1-18 24 と は 1 allele の み の consistent で あ る た め, の allele our consistent に よ る classification で あ る ST365 - complex に は genus し な い. <s:1> をすべて, similar to last year, 7 <s:1> alleleをすべて linked to たconcatenate allocation <s:1> system analysis とPriestら <s:1> classification name に base づくと, ST1420とST365 complex ずれ ずれ ずれ B. anthracisに is closely related to とされるclade1 and <s:1> CereusIIIに. ST365 complex に genus す る strains は domestic の different な る regional medical machine の masato よ り に separation of scattered 発 さ れ て お り, blood flow adapting just-in-time inventory の cut and high が か っ た. This year's analysis: を rows った, ST365 complexに belongs to する strains, <s:1> うち2 strains った new regulation alleleを contains む new regulation STであった. B. cereus blood adapting just-in-time inventory や nosocomial infection cases の report は に overseas than べ Japan か ら が more い こ と, ハ イ リ ス ク ク ロ ー ン と し て report さ れ た ST1420 も new rules ST で あ っ た こ と か ら, I が characteristic の B. Cereus strain system が domestic に hiroo く exist し bloodstream infections, adapting just-in-time inventory, special に を led き up こ し て い が る possibility in stopping さ れ た. さ ら に clinical information, our の の 収 set か ら b. cereus の blood adapting just-in-time inventory は の pollution when blood と の identify が difficult cases な か ら, days で に to death る planning 帰 と な る play USES cases の に points か れ, こ の play USES blood adapting just-in-time inventory と ST365 - complex と の masato and が in stopping さ れ た. Future は こ れ ら play USES blood adapting just-in-time inventory origin の strains の ゲ ノ ム column deserve の, 徴 を Ming ら か に し, pathogenic factor お よ び 検 out useful に な heritage 伝 with sequence の 検 line card を う.
项目成果
期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
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