Clinical characteristic and molecular epidemiology of high-risk clone Bacillus cereus ST1420

高危克隆蜡样芽胞杆菌ST1420的临床特征及分子流行病学

基本信息

批准号：
20K08853
负责人：
鈴木里和
金额：
$ 2.75万
依托单位：
National Institute of Infectious Diseases
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

今年度、異なる医療機関の血流感染症患者由来10株および病院給食由来株2株を入手しゲノム解析を実施した。MLST解析から血流感染症患者由来株10株のうち4株はST365-complexに属していた。当初日本国内でのハイリスククローンと考えられたST1420 はallele番号では62-1-93-109-55-102-210となりST365の34-1-32-1-18-33-24とは1alleleのみの一致であるため、allele番号の一致数による分類であるST365-complexには属しない。しかし、昨年度同様、7つのalleleをすべて連結したconcatenate配列の系統解析とPriestらの分類名に基づくと、ST1420とST365 complexはいずれもB. anthracisに近縁とされるclade1のCereusIIIに属していた。ST365 complexに属する株は国内の異なる地域の医療機関より散発的に分離されており、血流感染症の割合が高かった。今年度解析を行った、ST365 complexに属する株のうち2株は新規alleleを含む新規STであった。B. cereus血流感染症や院内感染事例の報告は海外に比べ日本からが多いこと、ハイリスククローンとして報告されたST1420も新規STであったことから、我が国特有のB. cereus系統株が国内に広く存在し、感染症、特に血流感染を引き起こしている可能性が示唆された。さらに、今年度の臨床情報の収集からB. cereusの血流感染症は採血時の汚染との鑑別が困難な症例から、数日で死に至る転帰となる劇症型の症例に分かれ、この劇症型血流感染症とST365-complexとの関与が示唆された。今後はこれら劇症型血流感染症由来の菌株のゲノム配列上の特徴を明らかにし、病原因子および検出に有用な遺伝子配列の検証を行う。

今年，从不同医疗机构的血液感染患者和医院午餐的两种菌株中获得了10种菌株，并进行了基因组分析。从MLST分析中，来自血流感染患者的10种菌株中有4种属于ST365-复合物。 ST1420, which was initially considered a high-risk clone within Japan, is 62-1-93-109-55-102-210 with allele numbers, and is a match of only 1 allelele with 34-1-32-1-18-33-24 in ST365, so it does not belong to ST365-complex, which is a classification based on the number of matches in allele numbers.然而，与上一年一样，基于连接序列的系统发育分析，该分析与所有七个等位基因的串联，以及Priest等人的分类名称，ST1420和ST365复合物都属于Clade1的Cereusiii，属于Clade1的Cereusiii，这被认为与B. annthracis紧密相关。属于ST365复合物的菌株与该国不同地区的医疗机构偶数分离，并具有更高的血液感染率。今年对ST365综合体的两种菌株进行了分析，是包含新等位基因的新ST。与海外相比，日本据报道，据报道，日本有更多的蜡状芽孢杆菌血流感染和医院获得的感染病例，据报道，ST1420也是一种新的ST，这也是一种新的ST，这表明在日本中广泛存在于日本独有的Cereus菌株，可能引起感染性衰竭，尤其是血链感染。此外，今年的临床信息收集导致了蜡状芽孢杆菌血液感染的分裂，这些病例与很难与收集血液中的污染相区别到具有暴发类型的病例，这可能会在几天内导致死亡，这表明这种富曼类型的血流感染和ST365-complex的参与。将来，将揭示这些菌株的基因组序列特征，并将揭示出可用于检测的致病因素和基因序列。