Clinical characteristic and molecular epidemiology of high-risk clone Bacillus cereus ST1420

高危克隆蜡样芽胞杆菌ST1420的临床特征及分子流行病学

• 批准号: 20K08853
• 负责人: 鈴木 里和
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K08853/
• 关键词: Bacillus cereus; 血流感染症; 院内感染; 血流感染; Bacillus cereus血流感染; ハイリスククローン

今年度、異なる医療機関の血流感染症患者由来10株および病院給食由来株2株を入手しゲノム解析を実施した。MLST解析から血流感染症患者由来株10株のうち4株はST365-complexに属していた。当初日本国内でのハイリスククローンと考えられたST1420 はallele番号では62-1-93-109-55-102-210となりST365の34-1-32-1-18-33-24とは1alleleのみの一致であるため、allele番号の一致数による分類であるST365-complexには属しない。しかし、昨年度同様、7つのalleleをすべて連結したconcatenate配列の系統解析とPriestらの分類名に基づくと、ST1420とST365 complexはいずれもB. anthracisに近縁とされるclade1のCereusIIIに属していた。ST365 complexに属する株は国内の異なる地域の医療機関より散発的に分離されており、血流感染症の割合が高かった。今年度解析を行った、ST365 complexに属する株のうち2株は新規alleleを含む新規STであった。B. cereus血流感染症や院内感染事例の報告は海外に比べ日本からが多いこと、ハイリスククローンとして報告されたST1420も新規STであったことから、我が国特有のB. cereus系統株が国内に広く存在し、感染症、特に血流感染を引き起こしている可能性が示唆された。さらに、今年度の臨床情報の収集からB. cereusの血流感染症は採血時の汚染との鑑別が困難な症例から、数日で死に至る転帰となる劇症型の症例に分かれ、この劇症型血流感染症とST365-complexとの関与が示唆された。今後はこれら劇症型血流感染症由来の菌株のゲノム配列上の特徴を明らかにし、病原因子および検出に有用な遺伝子配列の検証を行う。

This year, 10 strains of blood stream infection patients from different medical institutions and 2 strains of food supply from hospitals were analyzed. MLST analysis shows that 10 strains originated from patients with bloodstream infections and 4 strains belong to the ST365-complex. At the beginning of Japan, ST 1420 has an allele number of 62 - 1 - 93 - 109 - 55 - 102 - 210, ST 365 has a number of 34 - 1 - 32 - 1 - 18 - 33 - 24, ST 365-complex has an allele number of 62 - 1 - 93 - 109 - 102 - 210, ST 365-complex has an allele number of 62 - 1 - 18 - 33 - 24, ST 365-complex has an allele number of 62 - 1 - 18 - 33 - 24, ST 365-complex has an allele number of 62 - 1 - 18 - 33 - 24, ST 365-complex has an allele number of 62 - 1 - 18 - 18 - 33 - 24, ST 365-complex has an allele number of 62 - 1 - 1 - 18 - 18 - 33 - 24, ST 365-complex has an allele number of 6 The system analysis of concatenate arrangement and Priest classification name is based on ST 1420 and ST 365 complex. anthracis near clade1 and CeusIII belong to it. ST 365 complex belongs to a plant that is isolated from medical institutions in different regions of the country and has a high incidence of bloodstream infections. This year's analysis of ST 365 complex belongs to ST 365. B. Cereus bloodstream infection and nosocomial infection cases reported overseas are more common than those reported in Japan. ST 1420 new regulations ST 1420 new regulations Cereus system strains exist in the country, infection, special bloodstream infection, and the possibility of infection is indicated. This year's clinical information collection is published in B. Cereus blood stream infection disease, blood sampling, contamination and identification of difficult cases, days to death, severe symptoms of cases, severe symptoms of blood stream infection disease, ST 365-complex and related to the display. In the future, the identification of pathogenic factors and the identification of useful gene sequences will be carried out.