Model system for nucleic acid-protein liquid-liquid phase separation
Model system for nucleic acid-protein liquid-liquid phase separation
批准号:
21H02062
负责人:
三好 大輔
金额:
$11.23万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
核酸とタンパク質は細胞内で相分離して多種多様なドロップレットを形成する。相分離の環境応答性と形成可逆性はドロップレットの生物学的役割の要であるが、その分子機構は未知である。本研究では、ドロップレットに環境応答性と形成可逆性をもたらす分子機構の解明を目指し、先行研究で注目されることのなかった核酸構造に着目してこの問いを化学的に解明することを試みる。そのために、①相分離最小モデルシステムを構築する。次にこれを用いて、②分子環境と化学修飾に依存した核酸の構造―相分離能の相関(Structure-Phase separation Ability Relationship: SPAR)を検討し、核酸とペプチドの配列、構造、化学修飾、分子環境における相分離の必須因子を同定する。さらに、③相分離必須因子や核酸構造結合化合物を用いて相分離制御技術を構築する。これまでに、上記①モデルシステムの構築については、オリゴ核酸とオリゴペプチドを混合するだけで相分離が誘起される世界最の小モデルシステムを構築した。②の核酸の構造―相分離能の相関については、グアニンに富んだ核酸鎖が形成する四重らせん構造が、この構造と選択的に結合するArgに富んだペプチド鎖との相分離を惹起することを発見した。引き続き、他の核酸構造についても検討すると同時に、化学修飾や細胞内環境因子と相分離能の相関について検討する予定である。③の相分離制御技術については、①のモデルシステム内で四重らせん構造を形成する相補鎖を添加することで、四重らせん構造を破壊することで、配列選択的に相分離を阻害、相分離によって形成されたドロップレットを破壊することができた。その阻害能・破壊の程度を、熱力学的に制御できることも見出した。今後は、低分子化合物など、他の方法を用いても相分離の阻害、ドロップレットの破壊を試みる。
英文摘要
核酸とタンパク質は細胞内で相分離して多種多様なドロップレットを形成する。相分離の環境応答性と形成可逆性はドロップレットの生物学的役割の要であるが、その分子機構は未知である。本研究では、ドロップレットに環境応答性と形成可逆性をもたらす分子機構の解明を目指し、先行研究で注目されることのなかった核酸構造に着目してこの問いを化学的に解明することを試みる。そのために、①相分離最小モデルシステムを構築する。次にこれを用いて、②分子環境と化学修飾に依存した核酸の構造―相分離能の相関(Structure-Phase separation Ability Relationship: SPAR)を検討し、核酸とペプチドの配列、構造、化学修飾、分子環境における相分離の必須因子を同定する。さらに、③相分離必須因子や核酸構造結合化合物を用いて相分離制御技術を構築する。これまでに、上記①モデルシステムの構築については、オリゴ核酸とオリゴペプチドを混合するだけで相分離が誘起される世界最の小モデルシステムを構築した。②の核酸の構造―相分離能の相関については、グアニンに富んだ核酸鎖が形成する四重らせん構造が、この構造と選択的に結合するArgに富んだペプチド鎖との相分離を惹起することを発見した。引き続き、他の核酸構造についても検討すると同時に、化学修飾や細胞内環境因子と相分離能の相関について検討する予定である。③の相分離制御技術については、①のモデルシステム内で四重らせん構造を形成する相補鎖を添加することで、四重らせん構造を破壊することで、配列選択的に相分離を阻害、相分離によって形成されたドロップレットを破壊することができた。その阻害能・破壊の程度を、熱力学的に制御できることも見出した。今後は、低分子化合物など、他の方法を用いても相分離の阻害、ドロップレットの破壊を試みる。
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核酸の液液相分離現象に及ぼすエピジェネティック修飾効果の検討
表观遗传修饰对核酸液-液相分离现象影响的检验
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[鶴田 充生, 三好 大輔]
通讯作者:
三好 大輔
甲南大学教員データベース
甲南大学教员数据库
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Controlling liquid-liquid phase separation of G-quadruplex-forming RNAs in a sequence-specific manner
以序列特异性方式控制 G-四链体形成 RNA 的液-液相分离
DOI:
10.1039/d2cc04366a
发表时间:
2022
期刊:
Chemical Communications
影响因子:
4.9
作者:
[Tsuruta Mitsuki, Torii Takeru, Kohata Kazuki, Kawauchi Keiko, Tateishi-Karimata Hisae, Sugimoto Naoki, Miyoshi Daisuke]
通讯作者:
Miyoshi Daisuke
グアニン四重らせん構造のフォールディング機構におけるループ領域の効果
环区对鸟嘌呤四螺旋结构折叠机制的影响
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[中田 実紀, 小坂 直暉, 三好 大輔]
通讯作者:
三好 大輔
新規G4リガンドスクリーニングを用いた構造選択的G4リガンド開発
使用新型 G4 配体筛选进行结构选择性 G4 配体开发
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[橋本 佳樹, 取井 猛流, 木下 菜月, 川内 敬子, 建石 寿枝, 杉本 直己, 三好 大輔]
通讯作者:
三好 大輔
共 68 条
生体分子の液液相分離制御工学構築による新規創薬モダリティの提唱
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批准号:22K18341
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
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资助金额:$16.64万
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财政年份:2022
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负责人:三好 大輔
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依托单位:
国内基金
海外基金
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CRISPR驱动的自维持催化核酸网络用于AFB1的高保真检测
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:李香芝
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依托单位:
人类免疫缺陷病毒(HIV)总核酸检测试剂盒
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:尹富君
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依托单位:
砷特异性结合核酸适配体的筛选及其中和毒性功能研究
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批准号:JCZRLH202600055
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位:
基于重组酶聚合酶的脱氧核糖核酸甲基化快速检测试剂研究
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批准号:JCZRMS202600713
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位:
基于功能框架核酸的钙网蛋白膜转位成像及相关肿瘤免疫调控研究
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批准号:2026JJ50011
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:郑晶
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依托单位:
仿生型核酸传递系统用于克服异质性肿瘤耐药的研究
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批准号:JCZRQNB202600598
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位:
基于单细胞分析构建的核酸递送纳米平台及其对急性心肌梗死的治疗作用研究
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批准号:JCZRQNB202600571
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位:
ANGPTL4核酸适配体修饰地塞米松双层微针递送体系在甲状腺眼病治疗中的应用研究
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批准号:2026JJ30150
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:熊炜
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依托单位:
核糖核酸酶RNase E与其抑制因子RebA通过液-液相分离调控蓝藻RNA代谢的分子机制
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批准号:JCZRQNB202600879
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位:
抗干扰核酸探针的构建及其便携式生物传感应用
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:全珂
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依托单位: