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ゲノム初期化に伴う変異の抑制

抑制与基因组重编程相关的突变

基本信息

批准号：
21H02689
负责人：
荒木良子
金额：
$ 10.82万
依托单位：
National Institutes for Quantum Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02689/
关键词：
ゲノム初期化 iPS細胞変異分化活性酸素

项目摘要

我々はiPS細胞樹立の親体細胞として臍帯血赤芽球を用いることで変異数が大きく減少することを点突然変異及び挿入・欠失変異のゲノムワイド解析で示してきた(臍帯血赤芽球由来iPS: CBE-iPSCs, Cord Blood Erythroblast-derived iPSCs)。その抑制機構として、変異発生の主な原因のひとつである活性酸素の発生が臍帯血赤芽球で抑えられていることを示した。R4年度においては、CBE-iPSCsの更なる詳細な解析から、抑制されている活性酸素誘導型の変異に比べ、抑制がみられない特徴的な変異パターン、即ち今後のさらなる変異低減において解明すべき変異パターンの存在を発見した。一方で、未だ最終的には解決されていない重要な科学的問題であるiPS細胞に観られる変異がゲノム初期化特異的な現象か否かを見極める為、即ち親体細胞集団の一部にしか存在しなかった変異(pre-existing SNVs)を、単一細胞を株化する行為であるiPS化により顕在化させているのではないかという疑問に答える為、従来の親体細胞株に加え姉妹iPS株もreferenceとすることで、より効率的なpre-existing SNVsの排除を達成した変異解析系を構築した（中には1万をこえる変異を有する細胞を複数検出された。）。更に、多角的な解析からiPSCsにみられる変異がゲノム初期化時に生じていることを確認した。これらの成果は現在論文投稿中である。

We use the iPS cell to analyze the origin of the red bud ball (iPS: CBE-iPSCs, Cord Blood Erythroblast-derived iPSCs). The main cause of the inhibition mechanism was the production of active acids, the inhibition of red blood germ, the inhibition of blood red bud, the production of active acids, the production of active acids, the production of red blood germ, the production of red blood germ, the production of active acids, the production of active acids, the production of red blood germ, the inhibition of red blood germ, the production of red blood germ, the production of red bud. In the R4 year, there was no significant difference between the two groups in terms of analysis, inhibition of the activity of active acids, and inhibition of the activity of active acids. in the R4 year, there was a difference between the two groups, that is, in the future, there was a problem that there was a problem in the future. On the one hand, the most important problem is to solve the problem of important science. IPS cells do not have a significant effect on the characteristics of the initial program, that is, the whole body cell set has an important information system (pre-existing SNVs). The response of one cell to one cell is correct, and the answer to the problem is that the cell line of the mother cell adds the sister iPS to the reference cell, and the pre-existing SNVs of the virus rate is excluded from the analysis system of the cell number. ). Change, multi-angle analysis of the iPSCs system in order to make sure that the system is in the initial stage. The results are now in the submission of the article.

项目成果

期刊论文数量（8）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

ヒトiPS細胞樹立におけるゲノム変異とその機構

人类 iPS 细胞建立中的基因突变及其机制

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
荒木　良子; 法喜　ゆう子; 菅　智; 砂山　美里; 今留　香織; 上村　悟氏; 中村　美樹; 藤田　真由美; 安倍　真澄
通讯作者：
安倍　真澄

ゲノム初期化開始時の変異発生

基因组重编程开始时发生突变

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
上村　悟氏; 菅　智; 砂山　美里; 藤森（法喜）ゆう子; 今留　香織; 藤田　真由美; 安倍　真澄; 荒木　良子
通讯作者：
荒木　良子

Microsatellite alterations in genome reprogramming

基因组重编程中的微卫星改变

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kamimura Satoshi; Suga Tomo; Hoki Yuko; Sunayama Misato; Imadome Kaori; Nakamura Miki; Araki Ryoko; Fujita Mayumi; Abe Masumi
通讯作者：
Abe Masumi

In situ delivery of iPSC-derived dendritic cells with local radiotherapy generates systemic antitumor immunity and potentiates PD-L1 blockade in preclinical poorly immunogenic tumor models.

DOI：
10.1136/jitc-2021-002432
发表时间：
2021-05
期刊：
Journal for immunotherapy of cancer
影响因子：
10.9
作者：
Oba T;Makino K;Kajihara R;Yokoi T;Araki R;Abe M;Minderman H;Chang AE;Odunsi K;Ito F
通讯作者：
Ito F

iPS細胞に見られるde novo変異

iPS 细胞中发现新生突变