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Analysis of Cancer Evolution by Single Cell Amplicomics

单细胞扩增组学分析癌症进化

基本信息

批准号：
20J01794
负责人：
中山淳
金额：
$ 2.58万
依托单位：
National Cancer Center Japan
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-24 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

令和4年度の研究成果として、収集した臨床検体のシングルセルRNA-seq解析を実施し、LuminalサブタイプDCIS検体、Luminal-HER2サブタイプDCIS検体、Luminalサブタイプ原発腫瘍、HER2陽性サブタイプ原発腫瘍の統合解析を行った。その結果、DCISに特徴的な遺伝子をシングルセルレベルで抽出することに成功した。また、DCISですでにERBB2遺伝子増幅領域に含まれる遺伝子が複数発現上昇していることを見出した。さらに、定量的ネットワークトポロジーを用いた遺伝子発現不均一性の解析VARIED法を開発した。このVARIED法を適用することで、乳がんにおける間質細胞の不均一性の増大を見出した。これらの結果は従来の知見をサポートするものであり、不均一性を定量的に議論することが可能となった。これらの結果を統合し、Cancer Research誌に成果を報告した（Tokura and Nakayama (Co-first) et al., Cancer Research, 2022）。当初の計画以上に進展しており、新たなシングルセル解析手法の開発に取り組む予定である。現在は、本研究課題をさらに発展させ、浸潤性小葉がんのシングルセル・空間トランスクリプトーム解析やVARIED法の適用拡張のための共同研究を推進している。

Reiwa 4th year's research results, collection of clinical data, RNA-seq analysis of RNA-seq, Luminal data, DCIS data, Lu Integrated analysis of minal-HER2 DCIS, Luminal DCIS, and HER2-positive DCIS. As a result, DCIS's special item, the な弝子をシングルセルレベルで, was successfully drawn.また, DCIS ですでにERBB2 伝子 enlargement field に contain まれる伝子が plural 発 is now rising していることを见出した.さらに、Quantitative ネットワークトポロジーをUse the いた缝子発のanalytic VARIED method to open 発した. The VARIED method is applicable to the inhomogeneity of interstitial cells in breast and breast tissue.これらのRESULTSは従来の知见をサポートするものであり, non-uniformity をquantitative に Discussion することがpossible となった. Tokura and Nakayama (Co-first) et al., Cancer Research, 2022). The progress of the original plan has been made, and the new analysis method has been decided. Now, this research topic is about the development of infiltrative leaflet and space. The application of the スクリプトームanalytical VARIED method is being promoted through joint research with Zhang.

项目成果

期刊论文数量（54）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

同所性移植手法を用いたNMuMG-HOXB7細胞の転移能評価

原位移植技术评价NMuMG-HOXB7细胞的转移潜力

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
東和志;中山淳;仙波憲太郎
通讯作者：
仙波憲太郎

Anomalous Epithelial Variations and Ectopic Inflammatory Response in Chronic Obstructive Pulmonary Disease

慢性阻塞性肺疾病的异常上皮变异和异位炎症反应

DOI：
10.1165/rcmb.2021-0555oc
发表时间：
2022
期刊：
American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology
影响因子：
6.4
作者：
Watanabe Naoaki;Fujita Yu;Nakayama Jun;Mori Yutaro;Kadota Tsukasa;Hayashi Yusuke;Shimomura Iwao;Ohtsuka Takashi;Okamoto Koji;Araya Jun;Kuwano Kazuyoshi;Yamamoto Yusuke
通讯作者：
Yamamoto Yusuke

野生型FLT3を標的とした新規シーズ化合物の創製と評価

针对野生型 FLT3 的新种子化合物的创建和评估