悪性脳腫瘍のスーパーエンハンサー転写と遺伝子標的エピゲノム編集による治療探索

使用超级增强子转录和基因靶向表观基因组编辑治疗恶性脑肿瘤的治疗探索

• 批准号: 20J01889
• 负责人: 平野 雅規
• 金额: $ 3.08万
• 依托单位: Aichi Cancer Center Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-24 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20J01889/
• 关键词: super enhancer; glioma; meningioma; epigenetics; glioblastoma; super-enhancer; organoid

当該年度においては、引き続き手術中に採取した脳腫瘍（神経膠腫瘍・髄膜腫など）検体からのオルガノイド作成を実施した。さらに凍結腫瘍検体およびオルガノイド検体を用いた各種次世代シーケンサー解析（特にH３K２７アセチル化クロマチン免疫沈降シーケンス解析）のための各種条件検討を追加で行い、最適と考えられる条件を決定した。解析の結果から、悪性脳腫瘍特異的に活性化あるいは不活性化されているスーパーエンハンサーを複数同定することができ、新たな治療ターゲット候補となりうると考えられた。髄膜腫においては、これまでオルガノイド作成の報告自体がなく、次世代シーケンサーを用いた網羅的解析〔whole exome sequencing(WES), RNA sequencing(RNA-seq), DNAメチル化解析〕から、親腫瘍とオルガノイドの相同性を示した。また細胞と同様にオルガノイドに対しても効率的な遺伝子操作が可能であることを示し、これまで困難であった髄膜腫の基礎実験に用いることができる優れたモデルとなる可能性を示した。当該年度においては、さらに上記スーパーエンハンサーをターゲットとした新規治療法を開発するため、特異的ターゲットエピゲノム編集を実施するための準備を進め、細胞実験にてその効果を実証した。

When the year is over, the patient will be taken to the hospital for treatment. In addition to the above, we also discussed various conditions for determining the optimal conditions for the selection of frozen samples. The analysis results show that the activity of the tumor is not stable. The results of whole exome sequencing(WES), RNA sequencing(RNA-seq), DNA sequencing analysis show that the identity of the parent selection is similar to that of the parent selection. The cell is the same as the cell. The cell is the same as the cell. When the new treatment method is developed, the preparation and implementation of the new treatment method are carried out.