Comprehensive approach toward understanding cell surface receptor functions coupled with membrane structure and lipid composition
Comprehensive approach toward understanding cell surface receptor functions coupled with membrane structure and lipid composition
批准号:
19H05647
负责人:
佐甲 靖志
金额:
$97.93万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-06-26 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究は、最新の1分子計測法などにより、ヒトの主要な膜受容体 (GPCR, RTK) のほぼ全ての分子種について受容体と近傍脂質の自己組織化による機能制御機構を明らかにすることを目的とする。研究は下記4項目とそれらの統合的な解釈で構成される。本年度の研究概要は以下の通りである。1.膜受容体の細胞膜動態の網羅的な1分子計測:ヒトRTK58種中52種について蛍光蛋白質タグを結合してHEK293細胞に発現させ、リガンドあるいは対照刺激前後の1分子計測を終了した。リガンドが知られていないRTKに関しては対照としてHEK細胞が内在的に発現しているEGFRのリガンド(EGF)を用いた。隠れマルコフモデル解析により、各分子種共通に拡散速度の異なる3状態間の遷移モデルが適用できることが明らかになり、それぞれの分子種について数重の動態パラメータを決定した。今後はこの計測結果に基づく特徴づけを行う。2.膜脂質と受容体の超解像可視化:RTKの一種EGFRと周辺脂質PIP2, PSの超解像計測を行い、PIP2との共局在がEGF刺激前後で変化すること、さらにPIP2がEGFRの2量体形成とリン酸化を促進し、リン酸化したEGFRはPLCgammaへの情報伝達でPIP2を分解するという自己制御的な受容体周辺脂質の再編成機能を発見した。3.膜受容体の境界脂質の分析:EGFR周辺脂質の組成変化を生化学的に証明するため、EGFR分子近傍10 nmの細胞膜をSMAでnative nanodiscとして切り出し精製を進めている。薄層クロマトグラフィーと質量分析により予備的な計測を行い、精製法を最適化している。4.再構成膜における膜受容体の脂質制御の解析:EGFRの膜貫通-膜近傍領域を人工ペプチドとして作成し、再構成nanodisc中で1分子構造ダイナミクス計測を行った結果を論文発表した。
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Insulin signaling shapes fractal scaling of C. elegans behavior.
胰岛素信号塑造线虫行为的分形尺度。
DOI:
10.1038/s41598-022-13022-6
发表时间:
2022-06-21
期刊:
Scientific reports
影响因子:
4.6
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.2142/biophysico.bppb-v18.001
发表时间:
2021
期刊:
Biophysics and physicobiology
影响因子:
1.5
作者:
[Yoshizawa R, Umeki N, Yamamoto A, Murata M, Sako Y]
通讯作者:
Sako Y
Two Closed Conformations of CRAF Require the 14-3-3 Binding Motifs and Cysteine-Rich Domain to be Intact in Live Cells
CRAF 的两个闭合构象需要 14-3-3 结合基序和富含半胱氨酸的结构域在活细胞中保持完整
DOI:
10.1016/j.jmb.2023.167989
发表时间:
2023
期刊:
Journal of Molecular Biology
影响因子:
5.6
作者:
[Okamoto Kenji, Sako Yasushi]
通讯作者:
Sako Yasushi
佐甲細胞情報研究室
佐科细胞信息研究所
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Ulsan University(韓国)
蔚山大学(韩国)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 25 条
1分子動態に基づく細胞膜受容体の機能予測
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批准号:24K01997
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.81万
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财政年份:2024
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
膜構造・膜脂質ダイナミクスと共起する細胞膜受容体の情報伝達
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批准号:19H00987
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$25.79万
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财政年份:2019
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
細胞内情報伝達の再構成系における非線形反応の解析
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批准号:20016027
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.38万
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财政年份:2008
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
膜受容体の動的会合体形成と多状態性を利用した多義的情報変換
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批准号:19036034
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.03万
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财政年份:2007
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
光化学反応を利用した細胞情報入力の時空制御システムの開発
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批准号:18651069
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2006
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
情報伝達分子システムの再構成系における1分子反応解析
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批准号:18016016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.25万
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财政年份:2006
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
膜受容体の動的会合体形成を利用した多義的情報変換
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批准号:17048012
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.03万
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财政年份:2005
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
情報伝達分子システムの再構成系における1分子反応解析
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批准号:17017023
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2005
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
PC12細胞における分化情報蛋白質の動態解析
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批准号:17024036
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
セミ・インタクト細胞を利用した情報伝達分子システムの再構成と1分子反応解析
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批准号:16013229
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.48万
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财政年份:2004
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
セミ・インタクト細胞を利用した情報伝達分子システムの再構成と1分子反応解析
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批准号:15013234
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.88万
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财政年份:2003
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
神経伸長情報処理分子の細胞内1分子反応計測
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批准号:15029235
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.22万
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财政年份:2003
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
情報伝達分子はどのように細胞内カルシウム応答を誘起するか?
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批准号:14658218
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2002
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
上皮成長因子の情報伝達系の細胞内1分子可視化解析
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批准号:13216067
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.94万
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财政年份:2001
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
上皮成長因子の情報伝達網の細胞内1分子可視化解析
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批准号:12215086
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.01万
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财政年份:2000
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
時空制御された入力信号による細胞内情報伝達回路の反応解析
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批准号:12878135
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2000
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
1分子計測法によるRasの情報伝達機構の解析
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批准号:11139236
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:1999
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
細胞性粘菌の走化性に必要な三量体GTP結合蛋白質の活性化の一分子計測
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批准号:11878138
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1999
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
細胞骨格系の滑り運動による細胞膜タンパク質の輸送機構の研究
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批准号:09780595
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1997
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
E-カドヘリンの細胞間接着部位への集合過程における細胞骨格系の役割の研究
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批准号:07780617
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1995
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负责人:佐甲 靖志
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依托单位:
海外基金