细胞内信息传输重构系统中的非线性反应分析-猫眼课题宝

细胞内信息传输重构系统中的非线性反应分析

批准号：

20016027

负责人：

佐甲靖志

金额：

$5.38万

依托单位：

The Institute of Physical and Chemical Research

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

财政年份：

2008

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

2008 至 2009

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20016027/

关键词：

上皮成長因子 Ras MAPK 1分子計測セミインタクト細胞過剰応答性反応ゆらぎ

项目摘要

项目成果

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中文摘要

翻译

細胞増殖・分化を司る上皮成長因子(epidermal growth fctor : EGF)-Ras-MAPKシステムにおいて、(1)EGF受容体の活性化増幅、(2)ERK(MAPK)活性化に見られる双安定性という2つの非線形応答現象を、それぞれセミ・インタクト細胞内および大腸菌内に再構成し、1分子計測、可視化計測によって非線形性の性質と、非線形性を生むメカニズムを解析することを目的として研究を行い、以下の結果を得た。(1) EGF受容体(EGFR)の活性化反応の解析EGFR-GFPを発現するCHO-K1細胞でEGFRの会合数分布と会合体の空間分布計測を行い、2量体を単位とする高次会合体が形成されていることを予想する結果を得た。分子間相互作用を直視するため、光感受性の蛍光蛋白質を融合したEGFRでPALM法により20nm程度の空間分解能で1分子検出を行う方法を開発した。(2) ERKの活性化反応の解析ERK,および活性化MEKとMKPを組み込んだ発現プラスミドを構築し大腸菌で発現を行った。3種の蛋白質の発現を10倍程度制御し、リン酸化ERK抗体によるWestern blotでMEK発現依存的にERKの2重リン酸化が亢進し、MKPの強発現によりリン酸化が阻害されることを確認した。決定論的および確率的な計算法によるERKリン酸化反応解析を行った。決定論的な連立微分方程式モデルにおいては、ERKリン酸化状態の双安定性が予測できた。確率的な反応シミュレータで、細胞サイズが0.2μm^3以下に減少すると双安定性は消失するが、哺乳類細胞レベルの大きさでは、リン酸化レベルは100時間を超えて安定に維持されることが予想された。

英文摘要

期刊论文(9)

专著(0)

科研奖励(0)

会议论文

細胞内シグナル伝達システムの1分子イメージング

细胞内信号系统的单分子成像

DOI： --

发表时间： 2008

期刊：

実験医学増刊 26

影响因子： --

作者：

[T.Oba, P.Sun, Y.Harada, T.Takahashi, H.lriuda, M.Seki, Y.Nakanishi, S.Noguchi, T.lshida, and M., 佐甲靖志]

通讯作者：佐甲靖志

A RasGTP-Induced Conformational Change in C-RAF Is Essential for Accurate Molecular Recognition

DOI： 10.1016/j.bpj.2009.05.048

发表时间： 2009-09-02

期刊：

BIOPHYSICAL JOURNAL

影响因子： 3.4

作者：

[Hibino, Kayo, Shibata, Tatsuo, Sako, Yasushi]

通讯作者： Sako, Yasushi

Reduction-triggered fluorescent amplification probe for detection of endogenous RNAs in living human cells.

还原触发荧光扩增探针，用于检测活人细胞中的内源性 RNA。

DOI： --

发表时间： 2009

期刊：

Bioconjugate Chemistry 20

影响因子： --

作者：

[Hananouchi T, et al., Kazuhiro Furukawa]

通讯作者： Kazuhiro Furukawa

Single Molecule Dyanmics in Life Science. (Yanagida, T. and Ishii, Y. ed.)(分担執筆)

生命科学中的单分子动力学（Yanagida, T. 和 Ishii, Y. ed.）（撰稿人）

DOI： --

发表时间： 2009

期刊：

影响因子： --

作者：

[Ueda, et al.]

通讯作者： et al.

Single-molecule dynamics of cell signaling proteins

细胞信号蛋白的单分子动力学

DOI： --

发表时间： 2009

期刊：

影响因子： --

作者：

[Nishimura, A., Sako Y.]

通讯作者： Sako Y.

共 8 条

１分子動態に基づく細胞膜受容体の機能予測

批准号：

24K01997
项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
资助金额：

$11.81万
财政年份：

2024
负责人：

佐甲靖志
依托单位：

Institute of Physical and Chemical Research

Comprehensive approach toward understanding cell surface receptor functions coupled with membrane structure and lipid composition

批准号：

19H05647
项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
资助金额：

$97.93万
财政年份：

2019
负责人：

佐甲靖志
依托单位：

Institute of Physical and Chemical Research

膜構造・膜脂質ダイナミクスと共起する細胞膜受容体の情報伝達

批准号：

19H00987
项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
资助金额：

$25.79万
财政年份：

2019
负责人：

佐甲靖志
依托单位：

Institute of Physical and Chemical Research

膜受容体の動的会合体形成と多状態性を利用した多義的情報変換

批准号：

19036034
项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
资助金额：

$4.03万
财政年份：

2007
负责人：

佐甲靖志
依托单位：

The Institute of Physical and Chemical Research

光化学反応を利用した細胞情報入力の時空制御システムの開発

批准号：

18651069
项目类别：

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资助金额：

$2.24万
财政年份：

2006
负责人：

佐甲靖志
依托单位：

The Institute of Physical and Chemical Research

情報伝達分子システムの再構成系における1分子反応解析

批准号：

18016016
项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
资助金额：

$5.25万
财政年份：

2006
负责人：

佐甲靖志
依托单位：

The Institute of Physical and Chemical Research

膜受容体の動的会合体形成を利用した多義的情報変換

批准号：

17048012
项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
资助金额：

$4.03万
财政年份：

2005
负责人：

佐甲靖志
依托单位：

The Institute of Physical and Chemical Research (2006)Osaka University (2005)