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細胞活性化時の生理機能変化を担う「分子レバレッジ機構」の解明

阐明细胞活化过程中生理功能变化的“分子杠杆机制”

基本信息

批准号：
19H03661
负责人：
後藤信哉
金额：
$ 11.23万
依托单位：
Tokai University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19H03661/
关键词：
血小板インテグリン膜糖蛋白コンピューター分子動力学計算分子動力学 GPIIb/IIIa 細胞膜糖蛋白GPIIb/IIIa 活性化血栓形成高性能コンピューター血栓細胞活性化心筋梗塞コンピューターシミュレーション細胞機能

项目摘要

血小板活性化時にリガンド蛋白との接着性大きく変化する膜糖蛋白GPIIb/IIIaに注目し、細胞内ドメイン・膜貫通ドメイン・細胞外ドメインを連成したモデルを作成した。計算にはGPU 4基を実装したHPC5000-XSLGPU4TSを用いた。当初の研究計画ではRMSDによる構造の安定化の確認後に, 細胞内ドメインGPIIb Pro999とGPIIIa TYR747の重心間距離の安定値を求め、その後に両アミノ酸の距離を80オングストロームとして細胞外ドメイン構造の変化の有無から分子レバレッジ仮説の妥当性の検証を目指した。しかし、非活性型構造でも細胞外ドメインが長期の計算でも安定しなかった。特に、GPIIbの細胞外ドメインの構造は常に不安定であることがわかった。そこで、非活性化構造が完全に安定しない状態ではあるが、GPIIb Pro999とGPIIIa TYR747の重心間距を80オングストロームに引き剥がして構造計算を施行した。比較的安定した非活性化構造にて15オングストロームほどであったGPIIb Pro999とGPIIIa TYR747の重心間距離を80オングストロームとして計算を継続しようとしたが、構造が破綻してしまった。実際の血小板細胞内にて細胞内環境が変化したときであってもアミノ酸間距離が突然変化することはない。そこで、安定構造からGPIIb Pro999とGPIIIa TYR747の獣神間距離を1オングストロームずつ引き剥がして構造計算を行った。1オングストローム引き剥がして安定したので、さらに1オングストローム引き剥がすと段階的に構造計算することにより当初の仮説の検証を目指す。当初、予定した方法と同一ではないが、研究の積み重ねに基づきより生態に近い条件にて分子レバレッジ仮説の検証を目指す。

When platelets are activated, the membrane glycoprotein GPIIb/IIIa has a large adhesion and is highly adherent. Attention: Intracellular membranes, membrane-penetrating membranes, and extracellular membranes are connected to create membranes. The computing GPU 4 base unit is equipped with HPC5000-XSLGPU4TS. After confirming the stabilization of the RMSD and the structure of the original research plan, intracellular GPIIb Pro999 and GPIIIa TYR747's distance between centers of gravity is stable and stable, and the distance between centers of gravity is 80オングストロームとしてExtracellular ドメイン structure の変化の有无からmolecule レバレッジ仮说の検证を目见した. It is a long-term calculation of the extracellular structure of the non-active structure and a stable structure. Special structure, extracellular structure of GPIIb is often unstable and unstable.そこで、Inactive structure がcomplete and stable しないstate ではあるが、GPIIb Pro999 and GPIIIa The center of gravity distance of TYR747 is 80 degrees, and the structural calculation is carried out. Comparative stable deactivated structure 15 オングストロームほどであったGPIIb Pro999 and GPIIIa The distance between the center of gravity of TYR747 is 80 degrees, and the structure is flawless. There is a sudden change in the distance between platelets and the intracellular environment of platelets.そこで, stable structure から GPIIb Pro999 とGPIIIa TYR747 の獣神间DIstance を1オングストロームずつcitation き peel がして structure calculation を行った. 1オングストローム cited き peeling がして stabilized したので、さらに1オングストロームThe structural calculation of the step-by-step structure calculation of the introduction is the original explanation of the original proof. At the beginning, it was decided that the method should be the same as the same one, and the research should be done on the basis of the accumulation and the ecology of the environment.

项目成果

期刊论文数量（71）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Harvard University/Duke University(米国)

哈佛大学/杜克大学（美国）

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Thrombosis Research Institute(英国)

血栓研究所（英国）

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

心房細動における血栓塞栓の発症機序と危険因子

房颤血栓栓塞的发病机制及危险因素

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
S. Goto;H. Oka;K. Ayabe;H. Yabushita;M. Nakayama;T. Hasebe;H. Yokota;S. Takagi;M. Sano;and A. Tomita;Goto Shinya;Goto S and Goto S;後藤信哉;後藤信哉;後藤信哉
通讯作者：
後藤信哉

Platelet Hyperactivity in Diabetes Mellitus -Are Platelets “Sticker?”

糖尿病患者的血小板过度活跃 - 血小板是“贴纸”吗？

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Bo Zheng;Shinya Goto;Regina Clementi;John Feaster;Danielle Duffy;Penelope Dalitz;Jolanta Airey;John Roberts1 Serge Korjian;C. Michael Gibson;後藤信哉;Shinya Goto;後藤信哉;Shinya Goto
通讯作者：
Shinya Goto

Is There an Ethnic Difference in the Risk of Bleeding Complications with the Use of Antithrombotic Agents

使用抗血栓药物发生出血并发症的风险是否存在种族差异

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
Bo Zheng;Shinya Goto;Regina Clementi;John Feaster;Danielle Duffy;Penelope Dalitz;Jolanta Airey;John Roberts1 Serge Korjian;C. Michael Gibson;後藤信哉;Shinya Goto;後藤信哉;Shinya Goto;Shinya Goto;Shinya Goto;Shinya Goto;後藤信哉;後藤信哉;Shinya Goto;Shinya Goto
通讯作者：
Shinya Goto