Deep learningを用いた肥大心筋の識別系の確立と新規心不全治療薬の同定
Deep learningを用いた肥大心筋の識別系の確立と新規心不全治療薬の同定
批准号:
18K15901
负责人:
小室 仁
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2018
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-04-01 至 2019-03-31
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英文摘要
当研究では、Deep learningを用いた高精度の肥大心筋の識別系の確立を目的として実験を行なった。Deep learningを用いた心筋細胞に対する負荷の有無の視覚的特徴抽出の為、ラット新生仔初代心筋細胞の無血清培養群と血清培養群の蛍光免疫染色を用いてモデルの学習およびDeep leaningの条件検討を行った。無血清培養群と血清培養群の蛍光免疫染色を用いた学習モデルの作製にあたり、条件検討によりDeep leaningによる視覚的特徴抽出に適する最も鮮明な画像が得られる抗体として細胞骨格ではα-Actinin、核に対してはNkx2-5を同定した。得られた免疫染色条件を用い、無血清培養下の細胞と血清添加培養下の細胞を90%の精度で識別するモデルを開発した。次に、心筋細胞に対する肥大刺激の有無の視覚的特徴抽出の為、生体内に近い至適条件である低血清 (0.1%)培養下およびインスリン/トランスフェリン添加下で、アンジオテンシンⅡおよびエンドセリン-1による肥大刺激群と無刺激群の位相差顕微鏡画像を撮影し分類モデルの作製を行った。撮影した画像から心筋細胞画像を自動プログラムで切り出し、学習したモデルの分類性能を評価した。インスリン/トランスフェリン添加下でアンジオテンシンⅡまたはエンドセリン-1の刺激の有無によって得られた位相差顕微鏡画像を用いた学習モデルの作製を試みたが、60-70%程度の精度でしか心筋肥大を判別できなかったため、アンジオテンシンⅡ及びエンドセリン-1の両方を刺激として加え、刺激の有無によって得られた位相差顕微鏡画像を用いた学習モデルで行った。その結果、90%の精度で心筋細胞に対する肥大シグナルの有無の自動識別を達成した。
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科研奖励(0)
会议论文
深層学習(Deep learning)を用いた肥大心筋の自動識別モデルの確立
利用深度学习建立肥厚心肌自动识别模型
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ito S, Aoki H, Nishihara M, Ohno-Urabe S, Furusho A, Hirakata S, Nishida N, Hayashi Y, Ito S, Hashimoto Y, Majima R, Kuwahara K, Fukumoto Y, Yuhi Fujimoto, Yuhi Fujimoto, Yuhi Fujimoto, 藤本雄飛, 藤本雄飛, 中嶋一晶, 小室 仁]
通讯作者:
小室 仁
機械学習を用いた心不全・肥大型心筋症治療薬の開発と発症機序解明
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批准号:24K19022
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:小室 仁
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依托单位:
心不全における非心筋細胞の役割の全貌解明と多臓器連関の解明に基づく新規治療法開発
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批准号:23KJ0353
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2023
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负责人:小室 仁
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依托单位:
単一細胞解析に基づく心不全特異的な線維芽細胞集団を標的とした心不全の新規治療戦略
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批准号:21J12663
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.96万
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财政年份:2021
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负责人:小室 仁
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依托单位:
波長スペクトルの異なる二種類の膜電位感受性色素併用による心臓興奮伝播の3次元解析
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批准号:01770052
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1989
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负责人:小室 仁
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依托单位:
細胞電気活動のための新しい膜電位高感受性色素の探索
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批准号:63770056
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1988
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负责人:小室 仁
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依托单位:
海外基金