Modelling DNA methylation in the systemic progression of cancer
癌症全身进展中的 DNA 甲基化建模
基本信息
- 批准号:392961754
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Units
- 财政年份:2017
- 资助国家:德国
- 起止时间:2016-12-31 至 2021-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
DNA methylation is a heritable epigenetic mechanism that is frequently altered in cancer and that shows significant intratumoural heterogeneity. It also integrates transcriptional and metabolic signals, and may thus stabilize/support metastatic transcriptional programs complementing the effects of genetic alterations. The BalbNeuT mouse model studied by our consortium lacks genetic evidence for metastatic driver mutations. However, it shows marked epigenetic differences between primary tumours and metastasis. It is therefore ideally suited to model methylation progression addressing key questions regarding the impact of epigenetic alterations on metastatic progression. In the first funding period the projects A2 (Spang) and A4 (Rehli) collaborated intensively to study methylation progression in the context of the BalbNeuT mouse model. We have monitored DNA methylation during systemic progression, have identified multiple distinct patterns of methylation progression, and have developed a new type of dynamic cross sectional models that allows for the joint analysis of methylation timing and the causal relations between methylation and dissemination.Joining forces and building on these results, we now propose to develop a novel type of epigenetic progression models, that include early lesions in addition to full grown primary tumours and lung metastasis, fine tune them on a representative set of 25 promoter regions that recurrently show methylation progression, and validate the model using CRISPR/Cas9 mediated gene silencing assays. Moreover, we will use longitudinal liquid biopsies to search for progressed methylation early in systemic progression.
DNA甲基化是一种可遗传的表观遗传机制,在癌症中经常改变,并显示出显著的肿瘤内异质性。它还整合了转录和代谢信号,因此可以稳定/支持补充遗传改变影响的转移性转录程序。我们联盟研究的BalbNeuT小鼠模型缺乏转移驱动突变的遗传学证据。然而,它显示出原发肿瘤和转移瘤之间明显的表观遗传学差异。因此,它非常适合于模拟甲基化进程,解决有关表观遗传改变对转移进程的影响的关键问题。在第一个资助期,A2(Spang)和A4(Rehli)项目密切合作,在BalbNeuT小鼠模型的背景下研究甲基化进程。我们监测了系统进展中的DNA甲基化,确定了多种不同的甲基化进展模式,并开发了一种新型的动态横截面模型,允许联合分析甲基化时机以及甲基化和传播之间的因果关系。结合这些力量并基于这些结果,我们现在建议开发一种新型的表观遗传进展模型,包括除完全生长的原发肿瘤和肺转移之外的早期病变,在一组具有代表性的25个重复显示甲基化进展的启动子区域上对它们进行微调,并使用CRISPR/Cas9介导的基因沉默分析来验证该模型。此外,我们将使用纵向液体活检来寻找系统性进展的早期进展的甲基化。
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
Professor Dr. Michael Rehli其他文献
Professor Dr. Michael Rehli的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('Professor Dr. Michael Rehli', 18)}}的其他基金
Differentiation-associated, macrophage-specific gene expression: Mechanisms of transcription regulation
分化相关的巨噬细胞特异性基因表达:转录调控机制
- 批准号:
281585915 - 财政年份:2016
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grants
Mechanism and relevance of active DNA methylation during monocyte differentiation
单核细胞分化过程中活跃DNA甲基化的机制和相关性
- 批准号:
278631977 - 财政年份:2015
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grants
Evolution of genetic & epigenetic aberrations during malignant progression of breast cancerand the impact of the local environment
遗传学的进化
- 批准号:
257888998 - 财政年份:2014
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Units
Strain specific DNA methylation in inbred mice: mechanisms of cis- and trans-regulation during development
近交小鼠品系特异性 DNA 甲基化:发育过程中的顺式和反式调节机制
- 批准号:
198011771 - 财政年份:2011
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grants
Functional analysis of aberrant DNA methylation in acute myeloid leukemia
急性髓系白血病异常DNA甲基化的功能分析
- 批准号:
171436811 - 财政年份:2010
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Priority Programmes
Epigenetik zelltypspezifischer Genexpression in T-Zell-Subpopulationen
T 细胞亚群中细胞类型特异性基因表达的表观遗传学
- 批准号:
157660474 - 财政年份:2010
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Clinical Research Units
Epigenetik zelltypspezifischer Genexpression in T-Zell Subpopulationen
T 细胞亚群中细胞类型特异性基因表达的表观遗传学
- 批准号:
107826702 - 财政年份:2009
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grants
Charakterisierung von reifungsassoziierten, makrophagenspezifisch exprimierten Genen und Analyse ihrer Expressionsregulierung
成熟相关巨噬细胞特异性表达基因的表征及其表达调控分析
- 批准号:
63157658 - 财政年份:2008
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grants
Transkriptionelle Regulierung der alternativen Makrophagenaktivierung
替代性巨噬细胞激活的转录调控
- 批准号:
21788754 - 财政年份:2006
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grants
Zelltypspezifische Genexpression bei der Differenzierung und Aktivierung mononukleärer Phagozyten: Mechanismen der Transkriptionsregulation
单核吞噬细胞分化和激活中的细胞类型特异性基因表达:转录调控机制
- 批准号:
5443169 - 财政年份:2005
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grants
相似国自然基金
替尼泊苷抑制APEX1驱动DNA损伤在治疗肺癌中的作用及机制研究
- 批准号:JCZRYB202500477
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
HMGCL通过H3K27乙酰化增强RAD52依赖的DNA损伤修复促进宫颈癌放疗抵抗的机制研究
- 批准号:JCZRLH202500546
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于仿生非平衡态的DNA纳米机器构建及其对多种霉菌毒素高灵敏同步
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于 DNA 编码分子库的新型蛋白抑制剂分子胶水活性评价与机制研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
复制蛋白A小分子抑制剂-HAMNO调控DNA损伤修复的结构及功能研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于合金@硼烯的比率型折纸电化学芯片构建及其在多种循环肿瘤DNA的超灵敏检测
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
NEDD4泛素化调控CREB/miR-132轴诱发精子DNA碎片化在肥胖不育中的作用及机制
- 批准号:QN25H200016
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
高强度DNA杂化纳米机器人在内体膜调控和核酸药物递送中的基础研究
- 批准号:HDMZ25H300006
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
PLOD2的DNA低甲基化模式驱动内质网与线粒体代谢串扰诱导免疫微环境重塑和化疗耐药
- 批准号:KLY25H160008
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于内在抗炎和抗氧化功能的可注射 DNA 水凝胶高效负载牙髓干细胞促进脊髓损伤修复的作用研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
相似海外基金
Deciphering plant stress memory: the exploration of how DNA methylation and the rhizosphere microbiome control stress memory in plants
解读植物逆境记忆:探索DNA甲基化和根际微生物如何控制植物逆境记忆
- 批准号:
BB/Z514810/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Fellowship
stablishment of non-invasive DNA methylation panel for peritoneal metastasis of gastric cancer patients
胃癌腹膜转移非侵入性DNA甲基化检测试剂盒的建立
- 批准号:
23K08210 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Next-generation epigenetic analysis: direct reading of DNA methylation
下一代表观遗传分析:直接读取 DNA 甲基化
- 批准号:
DP220102086 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Discovery Projects
DNA methylation and effectors associated with lifestyle diseases study
DNA甲基化和与生活方式疾病相关的效应物研究
- 批准号:
23K16331 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Elucidation of Molecular Mechanisms of Child Abuse Stress Focusing on DNA Methylation and Development and Application of Quantitative Methods
以DNA甲基化为重点的儿童虐待应激分子机制阐明及定量方法的发展与应用
- 批准号:
23K16378 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Modular workflow for the community-led development of custom livestock DNA methylation arrays
用于社区主导的定制牲畜 DNA 甲基化阵列开发的模块化工作流程
- 批准号:
BB/W019051/1 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grant
DNA-methylation to improve conservation of TSD species
DNA 甲基化可改善 TSD 物种的保护
- 批准号:
NE/X012077/1 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Research Grant
Decoding AMPK-dependent regulation of DNA methylation in lung cancer
解码肺癌中 DNA 甲基化的 AMPK 依赖性调节
- 批准号:
10537799 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Monitoring Immunotherapy Response via Gene Silencing Landscapes in Cell-Free DNA
通过游离 DNA 中的基因沉默景观监测免疫治疗反应
- 批准号:
10760450 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别:
Targeting tumor and T cell DNA methylomes to improve CAR T cell therapies for diffuse midline glioma
靶向肿瘤和 T 细胞 DNA 甲基化组以改善弥漫性中线神经胶质瘤的 CAR T 细胞疗法
- 批准号:
10715739 - 财政年份:2023
- 资助金额:
-- - 项目类别: