遺伝毒性試験データベースの充実化と遺伝毒性に繋がる化学構造的特徴の探索

完善遗传毒性测试数据库并寻找导致遗传毒性的化学结构特征

• 批准号: 18J13174
• 负责人: 大岡 正人
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: Tokyo Metropolitan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-25 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18J13174/
• 关键词: DNA修復; 遺伝毒性; 変異

本研究は特定のDNA損傷を誘導する化合物を特定し、それらの化合物が共通して持つ化学的な特徴を明らかにすることを目的としている。目的達成のため、膨大な種類の化合物のDNA損傷誘導の活性を調べる必要がある。本研究では、細胞を用いた試験を行い、それらの試験から得られたデータを元にマシンラーニングのトレーニングデータを取得し、化学構造からの遺伝毒性の予測を測る。国立医薬品食品衛生研究所が持つ化合物データベースの中から原核生物を用いた遺伝毒性試験で陽性であり、且芳香族環と単純な官能基を持つ化合物を選定し、それらの化合物の遺伝毒性の差異とその化学構造を検証する計画であった。しかし、申請者の計画していた実験と類似した実験がアメリカ国立衛生研究所において約10,000種の化合物の規模で行われた。その結果、マシンラーニングにより、構造と遺伝毒性の予測が一致した化合物は35%であったと報告している。このことから、数十種の化合物から一般的な遺伝毒性と化学構造の繋がりを明らかにすることは困難であると考えた。そのため、一般的な遺伝毒性ではなく、より詳細な遺伝毒性誘導機構に着目したスクリーニング系を確立し、遺伝毒性を示した化合物の特徴と遺伝毒性誘導機構の繋がりを検証するよう方針を変更した。申請者はエストロゲンレセプター依存的な遺伝毒性誘導機構に着目し、実験系の確立を試みた。膨大な量のデータの収集が出来るようハイスループットでの実験の確立を試みた。実験系の指標であるCV値、S/B比、Z-factor全ての値において実験系の基準値を上回る実験系を確立した。この実験系を用いてアメリカ国立研究所が持つ化合物ライブラリのうち907種類の化合物に対してスクリーニングを行った。そのうち遺伝毒性を示した化合物は128種、エストロゲンレセプター依存的な遺伝毒性を示した化合物を14種同定した。

In this study, specific DNA compounds were used to guide the chemical properties of specific and common compounds. Objective it is necessary to induce the activity of compounds like DNA and dilatation compounds. In this study, the samples were obtained by using the chemical method, the chemical method, the toxicity test and the toxicity test. The National Institute of Medical products and Food Hygiene is responsible for the determination of compounds in prokaryotes for use in prokaryotes, the toxicity of compounds and the functional basis of aromatic environmental chemicals. Both the applicant and the applicant plan to determine the size of the compound by the National Institute of Health (NIH). The results showed that the toxicity and toxicity of the consistent compounds were 35% higher than those of the control group. In general, dozens of compounds have been tested for toxicity. The chemical method is used to determine whether they are safe or not. The general toxicity test, the general toxicity test and the safety test. The applicant shall make sure that the drug toxicity agency that depends on the applicant is responsible for the establishment of a test. If you expand the volume, you will be able to make sure that the test is set up. "system" means "CV", "B ratio", "B ratio" and "B ratio". The Department of National Research Institute is responsible for the management of chemical compounds, such as those of the National Institute of Chemical Research. A total of 128 compounds and 14 identical compounds were identified by the toxicity test and the concentration-dependent toxicity test of the compound.

项目成果

National Institutes of Health(米国)

美国国立卫生研究院

Two-Dimensional Cellular and Three-Dimensional Bio-Printed Skin Models to Screen Topical-Use Compounds for Irritation Potential

• DOI: 10.3389/fbioe.2020.00109
• 发表时间: 2020-02
• 期刊: Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
• 影响因子: 5.7
• 作者: Zhengxi Wei;Xue Liu;Masato Ooka;Li Zhang;Min Jae Song;Ruili Huang;N. Kleinstreuer;A. Simeonov;M. Xia;M. Ferrer