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High quality genome assembly and construction of high-resolution linkage map by sequencing and SNPs typing of haploid genome individuals

High quality genome assembly and construction of high-resolution linkage map by sequencing and SNPs typing of haploid genome individuals
通过单倍体基因组个体的测序和 SNP 分型，实现高质量基因组组装和高分辨率连锁图的构建
批准号：
25640099
负责人：
ASAKAWA Shuichi
金额：
$2.58万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2013
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2013-04-01 至 2015-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-25640099/
关键词：
ゲノムシーケンシングトラフグニジマスブリ雌性発生ダブルハプロイドハプロイドホモ接合ダブルハプロイド／ハプロイド第一卵割阻止ハプロイドゲノム連鎖地図

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ダブルハプロイド個体を活用した高品質トラフグゲノムアセンブリの作成
使用双单倍体个体创建高质量的虎河豚基因组组装
DOI： --
发表时间： 2013
期刊：
影响因子： --
作者： [張虹, 陳盈光, 木下滋晴, 浅川修一, 鈴木穣, 清水厚志, 岡野栄之, 工藤 純, 斎藤和敬, 渡部終五]
通讯作者： 渡部終五
Genome and transcriptome analysis of aquatic organisms by next generation sequencing
通过下一代测序对水生生物进行基因组和转录组分析
DOI： --
发表时间： 2013
期刊：
影响因子： --
作者： [張虹, 陳盈光, 木下滋晴, 浅川修一, 鈴木穣, 清水厚志, 岡野栄之, 工藤 純, 斎藤和敬, 渡部終五, S. Asakawa]
通讯作者： S. Asakawa
Utilization of a doubled-haploid individual in construction of a high-quality torafugu (Takifugu rubripes) genome assembly
利用双单倍体个体构建高质量红鳍东方鲀（Takifugu rubripes）基因组组装
DOI： --
发表时间： 2013
期刊：
影响因子： --
作者： [Hong Zhang, Shigeharu Kinoshita, Engkong Tan, Yutaka Suzuki, Atsushi Shimizu, Hideyuki Okano, Jun Kudoh, Kazuyoshi Saito, Shugo Watabe, Shuichi Asakawa]
通讯作者： Shuichi Asakawa
Dramatic improvement in genome assembly achieved using doubled-haploid genomes.
使用双单倍体基因组实现了基因组组装的显着改进。
DOI： 10.1038/srep06780
发表时间： 2014-10-27
期刊： Scientific reports
影响因子： 4.6
作者： [Zhang H, Tan E, Suzuki Y, Hirose Y, Kinoshita S, Okano H, Kudoh J, Shimizu A, Saito K, Watabe S, Asakawa S]
通讯作者： Asakawa S
Elucidation of RNA interference in fish and shellfish and its application for aquaculture and pathogen defense
  • 批准号：
    24248034
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额：
    $29.29万
  • 财政年份：
    2012
  • 负责人：
    ASAKAWA Shuichi
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
Comprehensive and functional analysis of Medaka small RNAs using next generation sequencer
  • 批准号：
    21310125
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $10.73万
  • 财政年份：
    2009
  • 负责人：
    ASAKAWA Shuichi
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
Positional cloning of the pathogenic gene for familial myoclonus epilepsy (BAFME) mapped to the 8q23 region
  • 批准号：
    15390276
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $5.95万
  • 财政年份：
    2003
  • 负责人：
    ASAKAWA Shuichi
  • 依托单位：
    Keio University
Construction of medaka BAC library
  • 批准号：
    11236209
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $29.25万
  • 财政年份：
    1999
  • 负责人：
    ASAKAWA Shuichi
  • 依托单位：
    Keio University
海外基金