Global systems of symbiotic nitrogen-fixing bradyrhizobia by comparative genomics of phylogenetic super-neighbors

通过系统发育超级邻居的比较基因组学研究共生固氮慢根瘤菌的全球系统

• 批准号: 23658057
• 负责人: MINAMISAWA Kiwamu
• 金额: $ 2.33万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23658057/
• 关键词: 共生; ゲノム比較; 根粒菌; Bradyrhizobium; 窒素固定; 土壌低栄養細菌; タンパク質分泌系; エンドファイト; 比較ゲノム; 土壌微生物

Global systems of symbiotic nitrogen-fixing bradyrhizobia were conducted by comparative genomics of phylogenetic super-neighbors of the bacteria. Soil-dwelling Bradyrhizobium sp. strain S23321 lacked symbiosis island with high genomic co-linearity with B. japonicum USDA110, suggesting an ancestral-type genome of symbiotic bradyrhizobia. On the other hand, the genome analysis suggested soil-dwelling Agromonas oligotrophica (Bradyrhizobium oligotrophicum) is a nitrogen-fixing symbiont of Aechynomeny indica. Indeed, all texted strains of A. oligotrophica are able to nodulate A. indica with symbiotic nitrogen fixation. In addition, the rhcJ and ttsI mutants of B. japonicum for the type III protein secretion system (T3SS) gained the ability to nodulate Rj2 soybean, suggesting the effectors secreted via T3SS trigger incompatibility between these two partners.

通过细菌系统发育超邻居的比较基因组学，对全球共生固氮慢生根瘤菌系统进行了研究。土壤慢生根瘤菌S23321与B无共生岛，与B基因组高度共线性。japonicum USDA 110的基因组序列，推测为共生慢生根瘤菌的祖先型基因组。另一方面，基因组分析表明，土壤中的寡营养农单胞菌（Bradyrhizobium oligotrophicum）是千里光的一种固氮共生体。事实上，A的所有文本菌株。寡养型能使A.与共生固氮的籼稻。此外，还对B.日本根瘤菌的III型蛋白分泌系统（T3SS）获得了诱导Rj2大豆的能力，表明通过T3SS分泌的效应子触发了这两个伴侣之间的不相容性。

项目成果

土壌低栄養細菌Agromonas oligotrophica S58Tのゲノム解析

土壤营养不良细菌寡营养农杆菌S58T基因组分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 大久保卓;大島健志朗;三井久幸;服部勉;服部正平;南澤 究;Kiwamu Minamisawa;Kiwamu Minamisawa;Mizue Anda;Takashi Okubo;福島翔平;津久井隆裕;Kiwamu Minamisawa;Takashi Okubo;Shohei Fukusima;南澤 究;大久保 卓
• 通讯作者: 大久保 卓

シンポジウム植物共生微生物の多様性研究とその社会貢献

植物共生微生物多样性及其社会贡献研讨会研究

• 发表时间: 2011
• 作者: Jina Choo;Chol Shin;Emma Barinas-Mitchell;Kamal Masaki;Bradley J. Wilcox;Todd B. Seto;Hirotsugu Ueshima;Sunghee Lee;Katsuyuki Miura;Lakshimi Venkitachalam;Rachel H. Mackey;Rhobert W. Evans;Lewis H. Kuller;Kim Sutton-Tyrrell and Akira Sekikawa;南澤究
• 通讯作者: 南澤究

Analysis of symbiotic phenotypes of an effector gene unique to Bradyrhizobium japonicum USDA122

日本慢生根瘤菌 USDA122 特有效应基因的共生表型分析

• 发表时间: 2013
• 作者: Yuta Suzuki;Cristina Sa^^'nchez;Kaori Kakizaki-Chiba;Takakazu Kaneko;Shusei Sato;Takahiro Tsukui;Kiwamu Minamisawa
• 通讯作者: Kiwamu Minamisawa

ダイズ根粒菌TypeIII分泌系によるRj2ダイズ共生不和合性の誘導

大豆根瘤菌III型分泌系统诱导Rj2大豆共生不亲和性

• 发表时间: 2012
• 作者: 津久井隆裕;江田志磨;金子貴一;佐藤修正;岡崎伸;柿崎(千葉)芳里;板倉学;三井久幸;南澤究
• 通讯作者: 南澤究

Low nitrogen fertilization adapts rice root microbiome to low nutrient environment by changing biogeochemical functions.

• DOI: 10.1264/jsme2.me13110
• 发表时间: 2014
• 期刊: Microbes and environments
• 影响因子: 2.2
• 作者: Ikeda S;Sasaki K;Okubo T;Yamashita A;Terasawa K;Bao Z;Liu D;Watanabe T;Murase J;Asakawa S;Eda S;Mitsui H;Sato T;Minamisawa K
• 通讯作者: Minamisawa K