高度好熱菌アミノアシルtRNA合成酵素およびtRNAとの複合体のX線結晶構造解析
高度好熱菌アミノアシルtRNA合成酵素およびtRNAとの複合体のX線結晶構造解析
批准号:
09780597
负责人:
濡木 理
金额:
$1.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 1999
中文摘要
点击翻译按钮获取中文摘要
英文摘要
イソロイシルtRNA合成酵素とアミノ酸との復合体のX線結晶構造解析析 イソロイシルtRNA合成酵素(IleRS)は、基質であるL-イソロイシンと良く似たL-バリンを誤って認識しVal-AMP、Val-tRNAIleを合成してしまうが、一方でtRNAIleの結合に依存して、これらの誤産物を加水分解することにより、アミノアシル化反応の誤りを校正する。我々は、高度好熱菌IleRSとL-イソロイシンおよびL-バリンの複合体の結晶構造を2.5A分解能で解明し、IleRSはRossmann foldからなる触媒ドメイン上の第1の活性部位でイソロイシンおよびバリンを同様に活性化した後、この触媒ドメインに挿入された校正ドメイン(βバレル構造)上の第2の活性部位でバリン産物を加水分解することにより、イソロイシンとバリンを識別していることが明らかになった。さらに、IleRSの変異体解析の結果は、上記のメカニズムを強く支持した。アルギニルtRNA合成酵素のX線結晶構造解析 高度好熱菌由来アルギニルtRNA合成酵素(ArgRS)の高分解能結晶を得て、播磨SPring8のシンクロトロン放射光を用い、1.8Å分解能のデータ収集に成功した。さらに、重原子同型置換法により位相決定を行い、解釈可能な電子密度図の導出し、ArgRSの結晶構造を1.8Å分解能で決定することに成功した(R因子は23%)。その結果、.ArgRSの構造は、サブクラスIaのアミノアシルtRNA合成酵素の構造1を骨格にして、これに特異的なtRNAの認識に必要な、特徴的なドメインが付加されたものであることが明らかになった。バリルtRNA合成酵素とtRNA、バリルAMPアナログとの3重複合体のX線結晶構造解析高度好熱菌由来バリルtRNA合成酵素(ValRS)とtRNA、バリルAMPアナログとの3重複合体に関して、播磨SPring8のシンクロトロン放射光を用いて、2.8Å分解能のデータ収集に成功した。さらに、重原子同型置換法により位相を決定し、解釈可能な電子密度図の導出に成功した。ValRSにもIleRSと良く似た校正機構があり、そのメカニズムに関して興味深い知見が示唆されており、現在モデルの構築を急いでいる。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
O.Nureki: "Enzyme structure with two catalytic sites for double-sieve selection of substrates" Science. (revised).
O.Nureki:“具有两个催化位点的酶结构,用于底物的双筛选择”《科学》。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
O.Nureki et al.: "Enzyme structure with two catalytic sites for double-sieve selection of substrates" Science. 280. 578-582 (1998)
O.Nureki 等人:“具有两个催化位点的酶结构,用于底物的双筛选择”《科学》。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
濡木理: "「立体構造から見たグルタミルtRNA合成酵素の進化」" 生物物理. 37. 321-325 (1997)
Osamu Nureki:“从三维结构的角度看谷氨酰tRNA合成酶的进化”生物物理学37. 321-325(1997)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Structural dynamics of GPCR in cells
-
批准号:21H05037
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
-
资助金额:$121.14万
-
财政年份:2021
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
金属トランスポーターによる基質認識と輸送制御の構造基盤
-
批准号:20247015
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
-
资助金额:$11.23万
-
财政年份:2008
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
間接的なアミノアシルtRNA合成経路におけるtRNAチャネリングの構造基盤
-
批准号:08F08418
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.47万
-
财政年份:2008
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
タンパク質に新たに見出された結び目構造のフォールディング機構の解明
-
批准号:15032209
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$3.26万
-
财政年份:2004
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
X線結晶構造解析に基づく嗅覚・味覚・温覚レセプターの情報変換メカニズムの解明
-
批准号:16048208
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$2.3万
-
财政年份:2004
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
立体構造に基づく蛋白質合成マシーナリーの動作機構の解明
-
批准号:11169204
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$20.93万
-
财政年份:1999
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
X線結晶構造解析を用いたtRNAのアミノアシルtRNA合成酵素活性化機構の解明
-
批准号:11780462
-
项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
-
资助金额:$1.54万
-
财政年份:1999
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
立体構造に基づくRNA結合タンパク質による分子認識機構の解明
-
批准号:09261202
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$1.09万
-
财政年份:1997
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
X線結晶構造解析によるアミノアシルtRNA合成酵素の反応機構の解明
-
批准号:08780612
-
项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
-
资助金额:$0.64万
-
财政年份:1996
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
X線結晶構造解析によるアミノアシルtRNA合成酵素の反応機構の解明
-
批准号:08214201
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$0.64万
-
财政年份:1996
-
负责人:濡木 理
-
依托单位:
海外基金