课题基金 / 基金详情

高度好熱菌アミノアシルtRNA合成酵素およびtRNAとの複合体のX線結晶構造解析

高度好熱菌アミノアシルtRNA合成酵素およびtRNAとの複合体のX線結晶構造解析
超高温氨酰-tRNA合成酶及其与tRNA复合物的X射线晶体结构分析
批准号:
09780597
负责人:
濡木 理
金额:
$1.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 1999

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项目成果

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イソロイシルtRNA合成酵素とアミノ酸との復合体のX線結晶構造解析析 イソロイシルtRNA合成酵素(IleRS)は、基質であるL-イソロイシンと良く似たL-バリンを誤って認識しVal-AMP、Val-tRNAIleを合成してしまうが、一方でtRNAIleの結合に依存して、これらの誤産物を加水分解することにより、アミノアシル化反応の誤りを校正する。我々は、高度好熱菌IleRSとL-イソロイシンおよびL-バリンの複合体の結晶構造を2.5A分解能で解明し、IleRSはRossmann foldからなる触媒ドメイン上の第1の活性部位でイソロイシンおよびバリンを同様に活性化した後、この触媒ドメインに挿入された校正ドメイン(βバレル構造)上の第2の活性部位でバリン産物を加水分解することにより、イソロイシンとバリンを識別していることが明らかになった。さらに、IleRSの変異体解析の結果は、上記のメカニズムを強く支持した。アルギニルtRNA合成酵素のX線結晶構造解析 高度好熱菌由来アルギニルtRNA合成酵素(ArgRS)の高分解能結晶を得て、播磨SPring8のシンクロトロン放射光を用い、1.8Å分解能のデータ収集に成功した。さらに、重原子同型置換法により位相決定を行い、解釈可能な電子密度図の導出し、ArgRSの結晶構造を1.8Å分解能で決定することに成功した(R因子は23%)。その結果、.ArgRSの構造は、サブクラスIaのアミノアシルtRNA合成酵素の構造1を骨格にして、これに特異的なtRNAの認識に必要な、特徴的なドメインが付加されたものであることが明らかになった。バリルtRNA合成酵素とtRNA、バリルAMPアナログとの3重複合体のX線結晶構造解析高度好熱菌由来バリルtRNA合成酵素(ValRS)とtRNA、バリルAMPアナログとの3重複合体に関して、播磨SPring8のシンクロトロン放射光を用いて、2.8Å分解能のデータ収集に成功した。さらに、重原子同型置換法により位相を決定し、解釈可能な電子密度図の導出に成功した。ValRSにもIleRSと良く似た校正機構があり、そのメカニズムに関して興味深い知見が示唆されており、現在モデルの構築を急いでいる。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
O.Nureki: "Enzyme structure with two catalytic sites for double-sieve selection of substrates" Science. (revised).
O.Nureki:“具有两个催化位点的酶结构,用于底物的双筛选择”《科学》。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
O.Nureki et al.: "Enzyme structure with two catalytic sites for double-sieve selection of substrates" Science. 280. 578-582 (1998)
O.Nureki 等人:“具有两个催化位点的酶结构,用于底物的双筛选择”《科学》。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
濡木理: "「立体構造から見たグルタミルtRNA合成酵素の進化」" 生物物理. 37. 321-325 (1997)
Osamu Nureki:“从三维结构的角度看谷氨酰tRNA合成酶的进化”生物物理学37. 321-325(1997)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Structural dynamics of GPCR in cells
  • 批准号:
    21H05037
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
  • 资助金额:
    $121.14万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    濡木 理
  • 依托单位:
金属トランスポーターによる基質認識と輸送制御の構造基盤
  • 批准号:
    20247015
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额:
    $11.23万
  • 财政年份:
    2008
  • 负责人:
    濡木 理
  • 依托单位:
間接的なアミノアシルtRNA合成経路におけるtRNAチャネリングの構造基盤
  • 批准号:
    08F08418
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.47万
  • 财政年份:
    2008
  • 负责人:
    濡木 理
  • 依托单位:
タンパク質に新たに見出された結び目構造のフォールディング機構の解明
  • 批准号:
    15032209
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $3.26万
  • 财政年份:
    2004
  • 负责人:
    濡木 理
  • 依托单位:
海外基金