構造生物学に基づいたミトコンドリア標的化シグナル認識の分子メカニズム
基于结构生物学的线粒体靶向信号识别分子机制
基本信息
- 批准号:12780455
- 负责人:
- 金额:$ 1.6万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
- 财政年份:2000
- 资助国家:日本
- 起止时间:2000 至 2001
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ミトコンドリアヘの輸送のための標的化シグナルは、ミトコンドリア内部でミトコンドリアプロセシングペプチダーゼ(MPP)によって切断除去され、タンパク質は前駆体から成熟体へと変換される。今年度、立体構造を基盤とし、以下の項目を解析し、この分子認識メカニズムの解明を試みた。(1)MPPの立体構造は?(2)MPPのシグナル認識に重要な構造要素は?(3)結合状態でのシグナル配列やMPPの構造は?(1)に関して、X-線結晶構造解析によって酵母MPPの立体構造を約2.5Åの分解能で決定した結果、α、βサブユニット間に大きな溝と分子内空洞が観察された。静電ポテンシャル計算によって分子内空洞は負電荷を帯びていると考えられ、塩基性の標的化シグナルを静電的な相互作用によって分子内空へと誘引している可能性が高い。(2)、(3)については、2種類のシグナルペプチド配列をもとにした合成ペプチドと活性部位に変異を導入した不活性型MPPを用いMPP-基質複合体のX-線結晶構造解析を行った。2種類のシグナルペプチドとも延びたβ構造状態で主に分子内空洞のβサブユニット側に水素結合で固定されていた。基質ペプチドの切断に重要な2位のArg、+1位の疎水性アミノ酸に対する結合部位が、それぞれβサブユニットの酸性アミノ酸残基とPhe残基からなることが観察された。MPPβサブユニットに対する部位特異的変異と各種基質タンパク質に対する切断解析から、生化学的にも-2位Arg結合部位としての酸性アミノ酸残基の重要性を明らかにした。尚、X-線結晶構造解析はアメリカ合衆国テキサス大学との共同研究である。
In this case, you can see if there are any changes in your body. You may need to know that your body is mature. You need to know that your body is mature. You need to know how to do it. You need to know what to do. This year, we will create a three-dimensional database, analyze the following items, and try to understand how to solve the problem. (1) MPP stereoscopic fabrication? (2) MPP stereoscopic fabrication? (2) combination of state-of-the-art data analysis and X-ray analysis of yeast MPP stereotaxis: (1) the decomposition of yeast MPP stereochemistry can determine the results, α, β, and intramolecular voids. The calculation of the intramolecular cavity, the chemical reaction of the fundamental molecule, the interaction of the intramolecular space, the intramolecular space, the possibility of the interaction, the calculation of the intramolecular cavity, the molecular cavity, the intramolecular cavity, the intramolecular cavity, the intramolecular (2), (3) and (3) the active parts of the active parts were transferred into the inactive MPP by the X-ray crystal analysis of the MPP--based complex X-ray crystal. 2. The main molecular cavities of β-phenotype, β-cyclodextrin, β-cyclosporine, β-cyclosporine, β-phenylethanol, β-cyclosporine, β-phenylephrine, β-phenylephrine, β-phenylethyl, β-cyclosporine, β-phenylephrine, β-phenylethanol, β-cyclosporine, β- There are two important positions of Arg, one of which is water soluble acid, the other is acid binding site, and the other is acid residue, acid residue, Phe residue, acid residue, acid residue The analysis of MPP β-amino acid binding sites and the importance of acid residues in biochemical compounds-2-position Arg binding sites show that the importance of acid residues. Shang, X-ray analysis and analysis, the joint research of universities and universities in the United States.
项目成果
期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Kitada S, et al.: "Glu(191) and Asp(195) in Rat Mitochondrial Processing Peptidase β Subunit Are Involved in Effective Cleavage of Precursor Protein through Interaction with the Proximal Arginine"Biochem. Biophys. Res. Commun... 287. 594-599 (2001)
Kitada S 等人:“大鼠线粒体加工肽酶 β 亚基通过与近端精氨酸相互作用参与前体蛋白的有效裂解”Biochem Res。 .594-599 (2001)
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- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Kitada S.and Ito A.: "Electrostatic recognition of matrix targeting signal by mitochondrial processing peptidase"J Biochem. 129. 155-161 (2001)
Kitada S.和 Ito A.:“线粒体加工肽酶对基质靶向信号的静电识别”J Biochem。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Kojima K, et al.: "Recognition of mitochondrial protein precursor lacking arginine at position -2 by mitochondrial processing peptidase : processing of bovine cytochrome p450(scc) precursor"J. Biochem.. 130. 497-502 (2001)
Kojima K 等人:“线粒体加工肽酶对 -2 位缺少精氨酸的线粒体蛋白前体的识别:牛细胞色素 p450(scc) 前体的加工”J.
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Sizuki et al.: "Characterization of rat TOM40, a central component of the preprotein translocase of the mitochondrial outer membrane"J Biol Chem.. 275. 37930-37936 (2000)
Sizuki 等人:“大鼠 TOM40 的表征,线粒体外膜前蛋白转位酶的核心成分”J Biol Chem.. 275. 37930-37936 (2000)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Taylor A.B.et al.: "Crystal Structures of Mitochondrial Processing Peptidase Reveal the Mode for Specific Cleavage of Import Signal Sequences"Structure. 9. 615-625 (2001)
Taylor A.B.等人:“线粒体加工肽酶的晶体结构揭示了输入信号序列特异性切割的模式”结构。
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