ミトコンドリアプロセシングペプチダーゼαサブユニットの機能と基質認識機構
ミトコンドリアプロセシングペプチダーゼαサブユニットの機能と基質認識機構
批准号:
09780577
负责人:
北田 栄
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1997
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1997 至 1998
中文摘要
ミトコンドリアプロセシングペプチダーゼ(MPP)のサブユニット機能と分子認識機構を解明するため研究を実施した結果、本年度以下に示すいくつかの新しい知見を得た。(1) サブユニット協調的な基質認識モデルの提唱MPPの基質認識メカニズムの解明に向けて基質に蛍光基(プローブ)を導入、酵素複合体で高い親和性(解離定数、約0.1μM)を示した。このことから二つのサブユニットが協調的に基質を認識しているものと考えられる。更に基質の2箇所の塩基性アミノ酸のうち切断点から離れた部分をαが、近い部位をβが認識しているマルチサイト認識モデルを提唱(研究発表;小嶋)。このモデルはMPPへの部位特異的アミノ酸変異の研究結果を支持している。(2) MPPの部位特異的酸性アミノ酸の変異による基質認識部位、触媒残基の同定と解析部位特異的アミノ酸変異から、基質の塩基性アミノ酸の認識に重要な酸性アミノ酸をαサブユニットで同定した(研究発表;下方)。更にβサブユニットで基質切断反応に必須な金属結合残基、触媒残基を確認(研究発表;北田)。主にαが基質認識をβが触媒機能を持つと考えたれる。ただし、β単独では全く不活性であるため、αがβの活性を制御している可能性がある。このことは研究結果(3)と関連する。(3) αサブユニットのグリシンリッチ領域のMPP触媒機能における重要性を証明MPPに対しランダム変異を導入、機能欠損体を検索する実験結果から、αサブユニットのグリシンに富む領域(グリシンリッチ領域)が重要な役割を持っていることが示唆された。そこで、本年度はこの領域に部位特異的なアミノ酸置換を導入した。結果、フェニルアラニン、リシンが基質認識と触媒に寄与していることが判った。グリシンリッチ領域の特定残基がMPPの活性制御に関与している可能性がある。今後、これら変異体の機能とMPPの構造解析(現在進行中)の結果を照らし合わせて基質認識と切断機構を更に詳しく解明していきたい。
英文摘要
ミトコンドリアプロセシングペプチダーゼ(MPP)のサブユニット機能と分子認識機構を解明するため研究を実施した結果、本年度以下に示すいくつかの新しい知見を得た。(1) サブユニット協調的な基質認識モデルの提唱MPPの基質認識メカニズムの解明に向けて基質に蛍光基(プローブ)を導入、酵素複合体で高い親和性(解離定数、約0.1μM)を示した。このことから二つのサブユニットが協調的に基質を認識しているものと考えられる。更に基質の2箇所の塩基性アミノ酸のうち切断点から離れた部分をαが、近い部位をβが認識しているマルチサイト認識モデルを提唱(研究発表;小嶋)。このモデルはMPPへの部位特異的アミノ酸変異の研究結果を支持している。(2) MPPの部位特異的酸性アミノ酸の変異による基質認識部位、触媒残基の同定と解析部位特異的アミノ酸変異から、基質の塩基性アミノ酸の認識に重要な酸性アミノ酸をαサブユニットで同定した(研究発表;下方)。更にβサブユニットで基質切断反応に必須な金属結合残基、触媒残基を確認(研究発表;北田)。主にαが基質認識をβが触媒機能を持つと考えたれる。ただし、β単独では全く不活性であるため、αがβの活性を制御している可能性がある。このことは研究結果(3)と関連する。(3) αサブユニットのグリシンリッチ領域のMPP触媒機能における重要性を証明MPPに対しランダム変異を導入、機能欠損体を検索する実験結果から、αサブユニットのグリシンに富む領域(グリシンリッチ領域)が重要な役割を持っていることが示唆された。そこで、本年度はこの領域に部位特異的なアミノ酸置換を導入した。結果、フェニルアラニン、リシンが基質認識と触媒に寄与していることが判った。グリシンリッチ領域の特定残基がMPPの活性制御に関与している可能性がある。今後、これら変異体の機能とMPPの構造解析(現在進行中)の結果を照らし合わせて基質認識と切断機構を更に詳しく解明していきたい。
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下方国稔: "Role of α-Subunit of Mitochondrial Procesing Peptidase in Substrate Recognition" The Journal of Biological Chemistry. 273. 25158-25163 (1998)
Kunimoshi Shimogata:“线粒体加工肽酶的 α-亚基在底物识别中的作用”生物化学杂志 273。25158-25163 (1998)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
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通讯作者:
北田栄: "Glutamate Residues Required for Substrate Binding and Cleavage Activity in Mitochondrial Processing Peptidase" The Journal of Biological Chemistry. 273. 32547-32553 (1998)
Sakae Kitada:“线粒体加工肽酶中底物结合和切割活性所需的谷氨酸残基”生物化学杂志 273. 32547-32553 (1998)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
下方国稔: "Substrate Recognition by Mitochondrial Processing Peptidase toward the Malate Dehydrogenase Precursor" Journal of Biochemistry. 122. 1019-1023 (1997)
Kunimoshi Shimogata:“线粒体加工肽酶对苹果酸脱氢酶前体的底物识别”生物化学杂志 122. 1019-1023 (1997)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
小嶋克彦: "Cooperative Formation of Substrate-Binding Pocket by α- and β-subunits of Mitochondrial Processing Peptidase" The Journal of Biological Chemistry. 273. 32542-32546 (1998)
Katsuhiko Kojima:“线粒体加工肽酶的 α- 和 β- 亚基协同形成底物结合袋”《生物化学杂志》273. 32542-32546 (1998)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
伊藤明夫: "ミトコンドリア蛋白質のプロセシング" プロテオリシス、蛋白質核酸酵素. 42増刊. 2362-2367 (1997)
Akio Ito:“线粒体蛋白质的加工”,蛋白质核酸酶,42 特别版(1997 年)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
チューリンジェンシス菌からの新しい抗病原体活性物質の大規模検索とその作用
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批准号:25292052
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.07万
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财政年份:2013
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负责人:北田 栄
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依托单位:
チューリンジェンシス菌新規細胞毒素の挑戦的分子探索
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批准号:21658032
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2009
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负责人:北田 栄
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依托单位:
細胞毒素を利用した制がん研究への総合展開
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批准号:20011007
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.95万
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财政年份:2008
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负责人:北田 栄
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依托单位:
微生物毒素の生体膜侵入と複合体形成
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批准号:17053019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.73万
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财政年份:2005
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负责人:北田 栄
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依托单位:
微生物毒素による選択的細胞認識の分子機構
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批准号:16770077
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2004
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负责人:北田 栄
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依托单位:
ミトコンドリアからの情報発信(ミトコンドリアストレスに対する細胞応答)
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批准号:14658233
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2002
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负责人:北田 栄
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依托单位:
構造生物学に基づいたミトコンドリア標的化シグナル認識の分子メカニズム
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批准号:12780455
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:2000
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负责人:北田 栄
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依托单位:
海外基金