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病原性放線菌ノカルジア属菌の新種に関する研究

致病放线菌诺卡氏菌新种的研究

基本信息

批准号：
19924017
负责人：
矢澤勝清
金额：
$ 0.48万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19924017/
关键词：
分類ノカルジア新種

项目摘要

[研究目的]近年,16SrRNA遺伝子を指標とした再分類が盛んに行われ,細菌の新種が多数報告されている。申請者はノカルジアの再同定・再分類の研究遂行中,16SrRNA遺伝子の解析において新種と考えられる菌株が存在することを明らかにした。これら菌株についてDNA-DNAの相同性の検討および表現型質の相違について検討を行い,ノカルジアの新種の確立を行うことを目的とした。[研究方法]16SrRNA遺伝子の解析において新種と考えられたNocardia sp.IFM0349と16SrRNA遺伝子の系統樹において同一クラスターを形成したNocardia vinacea Type strain IFM10175の2菌株のDNAの精製を行い,ビオチン蛍光標識法によりDNA-DNA相同性の検討を行った。新種の確立に必要なアデニン等の有機物の分解,糖からの酸産生,有機酸の利用,ウレアーゼの産生,生育温度など生理生化学的性状の検討を行った。[研究結果]DNA-DNA相同性の検討の結果,新種と考えられたNocardia sp.IFM0349とNocardia vinacea Type strain IFM10175の相同性は65.34%および50.76%であった。この結果はDNA-DNA相同性の比較において同種と定義されている70%より低く遺伝子型においてはNocardia sp.IFM0349とNocardia vinaceaは別種でありNocardia sp.IFM0349は新種であった。両菌株における表現型の比較を行った結果,アデニン等の有機物の分解やウレアーゼの産生には違いがみられなかったが,アドニトール,ガラクトース,イノシトール,ソルビトールさらにマンニトールからの酸産生に違いがみられ,Nocardia sp.IFM0349は新種であることが明らかになった。

[Objective] In recent years, 16S rRNA gene index has been re-classified, and most new species of bacteria have been reported. In the process of identification and reclassification of 16S rRNA gene, the applicant has identified new species and strains. The identification of DNA-DNA and the identification of phenotypes of these strains are discussed in detail. The identification of new species is discussed in detail. [Methods] Analysis of 16S rRNA gene, identification of new species and phylogenetic tree of Nocardia sp.IFM0349 and 16S rRNA gene, DNA purification of Nocardia vinacea Type strain IFM10175 and DNA identification by light labeling. The decomposition of organic compounds, production of sugar and acid, utilization of organic acids, production of sugar and acid, and physiological and biochemical characteristics of growth temperature are discussed. [Results] The results of DNA-DNA identity analysis showed that the identity of Nocardia sp.IFM0349 and Nocardia vinacea Type strain IFM10175 was 65.34% and 50.76% respectively. The results showed that the comparison of DNA-DNA identity between Nocardia sp.IFM0349 and Nocardia vinacea was 70% lower than that between Nocardia sp.IFM0349 and Nocardia vinacea. As a result of the comparison of phenotypes of strains, the decomposition of organic compounds such as Nocardia sp.IFM0349 is a new species.