ミトコンドリアDNAから見たサシバ個体群の遺伝的構造と渡りの経路の関係について

从线粒体DNA看Sassiba种群的遗传结构与其迁徙路线的关系

• 批准号: 24924008
• 负责人: 長井 和哉
• 金额: $ 0.32万
• 依托单位: Iwate University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24924008/
• 关键词: サシバ; ミトコンドリアゲノム; 遺伝的多様性

サシバ(Butastur indicus)は繁殖するために日本へ飛来する夏鳥で,東南アジアで越冬する中型の猛禽類である.近年の環境変異に伴い生息数が著しく減少しているため,環境省鳥類レッドリストにより絶滅危惧II類(VU)に定められた.このことから,本種がどの様な遺伝的構造で生存しているのかという個体群間の遺伝的な関係についての調査・推定と,遺伝的多様性が低下している可能性があるため,遺伝的に均一になりつつあるのかといった遺伝的多様性について解析する必要性がある.本研究では,ミトコンドリアDNAの制御領域(Control Region)の塩基配列を元に,その塩基置換率を指標としてサシバ個体群の遺伝的構造と遺伝的多様性の解析を行うことを目的とし,日本各地に飛来し繁殖を行うサシバの羽毛からDNAを抽出し,PCR法によりミトコンドリアDNAのコントロール領域を増幅させ,ダイレクトシーケンス法により塩基配列の決定を行った.また,1個体において,本種のミトコンドリアDNAの全塩基配列を決定することが出来た.本種64個体で437塩基を決定したところ,20のハプロタイプが検出されたことから,本種の遺伝的多様性は現時点ではそれほど低下してはいないことが分かった.繁殖北限分布の岩手からは12個体から6のハプロタイプが検出され,北限分布でも十分に遺伝的多様性が保たれていることが分かった.また,全国的に検出されるハプロタイプと西日本でのみ検出されるハプロタイプがあり,これらのハプロタイプを系統解析,ネットワーク解析したところ,2つのグループに分かれる傾向にあることが分かった.西日本で特に日本海側で検出されることから,サシバの渡りのルートの差異に起因する可能性が仄めかされた.これを検証するため,今後さらにサンプル数を増やして解析することが必要であると考えられる.

A summer bird flies from Japan and a medium-sized raptor flies from the southeast. In recent years, the number of environmental changes has decreased, and the number of birds in the Ministry of Environment has decreased. The genetic structure of this species has been investigated and inferred, and the diversity of the heritages has been reduced. The diversity of the heritages has been reduced. The homogeneity of the heritages has been analyzed. This study is aimed at exploring the control of DNA in the field of gene expression.(Control Region) Genome Alignment, Genome Substitution Rate, Index of Genome Structure and Diversity Analysis of Genome Diversity of Individual Population, Target of Genome Diversity Analysis of Genome Substitution Analysis of Genome Diversity Analysis of Genome The method of determining the base alignment of the system is described below. In this case, the DNA sequence of this species is determined by DNA sequence. 64 individuals of this species were identified by 437 bases, 20 bases, and the diversity of this species was reversed to the present point. Iwate's northern limit distribution is 12 individuals, 6 individuals and 10 individuals. In addition to the above, the company also has the ability to conduct research and development on the basis of its own experience. West Japan, Japan Sea Side, Japan Sea Side The number of cases will increase in the future.

项目成果

ミトコンドリアDNAを用いたサシバの遺伝的多様性と遺伝的構造の解析

使用线粒体 DNA 分析牺牲物种的遗传多样性和遗传结构。

• 发表时间: 2012
• 作者: Ohno;G.;Ono;K.;Togo;M.;Watanabe;Y.;Ono;S.;Hagiwara;M.;Kuroyanagi;H.;渡邉要平;井上陽子;千崎康司;熊倉康郎;長井和哉
• 通讯作者: 長井和哉