NF1遺伝子のプロモーター部位の解析

NF1基因启动子位点分析

• 批准号: 08770685
• 负责人: 伊丹 聡巳
• 金额: $ 0.64万
• 依托单位: Jikei University School of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08770685/
• 关键词: NF1; PCR; SSCP

神経線維腫症1型(NF1)の責任遺伝子、NF1遺伝子の構造や機能について解析が進んでおり、現在NF1遺伝子には60のエクソンが確認されている。我々もPCR-SSCP法,direct sequence法を用いてNF1遺伝子の変異の検出を試みているが、今回はプロモーター部位について検索したいと考える。現在、NF1遺伝子のopen reading flameの上流約900bpの塩基配列が明らかにされ、そこにはTATA boxやCCAAT boxは見つかっておらず、転写活性化機能に関する詳しい検索は未だなされていない。まず、CAT assay,gel sift assay等により転写活性化能を持つ部位を明らかにする。次いでNF1患者DNAからプロモーター部位の変異を検索する。今回、我々はすでに20例のNF1患者について60エクソン全てのDNA変異の検索を行った結果、11例でdisease cousingと思われる変異を検出した。さらに、変異が検出されなかった残り9例を被験対象としてプロモーター部位の変異検索を行っている。すでに約900bpを3つの領域に分け、互いにオーバーラップするように三組のPCRプライマーを作成したので、これを使いPCR-SSCP法、size-shift assay,magnetic beadsを利用したdirect sequence法を用いて変異を検索している。

Neurovascular disease type 1 (NF-1) is responsible for gene, NF-1 gene structure and function analysis, now NF-1 gene 60 is confirmed. We use PCR-SSCP method,direct sequence method to detect NF1 gene diversity, and now we use PCR-SSCP method to detect NF1 gene diversity. Now, NF1 gene open reading flame upstream of about 900bp of the base array is clear, both TATA box and CCAAT box are visible, and the activation function is written in detail. For example, CAT assay,gel sift assay, etc. are used to describe the active energy holding position. NF1 patients 'DNA changes were detected at different sites. In this study, 20 patients with NF-1 were found to have 60 cases of complete DNA variation, and 11 cases of disease housing were found to have DNA variation. 9 cases of different parts of the body were detected by different methods. About 900bp in size, three sets of PCR were created using PCR-SSCP, size-shift assay,magnetic beads and direct sequence.